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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 40 / 136 下载 TSV

上一页 40 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000679 Chr01 NC_080387.1:14998704-14998714promoter 内 3600-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14999105-15003423(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTG
SmilChr05G000877 Chr05 NC_080391.1:6963384-6963394promoter 内 3588-3598 bp - 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 6963797-6969234(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCT
SmilChr07G004687 Chr07 NC_080393.1:59813733-59813743promoter 内 3569-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 59810896-59813311(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGT
SmilChr06G002107 Chr06 NC_080392.1:28149107-28149117promoter 内 3525-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 28147321-28148641(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr06G002108 Chr06 NC_080392.1:28158488-28158498promoter 内 3525-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 28156702-28158022(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr03G002590 Chr03 NC_080389.1:41216374-41216384promoter 内 3414-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 41212251-41215797(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAG
SmilChr06G002106 Chr06 NC_080392.1:28139723-28139733promoter 内 3348-3358 bp + 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 28137937-28139080(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr01G000439 Chr01 NC_080387.1:8801637-8801647promoter 内 3241-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 8800797-8800887(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCC
SmilChr06G000290 Chr06 NC_080392.1:2000770-2000780promoter 内 3138-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2001633-2006170(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr05G001797 Chr05 NC_080391.1:17720651-17720661promoter 内 2985-2995 bp - 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 17715703-17719645(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr02G000658 Chr02 NC_080388.1:9989104-9989114promoter 内 2944-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9986786-9988057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTG
SmilChr02G004394 Chr02 NC_080388.1:66298150-66298160promoter 内 2793-2803 bp + 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 66294410-66296952(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCT
SmilChr03G001724 Chr03 NC_080389.1:23133898-23133908promoter 内 2768-2778 bp + 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 23135131-23141677(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCAGCGCG
SmilChr03G001330 Chr03 NC_080389.1:15545873-15545883promoter 内 2762-2772 bp + 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15544519-15544644(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTA
SmilChr08G001267 Chr08 NC_080394.1:10066086-10066096promoter 内 2690-2700 bp - 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 10063187-10064785(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr03G001915 Chr03 NC_080389.1:26801030-26801040promoter 内 2581-2591 bp - 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26802450-26806550(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCC
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SmilChr01G005690 Chr01 NC_080387.1:73187136-73187146promoter 内 2489-2499 bp + 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 73184226-73185634(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCC
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SmilChr05G004104 Chr05 NC_080391.1:54905136-54905146promoter 内 2457-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 54899396-54903602(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCAGCGCG
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SmilChr03G001331 Chr03 NC_080389.1:15545873-15545883promoter 内 2394-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15547480-15549833(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGG
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SmilChr02G003895 Chr02 NC_080388.1:61044419-61044429promoter 内 2349-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 61046071-61049536(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr05G003093 Chr05 NC_080391.1:39241583-39241593promoter 内 2338-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 39234854-39239930(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr06G002221 Chr06 NC_080392.1:31183032-31183042promoter 内 2306-2316 bp - 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 31184727-31188274(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTG
SmilChr05G000278 Chr05 NC_080391.1:2162225-2162235promoter 内 2276-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2163950-2167847(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr01G005148 Chr01 NC_080387.1:69260838-69260848promoter 内 2263-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 69257401-69259110(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGG
SmilChr08G004880 Chr08 NC_080394.1:57900904-57900914promoter 内 2241-2251 bp - 1750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57902664-57905565(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCC
SmilChr08G001401 Chr08 NC_080394.1:11221594-11221604promoter 内 2106-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 11216003-11219709(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr06G003040 Chr06 NC_080392.1:43256680-43256690promoter 内 2039-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 43258642-43259893(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGT
SmilChr04G001852 Chr04 NC_080390.1:30175885-30175895promoter 内 1849-1859 bp - 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 30178037-30178489(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCC
SmilChr07G002437 Chr07 NC_080393.1:22783066-22783076promoter 内 1784-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22785283-22786216(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAG
SmilChr08G002741 Chr08 NC_080394.1:27022121-27022131promoter 内 1775-1785 bp + 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27017783-27019905(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTA
SmilChr05G001477 Chr05 NC_080391.1:13552254-13552264promoter 内 1745-1755 bp - 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13540999-13550008(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCAGCGCG
SmilChr07G001460 Chr07 NC_080393.1:11440861-11440871promoter 内 1590-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 11435569-11438460(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCA
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SmilChr02G005273 Chr02 NC_080388.1:73809972-73809982promoter 内 1436-1446 bp + 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 73812537-73813490(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGCC
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SmilChr03G001463 Chr03 NC_080389.1:17486707-17486717promoter 内 1400-1410 bp + 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 17489308-17493704(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGT
SmilChr08G002742 Chr08 NC_080394.1:27022121-27022131promoter 内 1172-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27024950-27028113(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGCC
SmilChr01G000691 Chr01 NC_080387.1:15478799-15478809promoter 内 1071-1081 bp - 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15472186-15475879(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr05G000838 Chr05 NC_080391.1:6611906-6611916promoter 内 978-988 bp - 3013 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 6614929-6633581(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCT
SmilChr08G002802 Chr08 NC_080394.1:27786920-27786930promoter 内 919-929 bp + 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27781298-27783848(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTG
SmilChr06G002229 Chr06 NC_080392.1:31504066-31504076promoter 内 844-854 bp - 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 31507223-31510344(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTG
SmilChr05G002593 Chr05 NC_080391.1:29159318-29159328promoter 内 817-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 29162502-29165709(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCT
SmilChr03G001788 Chr03 NC_080389.1:24428141-24428151promoter 内 737-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24422338-24424887(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAC
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SmilChr06G002067 Chr06 NC_080392.1:27236899-27236909promoter 内 615-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27230396-27233523(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCT
SmilChr01G001725 Chr01 NC_080387.1:31778529-31778539promoter 内 579-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 31781951-31786771(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCAGCGCG