转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 3 / 128 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001131 Chr01 NC_080387.1:23003775-23003786promoter 内 1839-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 23005937-23007193(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr01G006043 Chr01 NC_080387.1:75953945-75953956promoter 内 1796-1807 bp + 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 75956150-75956609(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000047 Chr03 NC_080389.1:504401-504412promoter 内 1746-1757 bp - 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 499352-502157(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCA
SmilChr02G001336 Chr02 NC_080388.1:24829218-24829229promoter 内 1706-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 24831513-24832456(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000597 Chr03 NC_080389.1:6624325-6624336promoter 内 1694-1705 bp - 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 6620388-6622029(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr02G005228 Chr02 NC_080388.1:73486260-73486271promoter 内 1648-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 73479839-73483918(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr01G001574 Chr01 NC_080387.1:29784638-29784649promoter 内 1610-1621 bp - 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 29787029-29788408(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr02G004836 Chr02 NC_080388.1:70474495-70474506promoter 内 1575-1586 bp - 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 70476921-70489757(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr01G000417 Chr01 NC_080387.1:8436299-8436310promoter 内 1520-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 8432765-8433829(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr01G002808 Chr01 NC_080387.1:46625883-46625894promoter 内 1047-1058 bp + 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 46620761-46622940(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCT
SmilChr03G000341 Chr03 NC_080389.1:3876307-3876318promoter 内 1011-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 3871001-3873328(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr02G002266 Chr02 NC_080388.1:40111993-40112004promoter 内 999-1010 bp + 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 40114995-40118370(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1904793-1904804promoter 内 963-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000870 Chr03 NC_080389.1:9877575-9877586promoter 内 944-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 9880632-9885394(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr01G005654 Chr01 NC_080387.1:72906546-72906557promoter 内 656-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 72902302-72903212(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCT
SmilChr02G001456 Chr02 NC_080388.1:27241811-27241822promoter 内 618-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 27237585-27238439(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25921335-25921346promoter 内 616-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72598404-72598415promoter 内 550-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 72591050-72594964(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr01G000907 Chr01 NC_080387.1:19148438-19148449promoter 内 429-440 bp + 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 19142241-19144877(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr02G004242 Chr02 NC_080388.1:64615266-64615277promoter 内 370-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 64618897-64620145(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000216 Chr03 NC_080389.1:2510065-2510076promoter 内 233-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 2513833-2516724(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000631 Chr03 NC_080389.1:6958640-6958651promoter 内 11-22 bp + 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 6962630-6966190(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000632 Chr03 NC_080389.1:6964617-6964628promoter 内 11-22 bp + 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 6968607-6972166(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr03G000633 Chr03 NC_080389.1:6970593-6970604promoter 内 9-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 6974585-6978143(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCA
SmilChr01G005515 Chr01 NC_080387.1:71980759-71980770promoter 内 3813-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 6 71975466-71980582(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr02G001388 Chr02 NC_080388.1:26363997-26364008promoter 内 2287-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 26365711-26367457(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr01G002373 Chr01 NC_080387.1:40950477-40950488promoter 内 1823-1834 bp - 2167 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 40952655-40959050(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTT
SmilChr02G000775 Chr02 NC_080388.1:12725782-12725793promoter 内 1698-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 12722107-12723490(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G005285 Chr02 NC_080388.1:73887805-73887816promoter 内 1276-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 73883321-73885091(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr01G001691 Chr01 NC_080387.1:31141243-31141254promoter 内 3835-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 31139057-31141088(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr02G001386 Chr02 NC_080388.1:26363997-26364008promoter 内 3810-3821 bp + 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 26358554-26363817(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCT
SmilChr01G003073 Chr01 NC_080387.1:49573786-49573797promoter 内 3624-3635 bp - 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 49574163-49579321(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTT
SmilChr03G000077 Chr03 NC_080389.1:935003-935014promoter 内 3563-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 935441-943382(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTT
SmilChr01G002081 Chr01 NC_080387.1:36754657-36754668promoter 内 2289-2300 bp - 1701 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 36756369-36761002(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCT
SmilChr03G001727 Chr03 NC_080389.1:23223251-23223262promoter 内 1476-1487 bp - 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 23217959-23220737(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr02G003977 Chr02 NC_080388.1:62024296-62024307promoter 内 610-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 62027687-62032649(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr01G004727 Chr01 NC_080387.1:65455452-65455463promoter 内 399-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 65449517-65451861(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr01G003840 Chr01 NC_080387.1:56743599-56743610promoter 内 3191-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 56744409-56745452(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTT
SmilChr03G000211 Chr03 NC_080389.1:2453696-2453707promoter 内 3165-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 2454532-2455616(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr03G001819 Chr03 NC_080389.1:24849007-24849018promoter 内 3062-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 24846656-24848079(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr01G005414 Chr01 NC_080387.1:71369921-71369932promoter 内 2840-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 71366512-71368771(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G001859 Chr02 NC_080388.1:33789628-33789639promoter 内 2776-2787 bp + 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 33790853-33791013(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G001928 Chr02 NC_080388.1:34698294-34698305promoter 内 2772-2783 bp - 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 34696916-34697076(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G003106 Chr02 NC_080388.1:51982181-51982192promoter 内 2381-2392 bp + 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 51983801-52028202(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G000574 Chr02 NC_080388.1:8129520-8129531promoter 内 2285-2296 bp + 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 8131236-8133907(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr01G001242 Chr01 NC_080387.1:24915306-24915317promoter 内 2256-2267 bp - 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 24917051-24919720(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCT
SmilChr02G003458 Chr02 NC_080388.1:55873293-55873304promoter 内 2231-2242 bp - 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 55869100-55871534(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr02G004593 Chr02 NC_080388.1:68443576-68443587promoter 内 2221-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 68441736-68441807(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGA
SmilChr01G005399 Chr01 NC_080387.1:71252827-71252838promoter 内 2212-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 71254616-71256083(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA
SmilChr02G003539 Chr02 NC_080388.1:56526704-56526715promoter 内 2169-2180 bp + 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 56528536-56529231(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGA