转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003745; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007655-RA_Salv SmilChr04G003745 C2H2 XP_057809144.1 MP00416 TGTAGTAG

可能结合的靶基因

9716 个结合位点 6433 个候选靶基因 第 23 / 129 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001521 Chr02 NC_080388.1:28317056-28317063promoter 内 1680-1687 bp - 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 28319377-28325595(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr01G002052 Chr01 NC_080387.1:36325311-36325318promoter 内 1676-1683 bp - 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 36320151-36322993(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G004785 Chr01 NC_080387.1:66059978-66059985promoter 内 1668-1675 bp - 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 66062311-66064074(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G001246 Chr02 NC_080388.1:22902736-22902743promoter 内 1667-1674 bp + 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 22897350-22900409(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr01G003141 Chr01 NC_080387.1:50245128-50245135promoter 内 1666-1673 bp - 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 50247463-50250725(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr02G002650 Chr02 NC_080388.1:45919155-45919162promoter 内 1658-1665 bp - 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 45914689-45916819(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G006045 Chr01 NC_080387.1:75958265-75958272promoter 内 1652-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 75960614-75962698(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G002612 Chr02 NC_080388.1:45304503-45304510promoter 内 1651-1658 bp - 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 45306853-45307196(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G002013 Chr02 NC_080388.1:36274300-36274307promoter 内 1648-1655 bp - 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 36269054-36271954(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G006081 Chr01 NC_080387.1:76271115-76271122promoter 内 1645-1652 bp + 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 76273471-76278930(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G003349 Chr02 NC_080388.1:54685197-54685204promoter 内 1645-1652 bp + 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 54687553-54688263(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G000755 Chr02 NC_080388.1:12328283-12328290promoter 内 1643-1650 bp + 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 12304635-12325932(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G002886 Chr02 NC_080388.1:49159006-49159013promoter 内 1631-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 49161376-49163067(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G004298 Chr02 NC_080388.1:65350362-65350369promoter 内 1625-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 65344753-65347993(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr01G002636 Chr01 NC_080387.1:44638416-44638423promoter 内 1621-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 44640796-44644909(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G002605 Chr02 NC_080388.1:45195942-45195949promoter 内 1621-1628 bp - 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 45191483-45193569(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G003819 Chr02 NC_080388.1:59820131-59820138promoter 内 1620-1627 bp - 2374 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 59816543-59817757(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G004063 Chr01 NC_080387.1:59053243-59053250promoter 内 1618-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 59048029-59050867(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 AGTAGTAG
SmilChr02G004328 Chr02 NC_080388.1:65559589-65559596promoter 内 1616-1623 bp + 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 65561974-65565788(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 AGTAGTAG
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29624622-29624629promoter 内 1614-1621 bp - 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 29627009-29628114(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr02G001880 Chr02 NC_080388.1:34125789-34125796promoter 内 1613-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 34122199-34123408(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G004159 Chr01 NC_080387.1:60085236-60085243promoter 内 1612-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 60080427-60082854(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 AGTAGTAG
SmilChr01G004870 Chr01 NC_080387.1:66829330-66829337promoter 内 1608-1615 bp + 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 66825406-66826944(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr01G000607 Chr01 NC_080387.1:13460826-13460833promoter 内 1607-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 13458369-13458439(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 AGTAGTAG
SmilChr02G005205 Chr02 NC_080388.1:73291901-73291908promoter 内 1605-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 73294297-73298138(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr02G001842 Chr02 NC_080388.1:33621103-33621110promoter 内 1601-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 33615806-33618710(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G005589 Chr02 NC_080388.1:75677173-75677180promoter 内 1594-1601 bp - 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 75679580-75682317(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr01G004108 Chr01 NC_080387.1:59590117-59590124promoter 内 1589-1596 bp + 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 59592529-59599790(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G000403 Chr02 NC_080388.1:4996253-4996260promoter 内 1583-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 4998671-5001508(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G002716 Chr02 NC_080388.1:47006166-47006173promoter 内 1581-1588 bp - 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 47008586-47011369(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr01G000894 Chr01 NC_080387.1:18983750-18983757promoter 内 1576-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 18980595-18981332(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACT
SmilChr01G001159 Chr01 NC_080387.1:23566251-23566258promoter 内 1575-1582 bp - 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 23562783-23563832(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr01G001476 Chr01 NC_080387.1:28555101-28555108promoter 内 1573-1580 bp + 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 28551799-28552680(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
SmilChr02G002610 Chr02 NC_080388.1:45304503-45304510promoter 内 1572-1579 bp - 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 45300304-45302081(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 AGTAGTAG
SmilChr02G001832 Chr02 NC_080388.1:33338572-33338579promoter 内 1571-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 33341002-33345584(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAG
SmilChr02G000497 Chr02 NC_080388.1:6844116-6844123promoter 内 1569-1576 bp - 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 6846548-6849545(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 CTACTACA
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