转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 51 / 143 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003684 Chr05 NC_080391.1:49972463-49972474promoter 内 3895-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49972262-49972368(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCT
SmilChr06G002128 Chr06 NC_080392.1:28623718-28623729promoter 内 3895-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28623824-28623930(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCT
SmilChr01G003939 Chr01 NC_080387.1:57724283-57724294promoter 内 3698-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 57724586-57724936(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
SmilChr07G002690 Chr07 NC_080393.1:26256034-26256045promoter 内 3637-3648 bp + 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26256398-26257794(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTC
SmilChr03G002756 Chr03 NC_080389.1:43812777-43812788promoter 内 3626-3637 bp + 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43808536-43812413(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAA
SmilChr03G002742 Chr03 NC_080389.1:43586072-43586083promoter 内 3621-3632 bp + 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43580843-43585703(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAA
SmilChr01G002120 Chr01 NC_080387.1:37220163-37220174promoter 内 3447-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 37220717-37221475(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
SmilChr01G002734 Chr01 NC_080387.1:45692211-45692222promoter 内 3382-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 45692830-45692988(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr01G003204 Chr01 NC_080387.1:50806432-50806443promoter 内 3181-3192 bp - 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50807252-50810251(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAA
SmilChr04G002466 Chr04 NC_080390.1:39487003-39487014promoter 内 3129-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39487875-39498206(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCTC
SmilChr03G004468 Chr03 NC_080389.1:62759906-62759917promoter 内 3069-3080 bp + 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62756420-62758985(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCGT
SmilChr03G004342 Chr03 NC_080389.1:61720928-61720939promoter 内 2898-2909 bp + 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 61722031-61724488(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr01G002668 Chr01 NC_080387.1:44898448-44898459promoter 内 2895-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44896410-44897353(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr08G000784 Chr08 NC_080394.1:5768751-5768762promoter 内 2882-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5766660-5767643(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTT
SmilChr05G002495 Chr05 NC_080391.1:27677095-27677106promoter 内 2660-2671 bp + 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 27669538-27675765(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr02G003042 Chr02 NC_080388.1:51166546-51166557promoter 内 2645-2656 bp - 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 51167902-51169515(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGT
SmilChr03G002575 Chr03 NC_080389.1:40974151-40974162promoter 内 2635-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 40971049-40972796(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr01G002121 Chr01 NC_080387.1:37220163-37220174promoter 内 2595-2606 bp + 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 37221569-37221931(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
SmilChr03G003757 Chr03 NC_080389.1:56686177-56686188promoter 内 2592-2603 bp - 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 56682950-56684779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAT
SmilChr05G004316 Chr05 NC_080391.1:56826706-56826717promoter 内 2519-2530 bp - 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 56828188-56831501(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGT
SmilChr03G003681 Chr03 NC_080389.1:55653123-55653134promoter 内 2471-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 55654653-55655777(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr07G002691 Chr07 NC_080393.1:26256034-26256045promoter 内 2458-2469 bp + 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26257577-26259206(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTC
SmilChr07G003687 Chr07 NC_080393.1:44377019-44377030promoter 内 2413-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44378607-44379071(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr07G003939 Chr07 NC_080393.1:49753878-49753889promoter 内 2332-2343 bp + 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49755547-49757114(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr06G001355 Chr06 NC_080392.1:14107601-14107612promoter 内 2292-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14103490-14105903(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr01G002735 Chr01 NC_080387.1:45692211-45692222promoter 内 2283-2294 bp + 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 45693929-45694047(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr08G003400 Chr08 NC_080394.1:35843456-35843467promoter 内 2205-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 35845252-35847474(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAA
SmilChr06G000846 Chr06 NC_080392.1:7996688-7996699promoter 内 2119-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7990069-7994817(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr04G001278 Chr04 NC_080390.1:20370905-20370916promoter 内 2106-2117 bp + 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 20363576-20369021(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr01G003184 Chr01 NC_080387.1:50604640-50604651promoter 内 2076-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50606565-50607204(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr03G004199 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632683promoter 内 2056-2067 bp - 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 60627061-60630738(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
SmilChr03G002384 Chr03 NC_080389.1:37654480-37654491promoter 内 2034-2045 bp - 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 37652021-37652524(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCTT
SmilChr01G004308 Chr01 NC_080387.1:61270058-61270069promoter 内 2028-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 61261478-61268096(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr08G002221 Chr08 NC_080394.1:20210619-20210630promoter 内 2012-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 20212608-20213448(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAG
SmilChr05G001707 Chr05 NC_080391.1:16301235-16301246promoter 内 1963-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 16303273-16303841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr08G001277 Chr08 NC_080394.1:10174927-10174938promoter 内 1920-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 10177008-10177612(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr07G002687 Chr07 NC_080393.1:26256034-26256045promoter 内 1900-1911 bp + 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26252601-26253944(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCGG
SmilChr01G005303 Chr01 NC_080387.1:70303299-70303310promoter 内 1751-1762 bp - 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 70305549-70306130(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCGG
SmilChr06G003009 Chr06 NC_080392.1:42976241-42976252promoter 内 1573-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42953956-42973824(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTT
SmilChr05G001941 Chr05 NC_080391.1:19779031-19779042promoter 内 1527-1538 bp - 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19774926-19776568(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr08G000932 Chr08 NC_080394.1:6905624-6905635promoter 内 1520-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6908105-6916562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr08G001972 Chr08 NC_080394.1:17414077-17414088promoter 内 1519-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17407466-17411606(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCTT
SmilChr08G000934 Chr08 NC_080394.1:6925183-6925194promoter 内 1502-1513 bp + 2488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6927682-6936138(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr04G001402 Chr04 NC_080390.1:22827875-22827886promoter 内 1467-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 22830409-22832070(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr03G004069 Chr03 NC_080389.1:59673023-59673034promoter 内 1464-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 59662715-59670497(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr02G000592 Chr02 NC_080388.1:8483410-8483421promoter 内 1425-1436 bp - 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 8471205-8480845(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr03G002498 Chr03 NC_080389.1:39794335-39794346promoter 内 1380-1391 bp - 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39788471-39791725(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr02G002122 Chr02 NC_080388.1:37994893-37994904promoter 内 1367-1378 bp - 2623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 37997527-38000094(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGT
SmilChr07G002235 Chr07 NC_080393.1:20548237-20548248promoter 内 1288-1299 bp + 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 20545463-20545535(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAA
SmilChr04G000732 Chr04 NC_080390.1:8702882-8702893promoter 内 1264-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 8697127-8700156(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAT