转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 47 / 149 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001279 Chr05 NC_080391.1:10944451-10944461promoter 内 1000-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 10947452-10955587(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAC
SmilChr05G002270 Chr05 NC_080391.1:24400071-24400081promoter 内 952-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 24403120-24412129(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGGGCTGTCA
SmilChr03G000892 Chr03 NC_080389.1:10201193-10201203promoter 内 770-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 10181406-10197972(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCA
SmilChr02G000446 Chr02 NC_080388.1:5845700-5845710promoter 内 519-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 5841578-5842228(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr07G000873 Chr07 NC_080393.1:6246500-6246510promoter 内 197-207 bp + 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 6250304-6253305(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCT
SmilChr05G004238 Chr05 NC_080391.1:56206925-56206935promoter 内 109-119 bp - 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 56201389-56203043(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGGGCTGTCA
SmilChr02G000294 Chr02 NC_080388.1:3720767-3720777promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3720816-3723614(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr04G002679 Chr04 NC_080390.1:42222720-42222730promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42218840-42222681(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGG
SmilChr07G000064 Chr07 NC_080393.1:296192-296202promoter 内 3947-3957 bp + 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 296246-299283(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G000345 Chr02 NC_080388.1:4504307-4504317promoter 内 3909-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4492503-4504225(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G000292 Chr02 NC_080388.1:3704182-3704192promoter 内 3884-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3704299-3707126(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G000291 Chr02 NC_080388.1:3697887-3697897promoter 内 3871-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3698017-3723614(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G000344 Chr02 NC_080388.1:4495070-4495080promoter 内 3870-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4492434-4494949(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G000299 Chr02 NC_080388.1:3771275-3771285promoter 内 3860-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3771416-3774441(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr05G003403 Chr05 NC_080391.1:45125655-45125665promoter 内 3733-3743 bp - 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 45125923-45130142(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAC
SmilChr07G000065 Chr07 NC_080393.1:300957-300967promoter 内 3729-3739 bp + 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 301229-305435(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr01G005093 Chr01 NC_080387.1:68786273-68786283promoter 内 3675-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 68783775-68785957(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCA
SmilChr06G002828 Chr06 NC_080392.1:41049643-41049653promoter 内 3589-3599 bp + 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41048896-41049241(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGG
SmilChr07G001313 Chr07 NC_080393.1:10109681-10109691promoter 内 3527-3537 bp + 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10106138-10109217(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGG
SmilChr07G003006 Chr07 NC_080393.1:30890157-30890167promoter 内 3503-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30890655-30893055(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr05G002667 Chr05 NC_080391.1:30167049-30167059promoter 内 3348-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30165094-30166406(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCC
SmilChr05G001793 Chr05 NC_080391.1:17658854-17658864promoter 内 3282-3292 bp + 709 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17659573-17659911(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr07G000767 Chr07 NC_080393.1:5372659-5372669promoter 内 3242-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5373418-5377930(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCA
SmilChr01G001875 Chr01 NC_080387.1:33771660-33771670promoter 内 3209-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33767560-33770878(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGGGCTGTCA
SmilChr01G001919 Chr01 NC_080387.1:34328407-34328417promoter 内 3192-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34324330-34327608(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGGGCTGTCA
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66265745-66265755promoter 内 3149-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66266597-66270367(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr01G001876 Chr01 NC_080387.1:33771660-33771670promoter 内 3107-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33772554-33773888(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr01G001920 Chr01 NC_080387.1:34328407-34328417promoter 内 3074-3084 bp - 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34329334-34330618(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr05G002411 Chr05 NC_080391.1:26623329-26623339promoter 内 2946-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26620663-26622284(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTG
SmilChr04G003780 Chr04 NC_080390.1:53991734-53991744promoter 内 2888-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53990559-53990631(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr01G004792 Chr01 NC_080387.1:66157344-66157354promoter 内 2880-2890 bp - 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66158465-66160292(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGC
SmilChr03G001695 Chr03 NC_080389.1:22506999-22507009promoter 内 2867-2877 bp + 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 22503613-22505875(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAC
SmilChr04G002087 Chr04 NC_080390.1:33645335-33645345promoter 内 2711-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33643600-33644055(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGGGCTGTCA
SmilChr06G001748 Chr06 NC_080392.1:20252086-20252096promoter 内 2540-2550 bp - 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 20253547-20256434(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr02G001256 Chr02 NC_080388.1:23072699-23072709promoter 内 2469-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 23074231-23074569(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr03G001894 Chr03 NC_080389.1:26440401-26440411promoter 内 2469-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26441933-26442271(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr04G002315 Chr04 NC_080390.1:37464526-37464536promoter 内 2469-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37462666-37463004(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr06G001818 Chr06 NC_080392.1:21348225-21348235promoter 内 2469-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21346371-21346703(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr06G002325 Chr06 NC_080392.1:33642230-33642240promoter 内 2469-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33640370-33640708(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr07G002330 Chr07 NC_080393.1:21608965-21608975promoter 内 2469-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21607105-21607443(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr07G003016 Chr07 NC_080393.1:31158037-31158047promoter 内 2469-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 31156177-31156515(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr02G002031 Chr02 NC_080388.1:36559029-36559039promoter 内 2468-2478 bp + 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 36560562-36561959(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr03G001568 Chr03 NC_080389.1:19813032-19813042promoter 内 2389-2399 bp - 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19811092-19811430(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr04G003632 Chr04 NC_080390.1:52831553-52831563promoter 内 2228-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 52826978-52829790(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTG
SmilChr04G003723 Chr04 NC_080390.1:53569764-53569774promoter 内 2215-2225 bp + 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53571550-53574743(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCT
SmilChr07G001314 Chr07 NC_080393.1:10109681-10109691promoter 内 2066-2076 bp + 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10111616-10113982(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCC
SmilChr06G002072 Chr06 NC_080392.1:27332435-27332445promoter 内 2018-2028 bp - 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27334418-27335066(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTG
SmilChr04G004107 Chr04 NC_080390.1:56017947-56017957promoter 内 1946-1956 bp - 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56020002-56021164(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAC
SmilChr06G003290 Chr06 NC_080392.1:45452783-45452793promoter 内 1733-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 45455051-45463319(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCA
SmilChr06G002844 Chr06 NC_080392.1:41203189-41203199promoter 内 1729-1739 bp + 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41196799-41200927(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGG