Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001059; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014491-RA_Salv SmilChr06G001059 Dof XP_057768449.1 MP00402 TTTTTTTTTTTTTTACTTTTT

可能结合的靶基因

9875 个结合位点 6278 个候选靶基因 第 46 / 126 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003954 Chr01 NC_080387.1:57917481-57917501promoter 内 457-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57921025-57976435(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTACAGAAAACAAAG
SmilChr02G005494 Chr02 NC_080388.1:75103056-75103076promoter 内 258-278 bp + 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 75097484-75099333(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTATAAAGGAGAAGAC
SmilChr01G001558 Chr01 NC_080387.1:29602231-29602251promoter 内 82-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29596491-29598332(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AACCCACTTTATCTACTTTTT
SmilChr02G005432 Chr02 NC_080388.1:74748049-74748069promoter 内 2770-2790 bp + 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 74742249-74746838(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGCGGGGAAGAAAAAAA
SmilChr01G002723 Chr01 NC_080387.1:45576186-45576206promoter 内 3961-3981 bp + 20 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 45576226-45578866(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTCCTTAACTCTTACTTTTC
SmilChr01G002032 Chr01 NC_080387.1:35930558-35930578promoter 内 3925-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 35927524-35930502(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAAAAAAGTTAGT
SmilChr01G004578 Chr01 NC_080387.1:63826254-63826274promoter 内 2934-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 63819762-63825207(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTCATTTTTTCTTTAT
SmilChr01G001650 Chr01 NC_080387.1:30560204-30560224promoter 内 2835-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 30553005-30559058(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAATATGAAAAGTA
SmilChr02G002412 Chr02 NC_080388.1:42091263-42091283promoter 内 1529-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 42088118-42088811(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CGCTTTCAGTTGTTACTTTTC
SmilChr01G002213 Chr01 NC_080387.1:38487421-38487441promoter 内 1179-1199 bp + 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 38481612-38484619(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAGGAAGAGACAACA
SmilChr01G002230 Chr01 NC_080387.1:38796876-38796896promoter 内 1179-1199 bp + 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 38791046-38794074(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAGGAAGAGACAACA
SmilChr02G005024 Chr02 NC_080388.1:71991521-71991541promoter 内 306-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 71985741-71987846(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGGGGGAAGAAAAAAAA
SmilChr01G002163 Chr01 NC_080387.1:37668913-37668933promoter 内 154-174 bp + 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 37672760-37675854(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTCTTTCTCTCACACTTTTT
SmilChr01G002004 Chr01 NC_080387.1:35544840-35544860promoter 内 3568-3588 bp + 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 35540745-35544427(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGTAAGAGAAAGAAAAT
SmilChr02G005036 Chr02 NC_080388.1:72070041-72070061promoter 内 3476-3496 bp - 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 72062039-72069536(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTCATTTTTCTTTTACTTTCG
SmilChr03G000940 Chr03 NC_080389.1:10687197-10687217promoter 内 3275-3295 bp - 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10687923-10695268(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTAAGGAATAAGAAT
SmilChr01G004399 Chr01 NC_080387.1:62122619-62122639promoter 内 3157-3177 bp + 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 62123463-62125691(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTAATTTTTAACTTTTT
SmilChr02G004877 Chr02 NC_080388.1:70853627-70853647promoter 内 2625-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 70842455-70852271(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTCTTTATCTTTTTACTTTTA
SmilChr02G005401 Chr02 NC_080388.1:74565357-74565377promoter 内 2554-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 74566804-74569571(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATTTTAATTTTTACTTTTT
SmilChr02G005412 Chr02 NC_080388.1:74601549-74601569promoter 内 2554-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 74602996-74605763(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATTTTAATTTTTACTTTTT
SmilChr01G004674 Chr01 NC_080387.1:64834118-64834138promoter 内 2437-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 64835682-64837584(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTGAAGTTGAAAGTG
SmilChr01G005776 Chr01 NC_080387.1:73872835-73872855promoter 内 2409-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 73849965-73871263(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTGCTGATCTTTTAACTTTTT
SmilChr01G003852 Chr01 NC_080387.1:56799231-56799251promoter 内 2299-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 56800933-56801689(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAACTAAGAGTGA
SmilChr01G002828 Chr01 NC_080387.1:46878442-46878462promoter 内 2048-2068 bp - 1933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 46873713-46876509(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATGTCCCCTTTTACTTTTC
SmilChr02G004789 Chr02 NC_080388.1:70055454-70055474promoter 内 1942-1962 bp + 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 70041536-70053415(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAAAAATAAAAATTG
SmilChr01G002232 Chr01 NC_080387.1:38796876-38796896promoter 内 1872-1892 bp + 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 38799005-38801879(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGTTGTCTCTTCCTACTTTTG
SmilChr02G004825 Chr02 NC_080388.1:70347890-70347910promoter 内 1732-1752 bp + 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 70350159-70369004(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTATTTATTTTTTAACTTTTT
SmilChr01G002216 Chr01 NC_080387.1:38487421-38487441promoter 内 1716-1736 bp + 2265 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 38489706-38492423(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGTTGTCTCTTCCTACTTTTG
SmilChr02G000579 Chr02 NC_080388.1:8329851-8329871promoter 内 1645-1665 bp - 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 8321882-8327515(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GGCGTCTCCTTCTCACTTTTT
SmilChr02G003410 Chr02 NC_080388.1:55284400-55284420promoter 内 1386-1406 bp - 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 55268108-55281805(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATCTTTCTATTTTTACTTTTA
SmilChr01G003850 Chr01 NC_080387.1:56799231-56799251promoter 内 1322-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 56795583-56796572(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCACTCTTAGTTTTACTTTTT
SmilChr02G002467 Chr02 NC_080388.1:43048687-43048707promoter 内 1297-1317 bp + 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 43051391-43054449(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTCATCCATTTGCTACTTTTT
SmilChr01G001917 Chr01 NC_080387.1:34309725-34309745promoter 内 342-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 34313384-34317252(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TATTTCTTGTTGTTACTTTTT
SmilChr01G001873 Chr01 NC_080387.1:33753047-33753067promoter 内 320-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 33756728-33760494(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TATTTCTTGTTGTTACTTTTT
SmilChr02G005408 Chr02 NC_080388.1:74591972-74591992promoter 内 3778-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74592195-74595504(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATTTTAATTTTTACTTTTT
SmilChr02G003870 Chr02 NC_080388.1:60709963-60709983promoter 内 3739-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60710225-60712683(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AACTATTCTCTTTAACTTTTT
SmilChr01G004836 Chr01 NC_080387.1:66489417-66489437promoter 内 3717-3737 bp + 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66489701-66500904(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTATTATTTTCTTTTT
SmilChr01G004166 Chr01 NC_080387.1:60162423-60162443promoter 内 3649-3669 bp - 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60157280-60162091(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTGACTTTTA
SmilChr01G000268 Chr01 NC_080387.1:5192002-5192022promoter 内 3553-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5192450-5194560(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAAAAAAAATAAAG
SmilChr01G004171 Chr01 NC_080387.1:60195775-60195795promoter 内 3498-3518 bp + 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60196278-60197701(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGTACTTTTTATTCACTTTTT
SmilChr02G005417 Chr02 NC_080388.1:74632544-74632564promoter 内 3476-3496 bp - 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74626092-74632039(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTATTTTAGTTTTTACTTTTT
SmilChr01G003881 Chr01 NC_080387.1:57135873-57135893promoter 内 3475-3495 bp + 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57136399-57143925(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTAATCCCTTTTT
SmilChr02G004173 Chr02 NC_080388.1:64018378-64018398promoter 内 3452-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64018927-64028159(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGCTCTCTCTCGTCACTTTTT
SmilChr01G004778 Chr01 NC_080387.1:65955488-65955508promoter 内 3426-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65956063-65956945(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CGCCTGGTCTCTCTACTTTTT
SmilChr01G002595 Chr01 NC_080387.1:44133193-44133213promoter 内 3412-3432 bp + 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44133782-44137281(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGATATTTTTTTTTACTTTTT
SmilChr02G000126 Chr02 NC_080388.1:1727457-1727477promoter 内 3277-3297 bp + 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1723714-1726753(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGGAAAGAGAGCTTG
SmilChr01G000961 Chr01 NC_080387.1:20358762-20358782promoter 内 3265-3285 bp + 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20355747-20358046(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAAGATGGTTG
SmilChr02G001774 Chr02 NC_080388.1:32512069-32512089promoter 内 3213-3233 bp + 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 32508661-32511301(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGTAAGAGAGAGAAAAT
SmilChr01G002410 Chr01 NC_080387.1:41469062-41469082promoter 内 3207-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41469856-41472909(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGGAAAGAGAGCTTG
SmilChr01G001420 Chr01 NC_080387.1:27801861-27801881promoter 内 2979-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27802883-27806003(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CGATTCTTTCTCTAACTTTTT