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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 42 / 151 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005389 Chr02 NC_080388.1:74520627-74520639promoter 内 1577-1589 bp + 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 74523051-74525524(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATCAC
SmilChr02G005483 Chr02 NC_080388.1:75039275-75039287promoter 内 1068-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 75034610-75036354(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTGTA
SmilChr02G004908 Chr02 NC_080388.1:71092552-71092564promoter 内 988-1000 bp - 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 71095565-71098479(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAGA
SmilChr05G000510 Chr05 NC_080391.1:3936052-3936064promoter 内 979-991 bp - 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3939074-3943023(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAAT
SmilChr04G003311 Chr04 NC_080390.1:49845488-49845500promoter 内 548-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49841414-49842047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGTTAGGTAAA
SmilChr03G001323 Chr03 NC_080389.1:15466261-15466273promoter 内 508-520 bp - 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 15469754-15470548(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGCA
SmilChr03G001426 Chr03 NC_080389.1:16904588-16904600promoter 内 367-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 16900895-16900966(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGCA
SmilChr02G005387 Chr02 NC_080388.1:74520627-74520639promoter 内 181-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 74514699-74516819(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGATTAGGTAAG
SmilChr03G004684 Chr03 NC_080389.1:64254227-64254239promoter 内 125-137 bp + 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 64249254-64250363(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAGT
SmilChr04G000288 Chr04 NC_080390.1:2689082-2689094promoter 内 18-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2685038-2685111(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTAGT
SmilChr03G004309 Chr03 NC_080389.1:61430668-61430680promoter 内 3825-3837 bp - 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 61430844-61433322(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGATTAGGTAAA
SmilChr05G000022 Chr05 NC_080391.1:89551-89563promoter 内 85-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 93467-97139(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCGCC
SmilChr01G004470 Chr01 NC_080387.1:62794238-62794250promoter 内 3919-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 62792722-62794168(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCAA
SmilChr04G000517 Chr04 NC_080390.1:5698570-5698582promoter 内 3039-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 5699532-5700239(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAC
SmilChr03G001686 Chr03 NC_080389.1:22234582-22234594promoter 内 2611-2623 bp - 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 22235972-22236892(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAC
SmilChr01G004608 Chr01 NC_080387.1:64055749-64055761promoter 内 2585-2597 bp + 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 64049753-64054345(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGTTAGGTAAA
SmilChr02G000802 Chr02 NC_080388.1:13393911-13393923promoter 内 2578-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 13395334-13396059(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAATTAGGTAAG
SmilChr01G004843 Chr01 NC_080387.1:66571989-66572001promoter 内 2448-2460 bp + 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 66562443-66570448(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTAGT
SmilChr01G004195 Chr01 NC_080387.1:60408195-60408207promoter 内 2430-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 60409766-60413421(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGTTAGGTAAA
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SmilChr02G001553 Chr02 NC_080388.1:28836185-28836197promoter 内 2041-2053 bp - 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 28829532-28834237(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCATT
SmilChr05G000757 Chr05 NC_080391.1:5863033-5863045promoter 内 1860-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 5865174-5869422(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTCCA
SmilChr01G000312 Chr01 NC_080387.1:6029588-6029600promoter 内 1752-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 6026254-6027351(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTCCA
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SmilChr04G001741 Chr04 NC_080390.1:28656276-28656288promoter 内 632-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 28659645-28662241(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTCCA
SmilChr01G001812 Chr01 NC_080387.1:33041503-33041515promoter 内 512-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 33044992-33053763(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTCCA
SmilChr02G004847 Chr02 NC_080388.1:70606299-70606311promoter 内 388-400 bp + 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 70609912-70613661(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAACGTT
SmilChr01G004872 Chr01 NC_080387.1:66836875-66836887promoter 内 104-116 bp - 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 66831346-66832990(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCATA
SmilChr02G005174 Chr02 NC_080388.1:73041675-73041687promoter 内 3951-3963 bp - 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 73041725-73043570(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGTTAGGTAAA
SmilChr02G003962 Chr02 NC_080388.1:61784003-61784015promoter 内 3915-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 61784089-61785619(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATCCT
SmilChr05G000243 Chr05 NC_080391.1:1853562-1853574promoter 内 3915-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 1853648-1854834(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCGCC
SmilChr04G000841 Chr04 NC_080390.1:10614825-10614837promoter 内 3903-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 10614923-10617887(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACGTTAGGTAAC
SmilChr05G000155 Chr05 NC_080391.1:1252753-1252765promoter 内 3897-3909 bp - 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 1250082-1252661(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCGCC
SmilChr01G005334 Chr01 NC_080387.1:70544182-70544194promoter 内 3896-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 70542168-70544089(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAATTAGGTAAG
SmilChr04G002918 Chr04 NC_080390.1:45401890-45401902promoter 内 3791-3803 bp - 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 45402100-45406022(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTATTAGGTAAG
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SmilChr03G003350 Chr03 NC_080389.1:51832157-51832169promoter 内 3736-3748 bp - 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51832422-51834098(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGATTAGGTAAA
SmilChr03G003108 Chr03 NC_080389.1:48213361-48213373promoter 内 3692-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48208721-48213064(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTGAT
SmilChr01G005105 Chr01 NC_080387.1:68843393-68843405promoter 内 3666-3678 bp + 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 68838134-68843070(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTAGTAGGTAGA
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SmilChr02G000459 Chr02 NC_080388.1:6153605-6153617promoter 内 3658-3670 bp + 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 6153948-6155631(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTCAA
SmilChr01G004873 Chr01 NC_080387.1:66836875-66836887promoter 内 3621-3633 bp - 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 66837255-66837328(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTGGT
SmilChr02G000044 Chr02 NC_080388.1:597142-597154promoter 内 3590-3602 bp - 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 593910-596743(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCATA
SmilChr04G000548 Chr04 NC_080390.1:6122957-6122969promoter 内 3570-3582 bp - 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 6123388-6125587(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTGAT
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SmilChr02G001070 Chr02 NC_080388.1:19058749-19058761promoter 内 3275-3287 bp - 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 19059475-19059868(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTAGTAGGTAAG
SmilChr05G000154 Chr05 NC_080391.1:1247029-1247041promoter 内 3238-3250 bp - 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 1247792-1249561(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTGGT