转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 23 / 148 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000594 Chr04 NC_080390.1:6656057-6656070promoter 内 360-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 6651202-6652429(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr01G004035 Chr01 NC_080387.1:58770226-58770239promoter 内 343-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58773884-58775054(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56816769-56816782promoter 内 333-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 56820437-56822342(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr07G001777 Chr07 NC_080393.1:15063955-15063968promoter 内 274-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 15052678-15060241(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr04G002387 Chr04 NC_080390.1:38398486-38398499promoter 内 250-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38402237-38404081(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr02G001813 Chr02 NC_080388.1:32967183-32967196promoter 内 209-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 32970975-32982329(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr02G003224 Chr02 NC_080388.1:53489781-53489794promoter 内 206-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 53480965-53485999(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr02G000089 Chr02 NC_080388.1:1156487-1156500promoter 内 132-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1160356-1161657(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGTGACACGTGG
SmilChr02G000559 Chr02 NC_080388.1:7886443-7886456promoter 内 117-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 7879072-7882572(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr05G003362 Chr05 NC_080391.1:44430699-44430712promoter 内 99-112 bp + 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 44424122-44426810(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACCAT
SmilChr02G001689 Chr02 NC_080388.1:31141974-31141987promoter 内 28-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31133228-31138014(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGTGACACGTGG
SmilChr05G002696 Chr05 NC_080391.1:30829097-30829110promoter 内 3405-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 30829693-30831826(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATGACACGTGG
SmilChr03G003621 Chr03 NC_080389.1:54862212-54862225promoter 内 2827-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 54859913-54861051(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCAAGCCACGTGG
SmilChr02G000124 Chr02 NC_080388.1:1693335-1693348promoter 内 1998-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 1695338-1700632(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTTGAC
SmilChr03G003620 Chr03 NC_080389.1:54862212-54862225promoter 内 1548-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 54858763-54859772(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCAAGCCACGTGG
SmilChr03G003753 Chr03 NC_080389.1:56623120-56623133promoter 内 3794-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 56621086-56622926(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGGCTCACGTGA
SmilChr02G002052 Chr02 NC_080388.1:36931528-36931541promoter 内 2590-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 36932939-36935810(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGACACGTGG
SmilChr03G001554 Chr03 NC_080389.1:19582719-19582732promoter 内 2525-2538 bp + 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 19584195-19587310(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGACACGTGG
SmilChr01G002206 Chr01 NC_080387.1:38387936-38387949promoter 内 2405-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 38389532-38392060(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGACACGTGG
SmilChr06G000091 Chr06 NC_080392.1:658687-658700promoter 内 904-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 654629-655603(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCCATC
SmilChr05G004384 Chr05 NC_080391.1:57322635-57322648promoter 内 3938-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57322698-57323172(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGCAGCCACGTGG
SmilChr02G004391 Chr02 NC_080388.1:66257889-66257902promoter 内 3922-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 66257968-66258586(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCGAG
SmilChr05G003910 Chr05 NC_080391.1:52831463-52831476promoter 内 3903-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 52825024-52831378(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCACGCCACGTGG
SmilChr06G001079 Chr06 NC_080392.1:10748930-10748943promoter 内 3895-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10749036-10753217(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCACGCCACGTGG
SmilChr04G002094 Chr04 NC_080390.1:33766462-33766475promoter 内 3238-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 33767225-33771228(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCGTGTCACGTGG
SmilChr06G000930 Chr06 NC_080392.1:8826985-8826998promoter 内 2824-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 8828162-8829918(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTTTCG
SmilChr01G000522 Chr01 NC_080387.1:10657844-10657857promoter 内 2146-2159 bp - 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10659699-10665472(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCACC
SmilChr04G000819 Chr04 NC_080390.1:10276842-10276855promoter 内 1983-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10278860-10282884(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTC
SmilChr01G002495 Chr01 NC_080387.1:42714523-42714536promoter 内 1854-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 42711485-42712389(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGATGACACGTGG
SmilChr06G002418 Chr06 NC_080392.1:34927167-34927180promoter 内 1746-1759 bp + 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 34929422-34930033(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGTGGTCACGTGG
SmilChr04G000651 Chr04 NC_080390.1:7357899-7357912promoter 内 1517-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 7360383-7361896(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTC
SmilChr02G002348 Chr02 NC_080388.1:41258846-41258859promoter 内 1467-1480 bp - 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 41255458-41256325(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGATGACACGTGG
SmilChr01G001190 Chr01 NC_080387.1:24049304-24049317promoter 内 1454-1467 bp - 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 24051851-24054332(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAGCCC
SmilChr07G000076 Chr07 NC_080393.1:361554-361567promoter 内 1000-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 354747-358566(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGGGGGCACGTGG
SmilChr07G001056 Chr07 NC_080393.1:7707839-7707852promoter 内 957-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 7703301-7704808(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAAGGACACGTGG
SmilChr01G000067 Chr01 NC_080387.1:1108159-1108172promoter 内 680-693 bp - 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 1111480-1112546(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCACC
SmilChr01G001189 Chr01 NC_080387.1:24049304-24049317promoter 内 618-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 24044763-24045934(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGCTGCCACGTGG
SmilChr04G002250 Chr04 NC_080390.1:36439213-36439226promoter 内 347-360 bp + 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 36442867-36444456(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGATGACACGTGG
SmilChr01G000814 Chr01 NC_080387.1:17598947-17598960promoter 内 238-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 17594313-17595197(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAGCCC
SmilChr05G001049 Chr05 NC_080391.1:8696658-8696671promoter 内 214-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 8691529-8692884(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATTCA
SmilChr05G004383 Chr05 NC_080391.1:57322635-57322648promoter 内 133-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57310871-57318780(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTGCCC
SmilChr03G002117 Chr03 NC_080389.1:32917879-32917892promoter 内 3985-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 32916940-32917876(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCACC
SmilChr05G000289 Chr05 NC_080391.1:2219739-2219752promoter 内 3980-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 2219760-2223757(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATGACACGTGG
SmilChr07G003621 Chr07 NC_080393.1:42639868-42639881promoter 内 3970-3983 bp - 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 42639899-42640746(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCACC
SmilChr01G000318 Chr01 NC_080387.1:6173021-6173034promoter 内 3969-3982 bp - 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6173053-6173990(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCACC
SmilChr08G000941 Chr08 NC_080394.1:7003072-7003085promoter 内 3955-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 7003118-7007212(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGATGACACGTGG
SmilChr05G000288 Chr05 NC_080391.1:2219739-2219752promoter 内 3890-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 2214518-2219641(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATTCA
SmilChr01G001505 Chr01 NC_080387.1:28882062-28882075promoter 内 3654-3667 bp - 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 28882409-28888793(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCCGCT
SmilChr05G003445 Chr05 NC_080391.1:45821478-45821491promoter 内 3576-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 45819191-45821066(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATGACACGTGG
SmilChr01G002917 Chr01 NC_080387.1:47891058-47891071promoter 内 3346-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 47891713-47901820(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGTACACGTGG