转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 20 / 138 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004695 Chr01 NC_080387.1:65017991-65018003promoter 内 1320-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 65009907-65015322(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488821-73488833promoter 内 3597-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 73489225-73490124(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCGTTGACTTCT
SmilChr01G001872 Chr01 NC_080387.1:33750113-33750125promoter 内 3503-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 33750611-33755923(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
SmilChr02G004407 Chr02 NC_080388.1:66389676-66389688promoter 内 3264-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 66390413-66392292(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACGAG
SmilChr01G004163 Chr01 NC_080387.1:60126303-60126315promoter 内 3248-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 60127056-60131519(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr01G005638 Chr01 NC_080387.1:72817861-72817873promoter 内 3240-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 72811430-72817112(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATT
SmilChr01G002454 Chr01 NC_080387.1:42143249-42143261promoter 内 3034-3046 bp - 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 42141328-42142294(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTAAA
SmilChr01G000966 Chr01 NC_080387.1:20502130-20502142promoter 内 2848-2860 bp + 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 20503283-20504971(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTTGG
SmilChr03G004157 Chr03 NC_080389.1:60342606-60342618promoter 内 2302-2314 bp - 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 60344305-60348450(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
SmilChr02G004406 Chr02 NC_080388.1:66389676-66389688promoter 内 1981-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 66385204-66387668(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACTATT
SmilChr02G000069 Chr02 NC_080388.1:880794-880806promoter 内 1425-1437 bp + 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 883370-884867(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
SmilChr01G004479 Chr01 NC_080387.1:62887314-62887326promoter 内 1242-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 62890073-62893796(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTTAA
SmilChr02G000838 Chr02 NC_080388.1:14210543-14210555promoter 内 850-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 14204480-14207404(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCTTTGACTATT
SmilChr01G000358 Chr01 NC_080387.1:7398334-7398346promoter 内 837-849 bp - 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 7392108-7395182(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTAAC
SmilChr03G000111 Chr03 NC_080389.1:1225783-1225795promoter 内 764-776 bp + 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 1229020-1261784(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
SmilChr01G004478 Chr01 NC_080387.1:62887314-62887326promoter 内 761-773 bp + 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 62878340-62884086(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACGTT
SmilChr02G000225 Chr02 NC_080388.1:2937164-2937176promoter 内 428-440 bp + 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 2940737-2943803(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
SmilChr02G001025 Chr02 NC_080388.1:18161444-18161456promoter 内 169-181 bp - 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 18157552-18157624(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTGAT
SmilChr02G000869 Chr02 NC_080388.1:14924434-14924446promoter 内 39-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 14928396-14936575(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTTCA
SmilChr01G004434 Chr01 NC_080387.1:62429492-62429504promoter 内 8-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 62433485-62434688(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAAGTCAACGGA
SmilChr02G001393 Chr02 NC_080388.1:26466757-26466769promoter 内 3941-3953 bp - 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 26466817-26470187(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACGAG
SmilChr01G002634 Chr01 NC_080387.1:44626668-44626680promoter 内 3815-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 44621596-44626494(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
SmilChr01G003095 Chr01 NC_080387.1:49778613-49778625promoter 内 3572-3584 bp + 417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 49776377-49778196(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
SmilChr01G005923 Chr01 NC_080387.1:75041898-75041910promoter 内 3341-3353 bp + 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 75042558-75043921(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
SmilChr03G003482 Chr03 NC_080389.1:53379494-53379506promoter 内 3005-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53375085-53378510(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTCTC
SmilChr02G005160 Chr02 NC_080388.1:72945791-72945803promoter 内 2840-2852 bp + 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 72946952-72949072(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACTTTG
SmilChr02G004074 Chr02 NC_080388.1:63027558-63027570promoter 内 2769-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 63028790-63037407(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr02G005479 Chr02 NC_080388.1:75005626-75005638promoter 内 2406-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 75007221-75009530(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTAAC
SmilChr02G003472 Chr02 NC_080388.1:56034132-56034144promoter 内 2138-2150 bp - 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 56029282-56032281(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr01G002480 Chr01 NC_080387.1:42537202-42537214promoter 内 2119-2131 bp - 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42534282-42535332(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr03G002061 Chr03 NC_080389.1:31398199-31398211promoter 内 1977-1989 bp - 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 31400223-31405967(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGCT
SmilChr02G003099 Chr02 NC_080388.1:51887042-51887054promoter 内 1804-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51889239-51889311(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACC
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19267949-19267961promoter 内 1715-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19261872-19265675(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGAGTCAACGCT
SmilChr01G001338 Chr01 NC_080387.1:26605963-26605975promoter 内 1507-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 26608457-26614485(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGCT
SmilChr02G003064 Chr02 NC_080388.1:51476802-51476814promoter 内 1427-1439 bp + 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51472108-51474240(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGCT
SmilChr03G002688 Chr03 NC_080389.1:42750673-42750685promoter 内 1316-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42753358-42757429(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
SmilChr02G003562 Chr02 NC_080388.1:56797667-56797679promoter 内 1279-1291 bp - 2710 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 56800389-56800970(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACGAG
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50145718-50145730promoter 内 1238-1250 bp - 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50141901-50142967(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACTTTT
SmilChr03G002676 Chr03 NC_080389.1:42475022-42475034promoter 内 1238-1250 bp - 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42477785-42481904(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCA
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SmilChr03G001412 Chr03 NC_080389.1:16779774-16779786promoter 内 1010-1022 bp - 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16782765-16785073(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGGT
SmilChr01G005922 Chr01 NC_080387.1:75041898-75041910promoter 内 995-1007 bp + 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 75037416-75038904(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGGT
SmilChr03G000571 Chr03 NC_080389.1:6223333-6223345promoter 内 686-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6217100-6220030(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
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SmilChr02G002557 Chr02 NC_080388.1:44470300-44470312promoter 内 428-440 bp + 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 44473873-44500678(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTATG
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SmilChr03G000861 Chr03 NC_080389.1:9823581-9823593promoter 内 124-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 9827458-9829853(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAGCT
SmilChr01G003301 Chr01 NC_080387.1:51700098-51700110promoter 内 566-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 51694329-51696675(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAAGTCAACGGT
SmilChr02G003733 Chr02 NC_080388.1:58969712-58969724promoter 内 3354-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 58964002-58969077(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTTTG