转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 26 / 134 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001603 Chr01 NC_080387.1:30195578-30195592promoter 内 3330-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 30196249-30197151(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATAATTACTTTC
SmilChr02G003767 Chr02 NC_080388.1:59374138-59374152promoter 内 3219-3233 bp + 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 59368358-59373370(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATATTT
SmilChr01G003412 Chr01 NC_080387.1:52778900-52778914promoter 内 3048-3062 bp + 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 52779853-52783945(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATGGG
SmilChr01G000290 Chr01 NC_080387.1:5677582-5677596promoter 内 2986-3000 bp - 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 5678597-5681222(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTATAATT
SmilChr01G000286 Chr01 NC_080387.1:5641234-5641248promoter 内 2892-2906 bp - 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 5636395-5640139(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATGGG
SmilChr01G002748 Chr01 NC_080387.1:45804998-45805012promoter 内 2828-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 45802255-45803839(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTGTT
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73172069-73172083promoter 内 2599-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 73168441-73170681(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAATAATGATGAG
SmilChr02G000213 Chr02 NC_080388.1:2765411-2765425promoter 内 2593-2607 bp + 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 2766819-2771340(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTATGTAATGATTAA
SmilChr01G003022 Chr01 NC_080387.1:49271746-49271760promoter 内 2592-2606 bp + 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 49273155-49275950(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAATAATGATGAG
SmilChr02G002631 Chr02 NC_080388.1:45690666-45690680promoter 内 2344-2358 bp - 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 45686958-45689023(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGGA
SmilChr02G000497 Chr02 NC_080388.1:6844690-6844704promoter 内 2143-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 6846548-6849545(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAGAATT
SmilChr02G002072 Chr02 NC_080388.1:37304669-37304683promoter 内 2105-2119 bp - 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 37306565-37312550(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATAAAT
SmilChr01G000515 Chr01 NC_080387.1:10579871-10579885promoter 内 1973-1987 bp + 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 10581899-10588912(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTATAATGATGAA
SmilChr01G001694 Chr01 NC_080387.1:31191947-31191961promoter 内 1873-1887 bp + 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 31194075-31199123(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGATATAATGATGAT
SmilChr01G005217 Chr01 NC_080387.1:69762795-69762809promoter 内 1671-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 69759952-69760479(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTATTC
SmilChr01G001445 Chr01 NC_080387.1:28141863-28141877promoter 内 1292-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 28144572-28148054(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAAATAATGATTAG
SmilChr02G004503 Chr02 NC_080388.1:67554858-67554872promoter 内 1268-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 67557591-67559294(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGGA
SmilChr02G003556 Chr02 NC_080388.1:56732381-56732395promoter 内 1215-1229 bp - 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56735167-56739212(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACAATA
SmilChr01G000116 Chr01 NC_080387.1:1983387-1983401promoter 内 1142-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1986246-1987674(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGATAATGATTAG
SmilChr02G003555 Chr02 NC_080388.1:56732381-56732395promoter 内 953-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56728232-56729347(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGTAATGATTGA
SmilChr02G003151 Chr02 NC_080388.1:52538446-52538460promoter 内 610-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 52541837-52543643(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAGTGATGATTAT
SmilChr02G003501 Chr02 NC_080388.1:56219181-56219195promoter 内 584-598 bp - 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56215152-56215778(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGTAATGATTGA
SmilChr01G001708 Chr01 NC_080387.1:31499133-31499147promoter 内 62-76 bp - 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 31503072-31504277(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATGTAT
SmilChr03G001184 Chr03 NC_080389.1:13607364-13607378promoter 内 3944-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13607421-13609139(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAACATAATGATGGG
SmilChr01G005359 Chr01 NC_080387.1:70810985-70810999promoter 内 3937-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 70809376-70810935(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATTTTT
SmilChr01G005597 Chr01 NC_080387.1:72589300-72589314promoter 内 3864-3878 bp + 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72585811-72589177(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATAAAT
SmilChr01G002425 Chr01 NC_080387.1:41768980-41768994promoter 内 3767-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 41763315-41768760(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAATTTT
SmilChr01G002851 Chr01 NC_080387.1:47088107-47088121promoter 内 3519-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47088589-47089658(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGCTAATGATGGG
SmilChr02G003028 Chr02 NC_080388.1:50994800-50994814promoter 内 3508-3522 bp + 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50995293-50996129(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTATAATGATTAT
SmilChr02G003155 Chr02 NC_080388.1:52608255-52608269promoter 内 3425-3439 bp - 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52600597-52607693(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTATAATGATTAT
SmilChr02G003156 Chr02 NC_080388.1:52608255-52608269promoter 内 3383-3397 bp - 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52607271-52607651(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTATAATGATTAT
SmilChr01G005210 Chr01 NC_080387.1:69733244-69733258promoter 内 3326-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 69733919-69734530(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAATACAATGATTAA
SmilChr01G005941 Chr01 NC_080387.1:75144796-75144810promoter 内 3279-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75145518-75148832(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATTATGATGATTAT
SmilChr01G005219 Chr01 NC_080387.1:69762795-69762809promoter 内 3202-3216 bp + 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 69763594-69764332(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAATACAATGATTAA
SmilChr02G002128 Chr02 NC_080388.1:38132910-38132924promoter 内 3098-3112 bp - 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 38127303-38132021(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATAACAATGATTAA
SmilChr02G003827 Chr02 NC_080388.1:59933201-59933215promoter 内 3096-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59934106-59935911(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATCTGC
SmilChr01G005940 Chr01 NC_080387.1:75144796-75144810promoter 内 3064-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75142748-75143873(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATAATC
SmilChr01G005987 Chr01 NC_080387.1:75498239-75498253promoter 内 2956-2970 bp + 1031 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75494137-75497208(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAAATTC
SmilChr01G002849 Chr01 NC_080387.1:47068848-47068862promoter 内 2919-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47059151-47067780(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTATCATTACATTT
SmilChr01G003175 Chr01 NC_080387.1:50555918-50555932promoter 内 2865-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50553129-50554796(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATGATGATTAG
SmilChr01G003599 Chr01 NC_080387.1:54549984-54549998promoter 内 2819-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54551166-54552791(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATGCAATGATTGA
SmilChr02G003157 Chr02 NC_080388.1:52608255-52608269promoter 内 2572-2586 bp - 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52609684-52612850(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATAAAT
SmilChr02G002854 Chr02 NC_080388.1:48748653-48748667promoter 内 2472-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 48750182-48753986(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCATCATTAGTATA
SmilChr02G002617 Chr02 NC_080388.1:45430209-45430223promoter 内 2441-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 45427269-45428663(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATTTTT
SmilChr02G002000 Chr02 NC_080388.1:36160615-36160629promoter 内 2371-2385 bp + 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36158124-36158999(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTACGCTA
SmilChr01G003530 Chr01 NC_080387.1:53926955-53926969promoter 内 2303-2317 bp + 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 53928653-53930473(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTGGTAATGATTGT
SmilChr01G001499 Chr01 NC_080387.1:28852144-28852158promoter 内 2283-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28848155-28850440(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATGGG
SmilChr03G002458 Chr03 NC_080389.1:38928230-38928244promoter 内 2280-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 38923962-38926523(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTGATAATGATGAT
SmilChr01G005208 Chr01 NC_080387.1:69733244-69733258promoter 内 2120-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 69730847-69731377(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTATTC
SmilChr01G002700 Chr01 NC_080387.1:45270474-45270488promoter 内 2095-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 45267047-45268582(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCAGTAATGATGAT