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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 34 / 151 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002582 Chr01 NC_080387.1:43957354-43957366promoter 内 2628-2640 bp + 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 43953659-43955993(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAA
SmilChr03G003046 Chr03 NC_080389.1:47361334-47361346promoter 内 2597-2609 bp + 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 47362738-47373446(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCCA
SmilChr03G000687 Chr03 NC_080389.1:7677904-7677916promoter 内 2411-2423 bp - 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7679494-7680619(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCGGGTAGGTAAG
SmilChr01G004766 Chr01 NC_080387.1:65855365-65855377promoter 内 2318-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 65849300-65853694(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAAGTAGGTAAG
SmilChr01G001061 Chr01 NC_080387.1:21923018-21923030promoter 内 2271-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 21924748-21926213(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATACT
SmilChr05G001930 Chr05 NC_080391.1:19640558-19640570promoter 内 2240-2252 bp - 1749 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19635051-19638809(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATACT
SmilChr01G000663 Chr01 NC_080387.1:14778020-14778032promoter 内 2171-2183 bp + 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14773813-14776202(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGCG
SmilChr01G000664 Chr01 NC_080387.1:14778020-14778032promoter 内 2161-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14779860-14782457(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCACCTACCCAC
SmilChr03G003668 Chr03 NC_080389.1:55525294-55525306promoter 内 2022-2034 bp - 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 55520296-55523327(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCCA
SmilChr02G000595 Chr02 NC_080388.1:8582700-8582712promoter 内 1907-1919 bp - 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 8584794-8585920(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTAAA
SmilChr03G001181 Chr03 NC_080389.1:13562716-13562728promoter 内 1804-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 13557593-13560531(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTACA
SmilChr01G002222 Chr01 NC_080387.1:38657503-38657515promoter 内 1800-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 38659704-38661064(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTAAT
SmilChr01G000204 Chr01 NC_080387.1:3520316-3520328promoter 内 1514-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3514613-3517841(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAAGTAGGTAGA
SmilChr04G000209 Chr04 NC_080390.1:1859907-1859919promoter 内 1385-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1862523-1862596(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATAGTAGGTAGA
SmilChr01G002337 Chr01 NC_080387.1:40555146-40555158promoter 内 1365-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40547927-40552522(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAA
SmilChr03G003951 Chr03 NC_080389.1:58569172-58569184promoter 内 1349-1361 bp + 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58571824-58575211(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATATT
SmilChr03G000620 Chr03 NC_080389.1:6821751-6821763promoter 内 1340-1352 bp - 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6824412-6832511(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTACA
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SmilChr04G003659 Chr04 NC_080390.1:53072558-53072570promoter 内 1196-1208 bp - 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53066733-53069765(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACCCA
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SmilChr01G005781 Chr01 NC_080387.1:73927333-73927345promoter 内 988-1000 bp - 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73921078-73924332(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACGTT
SmilChr01G005782 Chr01 NC_080387.1:73931205-73931217promoter 内 980-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73924827-73928196(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACGTT
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SmilChr04G003660 Chr04 NC_080390.1:53072558-53072570promoter 内 155-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53076404-53079764(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGTTAGGTAAA
SmilChr03G001867 Chr03 NC_080389.1:25818007-25818019promoter 内 120-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25821888-25823864(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGAGTAGGTAAA
SmilChr01G002338 Chr01 NC_080387.1:40555146-40555158promoter 内 45-57 bp - 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40549208-40551202(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAA
SmilChr04G003502 Chr04 NC_080390.1:51425592-51425604promoter 内 1215-1227 bp - 2774 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 51421059-51422818(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTTC
SmilChr02G002889 Chr02 NC_080388.1:49186953-49186965promoter 内 3076-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 49185492-49186040(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGGTAGGTAAA
SmilChr04G000472 Chr04 NC_080390.1:5035360-5035372promoter 内 2868-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 5030402-5034239(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGGGTAGGTGGT
SmilChr04G000912 Chr04 NC_080390.1:11868082-11868094promoter 内 1341-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 11858716-11865434(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGGGTAGGTGGT
SmilChr04G000511 Chr04 NC_080390.1:5603461-5603473promoter 内 3824-3836 bp + 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 5603638-5604871(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTTT
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SmilChr04G004131 Chr04 NC_080390.1:56132690-56132702promoter 内 2944-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 56133747-56135357(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCCCC
SmilChr01G004643 Chr01 NC_080387.1:64462731-64462743promoter 内 2254-2266 bp + 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 64464478-64469989(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCCTC
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SmilChr04G000218 Chr04 NC_080390.1:1904846-1904858promoter 内 2092-2104 bp + 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1906755-1907337(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTTC
SmilChr02G004973 Chr02 NC_080388.1:71620798-71620810promoter 内 2028-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 71622771-71626876(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTGCA
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SmilChr04G002437 Chr04 NC_080390.1:39042301-39042313promoter 内 1836-1848 bp + 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 39035854-39040148(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGGTAGGTAAA
SmilChr01G004862 Chr01 NC_080387.1:66765292-66765304promoter 内 1703-1715 bp - 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 66758287-66763006(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTTC
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SmilChr03G002519 Chr03 NC_080389.1:40154784-40154796promoter 内 1341-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 40137796-40152136(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACAGTAGGTAAG
SmilChr02G005256 Chr02 NC_080388.1:73666361-73666373promoter 内 1095-1107 bp - 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 73663374-73663467(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCTCT
SmilChr03G002111 Chr03 NC_080389.1:32861897-32861909promoter 内 1055-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 32855774-32858963(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCAGTAGGTAGA
SmilChr03G004252 Chr03 NC_080389.1:60992370-60992382promoter 内 1036-1048 bp - 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 60995335-61000124(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAATTAGGTAAA