转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 21 / 151 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002252 Chr03 NC_080389.1:35447486-35447498promoter 内 2568-2580 bp - 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 35448919-35449000(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr02G001762 Chr02 NC_080388.1:32372404-32372416promoter 内 2408-2420 bp - 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 32370276-32370823(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCAAT
SmilChr01G000961 Chr01 NC_080387.1:20359734-20359746promoter 内 2301-2313 bp + 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 20355747-20358046(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr01G002349 Chr01 NC_080387.1:40643235-40643247promoter 内 2253-2265 bp - 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 40637857-40641499(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCGTA
SmilChr04G002481 Chr04 NC_080390.1:39662712-39662724promoter 内 2235-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 39659148-39660958(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGGC
SmilChr05G000196 Chr05 NC_080391.1:1559237-1559249promoter 内 2133-2145 bp + 1856 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 1556281-1557381(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr03G003299 Chr03 NC_080389.1:51097604-51097616promoter 内 2009-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 51099596-51100814(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTACC
SmilChr04G001563 Chr04 NC_080390.1:25944110-25944122promoter 内 1938-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 25941443-25942059(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTAGTAGGTAAA
SmilChr04G003710 Chr04 NC_080390.1:53423141-53423153promoter 内 1879-1891 bp - 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 53419778-53421031(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTGA
SmilChr04G003019 Chr04 NC_080390.1:46604545-46604557promoter 内 1740-1752 bp - 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 46601435-46602296(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACACC
SmilChr03G002289 Chr03 NC_080389.1:36078999-36079011promoter 内 1682-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 36072782-36076692(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr05G000198 Chr05 NC_080391.1:1559237-1559249promoter 内 1439-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 1561799-1566059(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACACC
SmilChr03G001346 Chr03 NC_080389.1:15714033-15714045promoter 内 1145-1157 bp + 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 15709870-15711189(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTGAC
SmilChr05G000195 Chr05 NC_080391.1:1559237-1559249promoter 内 927-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 1554790-1556175(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr04G000065 Chr04 NC_080390.1:586122-586134promoter 内 917-929 bp + 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 589206-590540(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTCC
SmilChr02G001764 Chr02 NC_080388.1:32372404-32372416promoter 内 699-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 32375706-32377534(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAC
SmilChr04G002509 Chr04 NC_080390.1:40070544-40070556promoter 内 603-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 40073942-40076409(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCGGTAGGTGAG
SmilChr01G002846 Chr01 NC_080387.1:47039029-47039041promoter 内 598-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 47030507-47035638(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTATC
SmilChr02G000132 Chr02 NC_080388.1:1807178-1807190promoter 内 448-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 1810731-1822372(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCGGTAGGTGAG
SmilChr01G004077 Chr01 NC_080387.1:59201107-59201119promoter 内 374-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 59204734-59207177(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCCCA
SmilChr01G002905 Chr01 NC_080387.1:47756596-47756608promoter 内 240-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 47750657-47752847(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr03G003944 Chr03 NC_080389.1:58520436-58520448promoter 内 230-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 58507257-58516677(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACATC
SmilChr03G000663 Chr03 NC_080389.1:7433204-7433216promoter 内 207-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 7436998-7438713(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTAAC
SmilChr01G001841 Chr01 NC_080387.1:33346265-33346277promoter 内 128-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 33350138-33352410(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATAGTAGGTAAA
SmilChr01G005043 Chr01 NC_080387.1:68354045-68354057promoter 内 2879-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 68355167-68358570(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGGC
SmilChr01G005042 Chr01 NC_080387.1:68354045-68354057promoter 内 639-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 68343649-68350695(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCATG
SmilChr01G001497 Chr01 NC_080387.1:28820918-28820930promoter 内 3741-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 28821178-28822257(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCTT
SmilChr03G000179 Chr03 NC_080389.1:1923136-1923148promoter 内 3697-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 1923440-2552598(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCT
SmilChr02G005490 Chr02 NC_080388.1:75072761-75072773promoter 内 3195-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 75070422-75071967(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr03G001051 Chr03 NC_080389.1:12235367-12235379promoter 内 2535-2547 bp + 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 12233248-12233913(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAAG
SmilChr03G000175 Chr03 NC_080389.1:1898987-1898999promoter 内 1049-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 1901939-1903356(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCT
SmilChr02G005491 Chr02 NC_080388.1:75072761-75072773promoter 内 858-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 75075904-75082376(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTGGA
SmilChr01G001693 Chr01 NC_080387.1:31147688-31147700promoter 内 3904-3916 bp + 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 31147785-31148333(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCTAG
SmilChr02G004523 Chr02 NC_080388.1:67806491-67806503promoter 内 3898-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 67804210-67806400(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCTT
SmilChr04G003466 Chr04 NC_080390.1:51144413-51144425promoter 内 3382-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 51145032-51148939(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGGC
SmilChr03G000173 Chr03 NC_080389.1:1898987-1898999promoter 内 3032-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 1899956-1900505(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCT
SmilChr05G000063 Chr05 NC_080391.1:304682-304694promoter 内 2960-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 305723-310058(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTGGTAGGTGGC
SmilChr02G002382 Chr02 NC_080388.1:41727310-41727322promoter 内 2877-2889 bp - 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 41720892-41726198(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACG
SmilChr03G000428 Chr03 NC_080389.1:4665659-4665671promoter 内 2682-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 4657135-4664352(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCT
SmilChr02G005489 Chr02 NC_080388.1:75072761-75072773promoter 内 1320-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 75065089-75070092(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr01G001692 Chr01 NC_080387.1:31147688-31147700promoter 内 281-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 31142274-31143980(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTAGG
SmilChr04G003726 Chr04 NC_080390.1:53594467-53594479promoter 内 3953-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 53590583-53594431(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr01G003412 Chr01 NC_080387.1:52779686-52779698promoter 内 3834-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 52779853-52783945(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCTT
SmilChr03G000566 Chr03 NC_080389.1:6176439-6176451promoter 内 3827-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 6176613-6177715(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCAGT
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SmilChr03G000430 Chr03 NC_080389.1:4668893-4668905promoter 内 3359-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4666578-4668263(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCCT
SmilChr02G001323 Chr02 NC_080388.1:24573071-24573083promoter 内 3209-3221 bp + 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 24573863-24575193(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACG
SmilChr01G001661 Chr01 NC_080387.1:30695031-30695043promoter 内 3174-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 30688649-30694216(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTAGG
SmilChr03G001970 Chr03 NC_080389.1:28379540-28379552promoter 内 3064-3076 bp - 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 28376639-28378615(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr03G001815 Chr03 NC_080389.1:24820321-24820333promoter 内 2922-2934 bp - 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 24821400-24833993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTGGA