转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 45 / 146 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000155 Chr02 NC_080388.1:2015178-2015191promoter 内 277-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2018902-2021942(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAAAGTT
SmilChr01G001908 Chr01 NC_080387.1:34166841-34166854promoter 内 267-280 bp + 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 34170575-34171755(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTTAA
SmilChr01G001865 Chr01 NC_080387.1:33593813-33593826promoter 内 245-258 bp + 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33597569-33598788(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTTAA
SmilChr04G003606 Chr04 NC_080390.1:52531376-52531389promoter 内 76-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52535301-52536840(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGAGGTCAACGCT
SmilChr02G005014 Chr02 NC_080388.1:71920604-71920617promoter 内 43-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71924562-71926068(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAGAGTCAACCCC
SmilChr03G000366 Chr03 NC_080389.1:4094850-4094863promoter 内 1973-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 4088674-4092835(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCGTTGACCTGGT
SmilChr01G001157 Chr01 NC_080387.1:23520583-23520596promoter 内 3259-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 23515547-23519854(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGTGTTGACTCTTG
SmilChr01G000241 Chr01 NC_080387.1:4497108-4497121promoter 内 3213-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 4497896-4500637(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAGAAGTCAAAGCT
SmilChr01G001920 Chr01 NC_080387.1:34328448-34328461promoter 内 3115-3128 bp - 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 34329334-34330618(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAACATT
SmilChr01G002952 Chr01 NC_080387.1:48394786-48394799promoter 内 2003-2016 bp + 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 48396784-48401513(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAGTTGACTTTAA
SmilChr01G003073 Chr01 NC_080387.1:49571833-49571846promoter 内 1671-1684 bp + 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 49574163-49579321(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATGTTGACTTTGA
SmilChr01G001592 Chr01 NC_080387.1:29995900-29995913promoter 内 1097-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 29998804-30004658(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGCTTTGACTTCTC
SmilChr04G000113 Chr04 NC_080390.1:987221-987234promoter 内 512-525 bp + 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 980419-983745(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAACATT
SmilChr01G003228 Chr01 NC_080387.1:51038411-51038424promoter 内 492-505 bp - 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 51041920-51053928(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAAAGTCAAACCC
SmilChr04G003589 Chr04 NC_080390.1:52322475-52322488promoter 内 3964-3977 bp + 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52321623-52322451(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAAGAGTCAACCAC
SmilChr04G000911 Chr04 NC_080390.1:11857699-11857712promoter 内 3934-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 11855592-11857645(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCCTTTGACTTTAG
SmilChr04G001147 Chr04 NC_080390.1:16896932-16896945promoter 内 3410-3423 bp + 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 16894816-16896354(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAAAGTCAACATT
SmilChr03G001845 Chr03 NC_080389.1:25347854-25347867promoter 内 3286-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 25348569-25351888(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCCGTTGACTGTCC
SmilChr03G004747 Chr03 NC_080389.1:64575753-64575766promoter 内 3056-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 64576698-64579862(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGGTTGACTTGTA
SmilChr02G002090 Chr02 NC_080388.1:37494445-37494458promoter 内 2763-2776 bp + 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 37487786-37493220(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAACTTG
SmilChr02G000914 Chr02 NC_080388.1:15870084-15870097promoter 内 2594-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 15850486-15868690(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr02G000915 Chr02 NC_080388.1:15870084-15870097promoter 内 2575-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 15852719-15868671(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr03G001638 Chr03 NC_080389.1:21127459-21127472promoter 内 2538-2551 bp + 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 21128922-21131369(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCTTTGACTTCTG
SmilChr03G000884 Chr03 NC_080389.1:10031074-10031087promoter 内 1803-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10025259-10028889(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACGTTTGACTTTTT
SmilChr03G000601 Chr03 NC_080389.1:6674370-6674383promoter 内 1541-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 6676830-6678523(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr03G000386 Chr03 NC_080389.1:4288955-4288968promoter 内 1491-1504 bp + 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 4291465-4292439(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr01G001841 Chr01 NC_080387.1:33347405-33347418promoter 内 1268-1281 bp + 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 33350138-33352410(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGGTTGACTTCGT
SmilChr04G000517 Chr04 NC_080390.1:5696641-5696654promoter 内 1110-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 5699532-5700239(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CATAAGTCAACTAT
SmilChr03G000956 Chr03 NC_080389.1:10806035-10806048promoter 内 849-862 bp + 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10809187-10810392(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr03G000387 Chr03 NC_080389.1:4288955-4288968promoter 内 630-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 4292326-4293199(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAGGTTGACTTCTT
SmilChr04G003590 Chr04 NC_080390.1:52322475-52322488promoter 内 593-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52325883-52336260(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTGGTTGACTCTTC
SmilChr03G002197 Chr03 NC_080389.1:34590740-34590753promoter 内 479-492 bp - 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 34585683-34587231(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTCGTTGACTTAAT
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6065619-6065632promoter 内 204-217 bp + 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 6058931-6061835(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAACTAA
SmilChr03G001096 Chr03 NC_080389.1:12643961-12643974promoter 内 165-178 bp + 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 12647797-12648573(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCGTTGACCTGGT
SmilChr02G002271 Chr02 NC_080388.1:40175465-40175478promoter 内 3902-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40172226-40175379(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACGTTTGACTTTTT
SmilChr02G000725 Chr02 NC_080388.1:11785404-11785417promoter 内 3851-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11784668-11785267(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCCTTTGACTTATG
SmilChr04G003784 Chr04 NC_080390.1:54003880-54003893promoter 内 3785-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53999974-54003677(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAA
SmilChr01G003207 Chr01 NC_080387.1:50856577-50856590promoter 内 3745-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50856833-50858826(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTAAGTCAACGGA
SmilChr03G000067 Chr03 NC_080389.1:768023-768036promoter 内 3734-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 766367-767769(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAGTTGACTTGTT
SmilChr04G001855 Chr04 NC_080390.1:30188251-30188264promoter 内 3700-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30186711-30187963(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCGTTGACATTTC
SmilChr01G000477 Chr01 NC_080387.1:9784977-9784990promoter 内 3640-3653 bp - 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9785338-9787272(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAG
SmilChr01G004621 Chr01 NC_080387.1:64244344-64244357promoter 内 3631-3644 bp + 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64244714-64245115(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTTGTTGACTTTGT
SmilChr02G004205 Chr02 NC_080388.1:64313228-64313241promoter 内 3459-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64313770-64316621(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTCAAGTCAACGAG
SmilChr01G001919 Chr01 NC_080387.1:34328448-34328461promoter 内 3148-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34324330-34327608(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATGTTGACTTTGA
SmilChr03G001856 Chr03 NC_080389.1:25588033-25588046promoter 内 3090-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 25588944-25589594(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCCTTTGACTTTAG
SmilChr01G005511 Chr01 NC_080387.1:71955493-71955506promoter 内 3078-3091 bp - 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 71956416-71960046(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCCAAGTCAACTCG
SmilChr02G004391 Chr02 NC_080388.1:66256959-66256972promoter 内 2992-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66257968-66258586(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAGTTGACTTAGT
SmilChr02G001455 Chr02 NC_080388.1:27221971-27221984promoter 内 2984-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27222988-27224878(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCCAAGTCAACTGT
SmilChr02G002618 Chr02 NC_080388.1:45494262-45494275promoter 内 2976-2989 bp + 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45491760-45493250(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAAAGTCAACAGA
SmilChr03G002724 Chr03 NC_080389.1:43259006-43259019promoter 内 2870-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43260137-43262411(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAACTTG