靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00001784-RA_Salv |
SmilChr04G003367 |
MYB | XP_057804957.1 |
MP00191 |
ATTAACCTTATCCTC |
9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 48 / 135 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr01G006003 |
Chr01 | NC_080387.1:75607710-75607724promoter 内 935-949 bp |
- | 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 75601814-75604658(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TCCATTCTTATCCCA |
SmilChr02G001957 |
Chr02 | NC_080388.1:35312140-35312154promoter 内 700-714 bp |
- | 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 35305803-35308853(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTTATCCTTATCAGC |
SmilChr03G001441 |
Chr03 | NC_080389.1:17148889-17148903promoter 内 700-714 bp |
+ | 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 17144939-17145602(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GGGGATAAGAACAAT |
SmilChr01G000674 |
Chr01 | NC_080387.1:14952049-14952063promoter 内 691-705 bp |
- | 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 14946348-14948753(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTCGACCTTATCCTG |
SmilChr01G005187 |
Chr01 | NC_080387.1:69583050-69583064promoter 内 546-560 bp |
- | 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 69586505-69589186(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TCAGATAAGGTAAGT |
SmilChr02G005357 |
Chr02 | NC_080388.1:74308611-74308625promoter 内 534-548 bp |
- | 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 74302413-74305158(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TCTGTCCTTATCTAT |
SmilChr01G003528 |
Chr01 | NC_080387.1:53919620-53919634promoter 内 469-483 bp |
+ | 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 53913710-53916102(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAATATTATT |
SmilChr01G003472 |
Chr01 | NC_080387.1:53260958-53260972promoter 内 466-480 bp |
+ | 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 53255097-53257437(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAATATTATT |
SmilChr01G003210 |
Chr01 | NC_080387.1:50877979-50877993promoter 内 331-345 bp |
- | 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 50871331-50874323(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ACATTCCTTATCCCA |
SmilChr01G002214 |
Chr01 | NC_080387.1:38478083-38478097promoter 内 251-265 bp |
- | 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 38481833-38482558(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TAAGATAAGGTCTTC |
SmilChr01G002063 |
Chr01 | NC_080387.1:36457482-36457496promoter 内 158-172 bp |
+ | 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.9/ 100 | 1 | 36461325-36463456(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATTTTCATTATCCTC |
SmilChr01G000073 |
Chr01 | NC_080387.1:1266046-1266060promoter 内 660-674 bp |
+ | 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 4 | 1269387-1271849(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CAACGCCTTATCCAA |
SmilChr01G004467 |
Chr01 | NC_080387.1:62762372-62762386promoter 内 615-629 bp |
+ | 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 4 | 62755636-62759000(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTGGATAAGGCACGG |
SmilChr03G001992 |
Chr03 | NC_080389.1:29340955-29340969promoter 内 434-448 bp |
- | 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 4 | 29331425-29337402(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTCCTCCTTATCAAC |
SmilChr02G001517 |
Chr02 | NC_080388.1:28279193-28279207promoter 内 3592-3606 bp |
- | 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 28277010-28278798(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CGTCGCCTTATCCTT |
SmilChr01G000140 |
Chr01 | NC_080387.1:2377708-2377722promoter 内 2753-2767 bp |
+ | 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 2378956-2380275(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CAACGCCTTATCCAA |
SmilChr01G002280 |
Chr01 | NC_080387.1:39597134-39597148promoter 内 2153-2167 bp |
+ | 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 39592366-39595300(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAATATTATA |
SmilChr03G001607 |
Chr03 | NC_080389.1:20432267-20432281promoter 内 1105-1119 bp |
+ | 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 20435163-20436275(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AACTGCCTTATCCTT |
SmilChr01G005080 |
Chr01 | NC_080387.1:68668178-68668192promoter 内 1101-1115 bp |
+ | 2886 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 68671078-68671149(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATATACATTATCCTC |
SmilChr01G005614 |
Chr01 | NC_080387.1:72671193-72671207promoter 内 703-717 bp |
+ | 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 72666111-72667909(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AATGATAAGGTTACC |
SmilChr03G001431 |
Chr03 | NC_080389.1:16982754-16982768promoter 内 689-703 bp |
- | 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 3 | 16973184-16979456(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CATTACATTATCCTT |
SmilChr01G005922 |
Chr01 | NC_080387.1:75039144-75039158promoter 内 3747-3761 bp |
- | 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 75037416-75038904(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CTTTTCCTTATCAAT |
SmilChr01G002886 |
Chr01 | NC_080387.1:47479366-47479380promoter 内 3654-3668 bp |
- | 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 47479713-47482005(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATGGATAAGGGTTAA |
SmilChr01G001140 |
Chr01 | NC_080387.1:23274631-23274645promoter 内 3442-3456 bp |
+ | 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 23270547-23274086(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATGGATAAGATGTTA |
SmilChr01G003187 |
Chr01 | NC_080387.1:50621594-50621608promoter 内 3119-3133 bp |
+ | 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 50614422-50620726(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AATGATAAGGAAAGG |
SmilChr03G002948 |
Chr03 | NC_080389.1:46207207-46207221promoter 内 3082-3096 bp |
- | 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 46208126-46210813(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TATGATAAGGAAATG |
SmilChr01G005118 |
Chr01 | NC_080387.1:68979378-68979392promoter 内 2974-2988 bp |
+ | 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 68977183-68978365(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATGGATAAGATAGCC |
SmilChr03G002609 |
Chr03 | NC_080389.1:41501389-41501403promoter 内 2792-2806 bp |
- | 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 41500089-41500194(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CTTTTCCTTATCAAT |
SmilChr01G000660 |
Chr01 | NC_080387.1:14725464-14725478promoter 内 2784-2798 bp |
+ | 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 14726681-14734421(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CTTCACCTTATCCCG |
SmilChr03G001002 |
Chr03 | NC_080389.1:11342612-11342626promoter 内 2772-2786 bp |
+ | 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 11338375-11341397(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATGGATAAGATGTTA |
SmilChr03G002281 |
Chr03 | NC_080389.1:35999552-35999566promoter 内 2448-2462 bp |
- | 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 35996670-35998013(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CAACGCCTTATCCAA |
SmilChr02G000838 |
Chr02 | NC_080388.1:14208962-14208976promoter 内 2429-2443 bp |
+ | 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 14204480-14207404(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TGAGATAAGGTAATT |
SmilChr03G001783 |
Chr03 | NC_080389.1:24392860-24392874promoter 内 2334-2348 bp |
- | 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 24388463-24391207(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AGGGATCTTATCCAC |
SmilChr01G000417 |
Chr01 | NC_080387.1:8435627-8435641promoter 内 2189-2203 bp |
- | 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 8432765-8433829(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CAACGCCTTATCCAA |
SmilChr03G001904 |
Chr03 | NC_080389.1:26602013-26602027promoter 内 2106-2120 bp |
+ | 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 26595830-26600132(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AAGGATAATGATAAT |
SmilChr01G001574 |
Chr01 | NC_080387.1:29785128-29785142promoter 内 2100-2114 bp |
+ | 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 29787029-29788408(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CAACGCCTTATCCAA |
SmilChr02G003808 |
Chr02 | NC_080388.1:59716058-59716072promoter 内 1652-1666 bp |
+ | 2335 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 59712965-59713723(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAGGGTGAAG |
SmilChr01G001379 |
Chr01 | NC_080387.1:27190422-27190436promoter 内 1625-1639 bp |
+ | 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 27187377-27188060(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TAGGATAATGTTTAT |
SmilChr02G002272 |
Chr02 | NC_080388.1:40188993-40189007promoter 内 1539-1553 bp |
+ | 2448 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 40185049-40186545(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTGGATAAGATCTAC |
SmilChr02G000844 |
Chr02 | NC_080388.1:14332397-14332411promoter 内 1469-1483 bp |
- | 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 14329173-14329879(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TGTAACCTTATCAAT |
SmilChr03G002664 |
Chr03 | NC_080389.1:42297453-42297467promoter 内 1233-1247 bp |
- | 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 42300221-42301075(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATGGATAAGGCAGAA |
SmilChr02G005474 |
Chr02 | NC_080388.1:74987892-74987906promoter 内 1225-1239 bp |
+ | 2762 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 74990668-74992966(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATCTACCTTATCTCT |
SmilChr02G000006 |
Chr02 | NC_080388.1:53850-53864promoter 内 1165-1179 bp |
- | 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 56686-58534(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAACGTCTGT |
SmilChr02G004518 |
Chr02 | NC_080388.1:67698677-67698691promoter 内 1021-1035 bp |
+ | 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 67701657-67703416(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TTCTGCCTTATCTTC |
SmilChr01G005923 |
Chr01 | NC_080387.1:75039144-75039158promoter 内 587-601 bp |
- | 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 75042558-75043921(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
ATTGATAAGGAAAAG |
SmilChr02G001516 |
Chr02 | NC_080388.1:28279193-28279207promoter 内 75-89 bp |
- | 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 28275200-28275281(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
CGTCGCCTTATCCTT |
SmilChr02G003040 |
Chr02 | NC_080388.1:51142384-51142398promoter 内 12-26 bp |
- | 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 51146373-51148060(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
AAGGATAAGATCTCG |
SmilChr02G005129 |
Chr02 | NC_080388.1:72757268-72757282promoter 内 6-20 bp |
- | 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 2 | 72761263-72763967(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
GAGGATAATATTGAA |
SmilChr03G000560 |
Chr03 | NC_080389.1:6092404-6092418promoter 内 3982-3996 bp |
- | 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 1 | 6092423-6094576(+) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TATGATAAGGAAATG |
SmilChr01G003205 |
Chr01 | NC_080387.1:50813563-50813577promoter 内 3833-3847 bp |
+ | 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.8/ 100 | 1 | 50811557-50813409(-) |
SMil_00001784-RA_Salv |
MP00191 |
TGGGATAAGGAATTT |