转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 25 / 143 下载 TSV

上一页 25 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001521 Chr05 NC_080391.1:13936768-13936779promoter 内 465-476 bp - 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 13931869-13933243(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr03G001728 Chr03 NC_080389.1:23218977-23218988promoter 内 427-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 23222551-23224466(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGGA
SmilChr07G004661 Chr07 NC_080393.1:59513381-59513392promoter 内 328-339 bp + 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 59508488-59509719(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTC
SmilChr06G001241 Chr06 NC_080392.1:12793147-12793158promoter 内 326-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 12796822-12805597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G003868 Chr05 NC_080391.1:52278525-52278536promoter 内 182-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 52272332-52274717(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr06G001404 Chr06 NC_080392.1:14741379-14741390promoter 内 48-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 14745332-14749619(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr08G001310 Chr08 NC_080394.1:10443157-10443168promoter 内 3939-3950 bp - 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10443219-10443732(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr02G002356 Chr02 NC_080388.1:41345059-41345070promoter 内 3908-3919 bp + 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 41344284-41344977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAG
SmilChr02G000319 Chr02 NC_080388.1:4004759-4004770promoter 内 3897-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 4004863-4005674(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATC
SmilChr01G000953 Chr01 NC_080387.1:20171646-20171657promoter 内 3731-3742 bp + 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20171916-20171987(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATC
SmilChr01G000492 Chr01 NC_080387.1:9976097-9976108promoter 内 3672-3683 bp - 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9972478-9975779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr01G000733 Chr01 NC_080387.1:16293154-16293165promoter 内 3588-3599 bp - 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 16289859-16292752(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr05G001007 Chr05 NC_080391.1:8273624-8273635promoter 内 3554-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 8274071-8277762(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGGG
SmilChr05G003052 Chr05 NC_080391.1:38277235-38277246promoter 内 3517-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38276181-38276762(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAA
SmilChr05G001006 Chr05 NC_080391.1:8245867-8245878promoter 内 3464-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 8246404-8248998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGGG
SmilChr03G001099 Chr03 NC_080389.1:12666041-12666052promoter 内 3431-3442 bp + 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12664727-12665482(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAC
SmilChr05G002683 Chr05 NC_080391.1:30401397-30401408promoter 内 3328-3339 bp + 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30398950-30400735(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAG
SmilChr05G001483 Chr05 NC_080391.1:13603508-13603519promoter 内 3133-3144 bp - 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 13595297-13602651(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr01G001622 Chr01 NC_080387.1:30311291-30311302promoter 内 3004-3015 bp + 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30308143-30310305(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr04G002685 Chr04 NC_080390.1:42291490-42291501promoter 内 2883-2894 bp + 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42288245-42290383(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr04G002346 Chr04 NC_080390.1:37845363-37845374promoter 内 2736-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 37846628-37847842(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGC
SmilChr06G001698 Chr06 NC_080392.1:19490671-19490682promoter 内 2536-2547 bp + 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19487937-19489217(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAC
SmilChr03G001535 Chr03 NC_080389.1:19211981-19211992promoter 内 2445-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19213537-19214357(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATC
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36193702-36193713promoter 内 2394-2405 bp - 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 36195309-36197167(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCAA
SmilChr01G005015 Chr01 NC_080387.1:68161469-68161480promoter 内 2265-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 68156428-68159744(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGC
SmilChr04G001814 Chr04 NC_080390.1:29637571-29637582promoter 内 2199-2210 bp + 1791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 29639373-29642256(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGG
SmilChr02G001423 Chr02 NC_080388.1:26828147-26828158promoter 内 2178-2189 bp - 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26829970-26830536(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAA
SmilChr08G003067 Chr08 NC_080394.1:30865169-30865180promoter 内 2176-2187 bp - 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30859635-30863355(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr06G002237 Chr06 NC_080392.1:31637049-31637060promoter 内 2113-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31638937-31640624(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTT
SmilChr03G002249 Chr03 NC_080389.1:35419725-35419736promoter 内 1948-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35421778-35425099(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAA
SmilChr06G002290 Chr06 NC_080392.1:32919697-32919708promoter 内 1904-1915 bp + 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 32916812-32917611(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCC
SmilChr07G000163 Chr07 NC_080393.1:966828-966839promoter 内 1904-1915 bp - 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 968925-970815(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr07G002456 Chr07 NC_080393.1:23069639-23069650promoter 内 1819-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 23065884-23067468(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr04G002119 Chr04 NC_080390.1:34183728-34183739promoter 内 1715-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 34177739-34181453(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAG
SmilChr05G002666 Chr05 NC_080391.1:30160234-30160245promoter 内 1578-1589 bp - 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30154774-30157822(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAA
SmilChr01G005708 Chr01 NC_080387.1:73312962-73312973promoter 内 1425-1436 bp + 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 73315538-73316278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTT
SmilChr03G002965 Chr03 NC_080389.1:46395624-46395635promoter 内 1390-1401 bp - 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 46398235-46400041(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTC
SmilChr02G000630 Chr02 NC_080388.1:9513263-9513274promoter 内 1357-1368 bp + 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9504658-9510630(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr01G001623 Chr01 NC_080387.1:30311291-30311302promoter 内 1266-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30314026-30315456(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAA
SmilChr06G002236 Chr06 NC_080392.1:31637049-31637060promoter 内 1249-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31633406-31634308(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAC
SmilChr06G001997 Chr06 NC_080392.1:25463225-25463236promoter 内 1222-1233 bp + 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25466004-25468718(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGGG
SmilChr01G006043 Chr01 NC_080387.1:75953309-75953320promoter 内 1160-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75956150-75956609(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGT
SmilChr01G005525 Chr01 NC_080387.1:72122352-72122363promoter 内 1146-1157 bp + 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 72125207-72127564(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTT
SmilChr04G002686 Chr04 NC_080390.1:42291490-42291501promoter 内 923-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42294568-42297970(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAA
SmilChr01G000555 Chr01 NC_080387.1:11576765-11576776promoter 内 918-929 bp + 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 11571615-11573693(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCC
SmilChr06G001387 Chr06 NC_080392.1:14514600-14514611promoter 内 903-914 bp + 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14517698-14520503(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10349421-10349432promoter 内 886-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr04G001810 Chr04 NC_080390.1:29595905-29595916promoter 内 879-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 29583579-29592794(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGC
SmilChr03G002919 Chr03 NC_080389.1:45949687-45949698promoter 内 859-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 45940882-45946556(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCGG
SmilChr01G002607 Chr01 NC_080387.1:44253539-44253550promoter 内 858-869 bp - 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 44256682-44260723(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCAA