转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 34 / 149 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002393 Chr02 NC_080388.1:41841575-41841585promoter 内 2066-2076 bp + 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 41838295-41839650(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr04G002289 Chr04 NC_080390.1:37169212-37169222promoter 内 1964-1974 bp - 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 37171249-37172985(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr05G000580 Chr05 NC_080391.1:4364485-4364495promoter 内 1931-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 4366555-4369647(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAGGCTGTCA
SmilChr07G002581 Chr07 NC_080393.1:24696529-24696539promoter 内 1884-1894 bp + 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 24698646-24700256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr01G005303 Chr01 NC_080387.1:70303299-70303309promoter 内 1751-1761 bp + 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 70305549-70306130(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCG
SmilChr06G003004 Chr06 NC_080392.1:42912621-42912631promoter 内 1748-1758 bp - 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 42902035-42910378(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCT
SmilChr04G002475 Chr04 NC_080390.1:39545070-39545080promoter 内 1699-1709 bp + 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 39547372-39550843(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr03G001152 Chr03 NC_080389.1:13309831-13309841promoter 内 1621-1631 bp + 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 13305279-13307461(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr02G001510 Chr02 NC_080388.1:28111234-28111244promoter 内 1578-1588 bp - 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28113657-28117648(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr01G005140 Chr01 NC_080387.1:69171795-69171805promoter 内 1569-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 69174227-69175474(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAA
SmilChr06G000757 Chr06 NC_080392.1:7027627-7027637promoter 内 1542-1552 bp + 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 7022721-7025178(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr05G000469 Chr05 NC_080391.1:3549103-3549113promoter 内 1434-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3544513-3546546(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr07G003103 Chr07 NC_080393.1:32866886-32866896promoter 内 1272-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32861194-32864167(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr05G001897 Chr05 NC_080391.1:19267036-19267046promoter 内 1239-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 19269798-19271538(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr03G001307 Chr03 NC_080389.1:15335813-15335823promoter 内 1235-1245 bp - 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15330344-15333057(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr06G000243 Chr06 NC_080392.1:1627201-1627211promoter 内 1213-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1620473-1624423(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCA
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48034399-48034409promoter 内 1167-1177 bp - 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr02G002298 Chr02 NC_080388.1:40556869-40556879promoter 内 1061-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40559809-40561749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCT
SmilChr04G002501 Chr04 NC_080390.1:39959772-39959782promoter 内 860-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 39962913-39966362(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr03G000205 Chr03 NC_080389.1:2358733-2358743promoter 内 850-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2361884-2363159(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr07G001945 Chr07 NC_080393.1:16874985-16874995promoter 内 786-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 16869748-16871780(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAA
SmilChr03G002001 Chr03 NC_080389.1:29775343-29775353promoter 内 760-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29770411-29772112(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr03G002016 Chr03 NC_080389.1:30099488-30099498promoter 内 678-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30095714-30096175(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr01G004955 Chr01 NC_080387.1:67644012-67644022promoter 内 675-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 67638247-67640696(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCG
SmilChr02G001391 Chr02 NC_080388.1:26408958-26408968promoter 内 653-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 26402064-26405620(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCT
SmilChr02G001572 Chr02 NC_080388.1:29145019-29145029promoter 内 635-645 bp - 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29148385-29153062(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr03G003460 Chr03 NC_080389.1:52975705-52975715promoter 内 595-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 52979111-52984837(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr03G001121 Chr03 NC_080389.1:12921303-12921313promoter 内 535-545 bp - 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 12913771-12917847(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTCT
SmilChr05G004077 Chr05 NC_080391.1:54652364-54652374promoter 内 495-505 bp + 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 54647293-54648868(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr01G004802 Chr01 NC_080387.1:66230951-66230961promoter 内 470-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 66234482-66236984(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr02G005082 Chr02 NC_080388.1:72458850-72458860promoter 内 463-473 bp + 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 72451388-72455322(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr01G000203 Chr01 NC_080387.1:3479666-3479676promoter 内 358-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3483309-3484678(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr01G005138 Chr01 NC_080387.1:69171795-69171805promoter 内 275-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 69164447-69168079(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr02G003030 Chr02 NC_080388.1:51002340-51002350promoter 内 235-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51006106-51006841(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGC
SmilChr07G001856 Chr07 NC_080393.1:16094485-16094495promoter 内 186-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 16088024-16090680(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTGA
SmilChr03G002015 Chr03 NC_080389.1:30099488-30099498promoter 内 183-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30094670-30095680(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr04G004102 Chr04 NC_080390.1:55996532-55996542promoter 内 155-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55987179-55992696(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAGGCTGTCA
SmilChr03G001590 Chr03 NC_080389.1:20160723-20160733promoter 内 123-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 20164601-20166011(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCG
SmilChr07G001304 Chr07 NC_080393.1:10028193-10028203promoter 内 91-101 bp - 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 10019030-10024293(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCA
SmilChr05G001585 Chr05 NC_080391.1:14566189-14566199promoter 内 2458-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 5 14563514-14564656(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G001586 Chr05 NC_080391.1:14566189-14566199promoter 内 685-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 5 14569505-14571332(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr03G000556 Chr03 NC_080389.1:6014883-6014893promoter 内 3902-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 6014982-6020144(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr05G001596 Chr05 NC_080391.1:14668530-14668540promoter 内 3670-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 14668861-14673370(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G001759 Chr05 NC_080391.1:17302876-17302886promoter 内 3603-3613 bp + 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 17301065-17302488(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G000134 Chr03 NC_080389.1:1473791-1473801promoter 内 3330-3340 bp - 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 1474462-1475690(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGG
SmilChr05G001584 Chr05 NC_080391.1:14545813-14545823promoter 内 2460-2470 bp + 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 14543140-14544282(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G001760 Chr05 NC_080391.1:17302876-17302886promoter 内 766-776 bp + 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 17306111-17308162(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr01G001928 Chr01 NC_080387.1:34451456-34451466promoter 内 3885-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 34449221-34451350(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr01G004691 Chr01 NC_080387.1:64967498-64967508promoter 内 3814-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 64965598-64967321(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G002855 Chr05 NC_080391.1:34048908-34048918promoter 内 3607-3617 bp - 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 34049302-34051225(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA