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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003439; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005108-RA_Salv SmilChr03G003439 bHLH XP_057798243.1 MP00195 TTAGCAACTTGCAT

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 6878 个候选靶基因 第 33 / 138 下载 TSV

上一页 33 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003238 Chr01 NC_080387.1:51132024-51132037promoter 内 1955-1968 bp - 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 51127601-51129991(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TGCACAACTTGCAC
SmilChr02G003679 Chr02 NC_080388.1:58163587-58163600promoter 内 1693-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 58159880-58161292(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GCCCAAGTTGGACA
SmilChr02G002952 Chr02 NC_080388.1:50066813-50066826promoter 内 1606-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 50062262-50064431(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCTGCAACTTGGTT
SmilChr01G004618 Chr01 NC_080387.1:64206933-64206946promoter 内 1532-1545 bp - 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 64202602-64204477(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTCTCCACTTGCAA
SmilChr03G004041 Chr03 NC_080389.1:59414625-59414638promoter 内 1507-1520 bp - 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 59417119-59419256(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGTCAAGTTGCCAG
SmilChr03G003020 Chr03 NC_080389.1:47106856-47106869promoter 内 1493-1506 bp + 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 47109364-47111929(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTGGCAACTTGACT
SmilChr02G002906 Chr02 NC_080388.1:49371878-49371891promoter 内 1379-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 49374500-49376633(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCTGCAACTTGGTT
SmilChr01G000136 Chr01 NC_080387.1:2296680-2296693promoter 内 1331-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 2288363-2294023(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGTTGG
SmilChr03G000052 Chr03 NC_080389.1:522339-522352promoter 内 1199-1212 bp - 2789 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 517600-519550(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTGGCAACTTGACT
SmilChr02G000836 Chr02 NC_080388.1:14200269-14200282promoter 内 1149-1162 bp + 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 14194506-14197430(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGGCAAGTTGTCTT
SmilChr03G002512 Chr03 NC_080389.1:39990013-39990026promoter 内 1120-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 39982391-39987145(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTACCAACTTGTCC
SmilChr01G001132 Chr01 NC_080387.1:23006218-23006231promoter 内 595-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 23009624-23010725(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TGACAAGTTGGACA
SmilChr01G005148 Chr01 NC_080387.1:69262530-69262543promoter 内 568-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 69257401-69259110(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGAACAACTTGCAT
SmilChr01G001315 Chr01 NC_080387.1:26142152-26142165promoter 内 279-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 26137011-26138443(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGTTGG
SmilChr01G005273 Chr01 NC_080387.1:70157011-70157024promoter 内 261-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 70160751-70163867(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTCCAAGTTGCACC
SmilChr02G001375 Chr02 NC_080388.1:25992717-25992730promoter 内 251-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 25996467-25999489(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGGCAAGTTGAATG
SmilChr03G003569 Chr03 NC_080389.1:54344923-54344936promoter 内 39-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 54340606-54340974(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTGGCAACTTGACT
SmilChr03G002308 Chr03 NC_080389.1:36320536-36320549promoter 内 25-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 36324512-36325149(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGTTGG
SmilChr01G003399 Chr01 NC_080387.1:52700252-52700265promoter 内 3967-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52698126-52700231(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTCCAAGTTGCTGG
SmilChr01G002546 Chr01 NC_080387.1:43555132-43555145promoter 内 3930-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 43555203-43557647(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GGCCAAGTTGTTGA
SmilChr01G003239 Chr01 NC_080387.1:51132024-51132037promoter 内 3605-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 51132420-51135151(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTGCAAGTTGTGCA
SmilChr03G003963 Chr03 NC_080389.1:58676295-58676308promoter 内 3579-3592 bp + 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 58676717-58685649(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TAAACAACTTGCAC
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SmilChr01G005107 Chr01 NC_080387.1:68858028-68858041promoter 内 3443-3456 bp - 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 68855458-68857483(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTGACAACTTGCGA
SmilChr02G002479 Chr02 NC_080388.1:43173907-43173920promoter 内 3292-3305 bp - 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 43174616-43177389(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CGTCAAGTTGCCCG
SmilChr02G000148 Chr02 NC_080388.1:1979680-1979693promoter 内 3241-3254 bp + 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1980440-1981591(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACTTCAACTTGCAA
SmilChr02G000557 Chr02 NC_080388.1:7866169-7866182promoter 内 3203-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 7862719-7865384(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCAACAACTTGCTC
SmilChr02G003756 Chr02 NC_080388.1:59216913-59216926promoter 内 3161-3174 bp - 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59217753-59219222(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATCCAAGTTGCAAC
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72529237-72529250promoter 内 3137-3150 bp - 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGTGCAACTTGTCA
SmilChr01G002381 Chr01 NC_080387.1:41014043-41014056promoter 内 3093-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 41006914-41013148(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTTCAAGTTGCAGA
SmilChr02G004485 Chr02 NC_080388.1:67322227-67322240promoter 内 3003-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 67320603-67321242(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TGATCAACTTGTCT
SmilChr01G005741 Chr01 NC_080387.1:73518615-73518628promoter 内 2798-2811 bp - 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 73519818-73521001(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAGCAAGTTGACGT
SmilChr03G002027 Chr03 NC_080389.1:30397887-30397900promoter 内 2598-2611 bp - 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 30399290-30401540(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGTTGG
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470056-72470069promoter 内 2196-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 72465758-72468264(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAATCCACTTGCAA
SmilChr03G001527 Chr03 NC_080389.1:19024868-19024881promoter 内 2143-2156 bp + 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 19026726-19029658(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCAACAACTTGCTC
SmilChr01G005489 Chr01 NC_080387.1:71831811-71831824promoter 内 2088-2101 bp + 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 71825897-71829911(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTTCAAGTTGCAGA
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SmilChr02G004165 Chr02 NC_080388.1:63966700-63966713promoter 内 1955-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 63968746-63970278(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTAGCAACTTGGGT
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SmilChr01G005569 Chr01 NC_080387.1:72529237-72529250promoter 内 1872-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 72469292-72527121(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGTGCAACTTGTCA
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SmilChr03G001430 Chr03 NC_080389.1:16970064-16970077promoter 内 1724-1737 bp + 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 16966140-16967800(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACTCAAGTTGCCCC
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SmilChr01G005508 Chr01 NC_080387.1:71937240-71937253promoter 内 1704-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 71939537-71944581(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGCTCAACTTGCAC
SmilChr03G001625 Chr03 NC_080389.1:20880669-20880682promoter 内 1699-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 20875128-20878380(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCAACAACTTGCTC