转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 41 / 149 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004001 Chr02 NC_080388.1:62344045-62344055promoter 内 216-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 62347830-62348439(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G000749 Chr02 NC_080388.1:12188241-12188251promoter 内 169-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 12179393-12184419(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr02G004207 Chr02 NC_080388.1:64333446-64333456promoter 内 85-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 64337362-64339271(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G004539 Chr01 NC_080387.1:63537712-63537722promoter 内 3712-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 63538001-63539758(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr05G001939 Chr05 NC_080391.1:19756539-19756549promoter 内 2270-2280 bp + 1721 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 19751612-19754818(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAG
SmilChr06G000010 Chr06 NC_080392.1:194003-194013promoter 内 385-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 197619-197691(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr04G003035 Chr04 NC_080390.1:46830859-46830869promoter 内 3966-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 46830894-46831911(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr03G001751 Chr03 NC_080389.1:23741040-23741050promoter 内 3939-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 23741102-23741413(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr04G003188 Chr04 NC_080390.1:48578299-48578309promoter 内 3825-3835 bp + 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 48577410-48578133(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr07G002068 Chr07 NC_080393.1:18807182-18807192promoter 内 3701-3711 bp + 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 18804770-18806892(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr05G001375 Chr05 NC_080391.1:12266894-12266904promoter 内 3338-3348 bp + 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 12267557-12270283(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr05G001310 Chr05 NC_080391.1:11297397-11297407promoter 内 3253-3263 bp - 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 11294713-11296659(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G001123 Chr05 NC_080391.1:9362374-9362384promoter 内 3143-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 9361403-9361526(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCG
SmilChr06G000585 Chr06 NC_080392.1:5029336-5029346promoter 内 3097-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 5026361-5028442(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr01G000149 Chr01 NC_080387.1:2553924-2553934promoter 内 3085-3095 bp - 906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 2554840-2563158(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGT
SmilChr03G002227 Chr03 NC_080389.1:35093018-35093028promoter 内 2907-2917 bp - 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 35094112-35096951(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr07G002246 Chr07 NC_080393.1:20637927-20637937promoter 内 2861-2871 bp + 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 20634440-20636797(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr02G001418 Chr02 NC_080388.1:26808592-26808602promoter 内 2829-2839 bp + 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 26809764-26810826(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr03G000553 Chr03 NC_080389.1:5986912-5986922promoter 内 2785-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 5988128-5991376(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGT
SmilChr04G000132 Chr04 NC_080390.1:1144502-1144512promoter 内 2520-2530 bp - 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 1135253-1143031(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr03G001750 Chr03 NC_080389.1:23741040-23741050promoter 内 2457-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 23736896-23739506(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr02G001468 Chr02 NC_080388.1:27410936-27410946promoter 内 2353-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 27407029-27409298(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G002333 Chr05 NC_080391.1:25227294-25227304promoter 内 2334-2344 bp - 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 25228961-25230122(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr01G005015 Chr01 NC_080387.1:68161470-68161480promoter 内 2265-2275 bp - 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 68156428-68159744(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCG
SmilChr05G003487 Chr05 NC_080391.1:46372727-46372737promoter 内 2251-2261 bp + 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 46374477-46375199(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr04G000140 Chr04 NC_080390.1:1194074-1194084promoter 内 2098-2108 bp + 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 1195977-1204618(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr01G004241 Chr01 NC_080387.1:60716904-60716914promoter 内 1875-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 60719030-60723206(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAG
SmilChr04G003544 Chr04 NC_080390.1:51802491-51802501promoter 内 1829-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 51798806-51800329(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAG
SmilChr02G002246 Chr02 NC_080388.1:39893415-39893425promoter 内 1714-1724 bp + 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 39895702-39906559(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCG
SmilChr03G001693 Chr03 NC_080389.1:22444524-22444534promoter 内 1684-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 22446841-22447502(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr03G001001 Chr03 NC_080389.1:11332196-11332206promoter 内 1640-1650 bp - 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 11334557-11335675(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGT
SmilChr05G003488 Chr05 NC_080391.1:46372727-46372737promoter 内 1466-1476 bp + 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 46375262-46376816(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr01G003897 Chr01 NC_080387.1:57254331-57254341promoter 内 1386-1396 bp + 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 57247544-57251726(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr05G002741 Chr05 NC_080391.1:31585589-31585599promoter 内 1268-1278 bp - 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 31579540-31582866(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr01G001990 Chr01 NC_080387.1:35324415-35324425promoter 内 1267-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 35318182-35321691(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G000913 Chr05 NC_080391.1:7243333-7243343promoter 内 1170-1180 bp - 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 7236666-7240512(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr01G003913 Chr01 NC_080387.1:57405683-57405693promoter 内 1167-1177 bp + 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 57398203-57402859(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTA
SmilChr04G002535 Chr04 NC_080390.1:40453707-40453717promoter 内 696-706 bp - 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 40457012-40457554(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAG
SmilChr04G004040 Chr04 NC_080390.1:55635099-55635109promoter 内 670-680 bp + 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 55638430-55642611(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr02G000895 Chr02 NC_080388.1:15390750-15390760promoter 内 506-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 15394245-15399848(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr05G002035 Chr05 NC_080391.1:21187398-21187408promoter 内 467-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 21190932-21195848(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr07G002247 Chr07 NC_080393.1:20637927-20637937promoter 内 448-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 20641480-20646445(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCG
SmilChr02G000748 Chr02 NC_080388.1:12147787-12147797promoter 内 362-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 12151426-12151770(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCG
SmilChr06G003119 Chr06 NC_080392.1:44022089-44022099promoter 内 165-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 44015565-44018263(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr03G002489 Chr03 NC_080389.1:39577691-39577701promoter 内 87-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 39571282-39573787(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr04G003545 Chr04 NC_080390.1:51802491-51802501promoter 内 20-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 51806472-51810664(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCG
SmilChr01G004567 Chr01 NC_080387.1:63733629-63733639promoter 内 3979-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63733651-63736157(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGT
SmilChr04G002948 Chr04 NC_080390.1:45817227-45817237promoter 内 3874-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 45817354-45821905(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G004388 Chr05 NC_080391.1:57334058-57334068promoter 内 3869-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57332849-57333936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCG
SmilChr02G004172 Chr02 NC_080388.1:64005524-64005534promoter 内 3818-3828 bp - 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 64005707-64007191(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC