转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 49 / 136 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002971 Chr08 NC_080394.1:29729555-29729565promoter 内 2011-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 29731545-29734691(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr01G000324 Chr01 NC_080387.1:6406989-6406999promoter 内 1692-1702 bp + 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 6409298-6410059(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCA
SmilChr04G003456 Chr04 NC_080390.1:51057990-51058000promoter 内 1372-1382 bp + 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 51049952-51055371(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr07G001731 Chr07 NC_080393.1:14726680-14726690promoter 内 1329-1339 bp + 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 14721586-14724018(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr04G002126 Chr04 NC_080390.1:34259925-34259935promoter 内 1128-1138 bp - 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 34262798-34264532(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr01G001938 Chr01 NC_080387.1:34574016-34574026promoter 内 1060-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 34576957-34578623(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr02G002789 Chr02 NC_080388.1:47957399-47957409promoter 内 761-771 bp + 3230 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 47946256-47954169(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACC
SmilChr03G003642 Chr03 NC_080389.1:55102237-55102247promoter 内 750-760 bp + 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 55097370-55098996(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCTGAGCC
SmilChr06G000453 Chr06 NC_080392.1:3670307-3670317promoter 内 734-744 bp + 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 3673574-3675178(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCC
SmilChr08G003855 Chr08 NC_080394.1:45081149-45081159promoter 内 388-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 45062881-45077546(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr04G000914 Chr04 NC_080390.1:11905577-11905587promoter 内 287-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 11900446-11901873(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCC
SmilChr03G002153 Chr03 NC_080389.1:33490099-33490109promoter 内 219-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 33483435-33486327(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr07G004091 Chr07 NC_080393.1:52452828-52452838promoter 内 114-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 52456715-52458400(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr02G003667 Chr02 NC_080388.1:58055012-58055022promoter 内 36-46 bp - 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58058977-58066952(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCC
SmilChr04G001540 Chr04 NC_080390.1:25369669-25369679promoter 内 3890-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25364426-25369568(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr03G001652 Chr03 NC_080389.1:21461950-21461960promoter 内 3802-3812 bp - 189 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21462149-21463123(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACC
SmilChr05G000129 Chr05 NC_080391.1:1040095-1040105promoter 内 3773-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1040323-1044183(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr04G000653 Chr04 NC_080390.1:7378663-7378673promoter 内 3768-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7378896-7382441(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr06G001761 Chr06 NC_080392.1:20592780-20592790promoter 内 3668-3678 bp + 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20591004-20592457(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCC
SmilChr06G001483 Chr06 NC_080392.1:15803464-15803474promoter 内 3665-3675 bp - 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15803800-15806209(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCTGAGCC
SmilChr08G003597 Chr08 NC_080394.1:38990078-38990088promoter 内 3458-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38987802-38989545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr04G001123 Chr04 NC_080390.1:16281759-16281769promoter 内 3445-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16282315-16283636(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr01G002851 Chr01 NC_080387.1:47088032-47088042promoter 内 3444-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47088589-47089658(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTC
SmilChr08G004558 Chr08 NC_080394.1:55196246-55196256promoter 内 3372-3382 bp - 619 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55177176-55195627(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCG
SmilChr02G001354 Chr02 NC_080388.1:25301610-25301620promoter 内 3344-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25302267-25304190(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr07G003532 Chr07 NC_080393.1:40745509-40745519promoter 内 3338-3348 bp - 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40743774-40744856(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCG
SmilChr01G003226 Chr01 NC_080387.1:51034091-51034101promoter 内 3290-3300 bp - 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51030576-51033390(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr02G001361 Chr02 NC_080388.1:25508879-25508889promoter 内 3258-3268 bp - 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25509622-25511800(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCTGAGCC
SmilChr03G003224 Chr03 NC_080389.1:49908914-49908924promoter 内 3195-3205 bp - 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49909720-49910844(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G002061 Chr01 NC_080387.1:36451066-36451076promoter 内 3183-3193 bp + 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36447473-36450258(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr01G004015 Chr01 NC_080387.1:58557310-58557320promoter 内 3174-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 58558137-58558208(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCC
SmilChr04G002453 Chr04 NC_080390.1:39267541-39267551promoter 内 3122-3132 bp + 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39264621-39266672(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCTGAGCC
SmilChr03G003106 Chr03 NC_080389.1:48203534-48203544promoter 内 3096-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48204439-48205522(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr03G003105 Chr03 NC_080389.1:48194031-48194041promoter 内 3094-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48194938-48196021(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G002083 Chr01 NC_080387.1:36776072-36776082promoter 内 3089-3099 bp + 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36770893-36775170(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr02G001177 Chr02 NC_080388.1:21637092-21637102promoter 内 3080-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21638013-21644647(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGTG
SmilChr02G004241 Chr02 NC_080388.1:64608326-64608336promoter 内 3076-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64609251-64610499(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr02G004242 Chr02 NC_080388.1:64617972-64617982promoter 内 3076-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64618897-64620145(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr07G003104 Chr07 NC_080393.1:32869695-32869705promoter 内 3066-3076 bp - 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32870630-32872973(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr07G003299 Chr07 NC_080393.1:34863958-34863968promoter 内 3058-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 34864901-34865876(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G003234 Chr01 NC_080387.1:51100704-51100714promoter 内 2948-2958 bp - 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51098630-51099661(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr06G000894 Chr06 NC_080392.1:8450945-8450955promoter 内 2921-2931 bp - 1070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8445897-8449875(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr06G000267 Chr06 NC_080392.1:1813822-1813832promoter 内 2864-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1810106-1812695(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G004252 Chr01 NC_080387.1:60805166-60805176promoter 内 2784-2794 bp - 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60806383-60807910(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr04G002494 Chr04 NC_080390.1:39837830-39837840promoter 内 2784-2794 bp - 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39835092-39836623(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr07G000447 Chr07 NC_080393.1:3141820-3141830promoter 内 2749-2759 bp - 1242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3137849-3140578(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr08G001283 Chr08 NC_080394.1:10219059-10219069promoter 内 2725-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10215608-10217793(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACC
SmilChr05G003539 Chr05 NC_080391.1:47260510-47260520promoter 内 2661-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47261850-47263928(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr06G003229 Chr06 NC_080392.1:45028129-45028139promoter 内 2561-2571 bp - 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45024344-45026699(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr03G002610 Chr03 NC_080389.1:41522308-41522318promoter 内 2555-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41520767-41520872(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACC