转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 40 / 139 下载 TSV

上一页 40 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003805 Chr02 NC_080388.1:59672270-59672281promoter 内 1564-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 59667575-59669844(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGC
SmilChr01G001016 Chr01 NC_080387.1:21332343-21332354promoter 内 1503-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 21322126-21329856(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr01G005881 Chr01 NC_080387.1:74746845-74746856promoter 内 1418-1429 bp - 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 74743185-74744273(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGC
SmilChr04G001289 Chr04 NC_080390.1:20563889-20563900promoter 内 1414-1425 bp - 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 20566476-20567639(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATC
SmilChr04G000597 Chr04 NC_080390.1:6721899-6721910promoter 内 1413-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 6715491-6719322(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr02G003483 Chr02 NC_080388.1:56107496-56107507promoter 内 1241-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56096161-56104747(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGGG
SmilChr01G001914 Chr01 NC_080387.1:34277304-34277315promoter 内 1206-1217 bp - 2784 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 34280099-34282089(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr02G000419 Chr02 NC_080388.1:5324289-5324300promoter 内 1196-1207 bp + 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 5319783-5321495(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCC
SmilChr04G002334 Chr04 NC_080390.1:37671226-37671237promoter 内 1190-1201 bp - 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 37674037-37674732(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCC
SmilChr01G001870 Chr01 NC_080387.1:33688334-33688345promoter 内 1170-1181 bp - 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33691165-33693111(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr04G002916 Chr04 NC_080390.1:45362398-45362409promoter 内 1150-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45352813-45359558(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGC
SmilChr02G003571 Chr02 NC_080388.1:56870730-56870741promoter 内 1147-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56873584-56873690(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr01G004974 Chr01 NC_080387.1:67819588-67819599promoter 内 1091-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 67822498-67823169(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGGG
SmilChr03G004164 Chr03 NC_080389.1:60404587-60404598promoter 内 1088-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 60407500-60411093(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGACC
SmilChr04G000806 Chr04 NC_080390.1:9970320-9970331promoter 内 1075-1086 bp + 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 9964424-9967405(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr03G003103 Chr03 NC_080389.1:48133002-48133013promoter 内 1073-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 48135930-48142430(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr01G003487 Chr01 NC_080387.1:53424565-53424576promoter 内 1006-1017 bp + 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 53418370-53421581(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr03G003348 Chr03 NC_080389.1:51822807-51822818promoter 内 743-754 bp + 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51818628-51819560(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCC
SmilChr01G002687 Chr01 NC_080387.1:45083694-45083705promoter 内 660-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45087035-45090326(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCCACGTGGC
SmilChr03G000572 Chr03 NC_080389.1:6235387-6235398promoter 内 623-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 6229919-6232020(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGTCG
SmilChr03G000740 Chr03 NC_080389.1:8402002-8402013promoter 内 590-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8405413-8406971(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr01G004947 Chr01 NC_080387.1:67569565-67569576promoter 内 488-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 67561799-67566063(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTATGACGTGGC
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7425229-7425240promoter 内 486-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7428744-7431916(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGAAGACGTGGC
SmilChr04G002968 Chr04 NC_080390.1:46050304-46050315promoter 内 452-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 46039958-46046766(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTCGC
SmilChr03G003349 Chr03 NC_080389.1:51822807-51822818promoter 内 415-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51826393-51831369(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGAAGACGTGGC
SmilChr04G003718 Chr04 NC_080390.1:53486896-53486907promoter 内 410-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 53490487-53491750(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGGC
SmilChr04G000479 Chr04 NC_080390.1:5192598-5192609promoter 内 409-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 5187049-5189017(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGTCG
SmilChr01G003022 Chr01 NC_080387.1:49269519-49269530promoter 内 365-376 bp - 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 49273155-49275950(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr03G001313 Chr03 NC_080389.1:15408932-15408943promoter 内 362-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15402993-15405304(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATAG
SmilChr01G005456 Chr01 NC_080387.1:71594780-71594791promoter 内 340-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 71598441-71600735(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGACCACGTGGC
SmilChr04G001290 Chr04 NC_080390.1:20563889-20563900promoter 内 233-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 20567657-20568346(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATC
SmilChr04G003605 Chr04 NC_080390.1:52520322-52520333promoter 内 227-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 52515660-52516559(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGACCACGTGGC
SmilChr04G000629 Chr04 NC_080390.1:7156215-7156226promoter 内 207-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7148506-7152432(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATC
SmilChr02G004893 Chr02 NC_080388.1:70957683-70957694promoter 内 144-155 bp - 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 70961540-70963494(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAAAC
SmilChr03G002643 Chr03 NC_080389.1:42038771-42038782promoter 内 144-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 42029806-42034925(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr02G005189 Chr02 NC_080388.1:73200193-73200204promoter 内 36-47 bp + 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 73189492-73196239(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGACC
SmilChr04G002107 Chr04 NC_080390.1:34016452-34016463promoter 内 1776-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 34013504-34014238(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGCAG
SmilChr03G000288 Chr03 NC_080389.1:3271204-3271215promoter 内 3951-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 3266456-3271165(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G000193 Chr01 NC_080387.1:3341649-3341660promoter 内 3595-3606 bp + 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 3342055-3344608(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGT
SmilChr01G001872 Chr01 NC_080387.1:33750068-33750079promoter 内 3458-3469 bp - 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 33750611-33755923(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACA
SmilChr02G003788 Chr02 NC_080388.1:59525170-59525181promoter 内 2139-2150 bp + 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 59527032-59529805(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGCGACGTGGC
SmilChr04G000683 Chr04 NC_080390.1:7966050-7966061promoter 内 1518-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 7959403-7963578(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G000286 Chr01 NC_080387.1:5643409-5643420promoter 内 720-731 bp - 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 5636395-5640139(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGT
SmilChr04G000952 Chr04 NC_080390.1:12597784-12597795promoter 内 3416-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 12598369-12601026(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr01G003833 Chr01 NC_080387.1:56655243-56655254promoter 内 3252-3263 bp - 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56655992-56661823(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr01G005652 Chr01 NC_080387.1:72893706-72893717promoter 内 3121-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 72892765-72892837(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCACGACGTGGC
SmilChr04G000163 Chr04 NC_080390.1:1469428-1469439promoter 内 3040-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1463504-1468478(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGTG
SmilChr02G005298 Chr02 NC_080388.1:73948898-73948909promoter 内 2708-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 73945387-73947616(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTCGACGTGGC
SmilChr02G002339 Chr02 NC_080388.1:41099386-41099397promoter 内 2623-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 41092098-41098019(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr03G000181 Chr03 NC_080389.1:1945871-1945882promoter 内 2349-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1938732-1944230(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA