转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 51 / 136 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002319 Chr03 NC_080389.1:36555440-36555450promoter 内 576-586 bp - 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36550814-36552025(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCG
SmilChr06G001482 Chr06 NC_080392.1:15803464-15803474promoter 内 561-571 bp - 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15795913-15800034(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCA
SmilChr01G005342 Chr01 NC_080387.1:70644717-70644727promoter 内 554-564 bp + 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 70630561-70641280(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr02G003829 Chr02 NC_080388.1:59942851-59942861promoter 内 539-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59946313-59947037(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr04G002110 Chr04 NC_080390.1:34090080-34090090promoter 内 529-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 34084938-34086618(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr07G000630 Chr07 NC_080393.1:4258224-4258234promoter 内 525-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4251956-4254758(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr07G001290 Chr07 NC_080393.1:9924257-9924267promoter 内 504-514 bp + 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9927754-9931858(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr06G001912 Chr06 NC_080392.1:23099203-23099213promoter 内 419-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23092120-23095631(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr06G003228 Chr06 NC_080392.1:45028129-45028139promoter 内 409-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45017852-45024547(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr08G003643 Chr08 NC_080394.1:39860863-39860873promoter 内 368-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39864496-39865840(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr08G002341 Chr08 NC_080394.1:22100523-22100533promoter 内 365-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22092171-22096897(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr08G002968 Chr08 NC_080394.1:29714827-29714837promoter 内 362-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 29708349-29711198(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr02G002595 Chr02 NC_080388.1:45096999-45097009promoter 内 338-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45100662-45103349(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGG
SmilChr02G002640 Chr02 NC_080388.1:45795382-45795392promoter 内 338-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45799045-45801818(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGG
SmilChr08G002640 Chr08 NC_080394.1:25833282-25833292promoter 内 315-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25828414-25829606(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGTG
SmilChr08G001422 Chr08 NC_080394.1:11367844-11367854promoter 内 293-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11371552-11375094(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCTGAGCC
SmilChr05G000625 Chr05 NC_080391.1:4723235-4723245promoter 内 283-293 bp - 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4726953-4728804(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr02G002866 Chr02 NC_080388.1:48829248-48829258promoter 内 281-291 bp + 3710 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48820365-48825538(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr07G001922 Chr07 NC_080393.1:16642541-16642551promoter 内 280-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16646262-16647933(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr04G002829 Chr04 NC_080390.1:44400966-44400976promoter 内 271-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44388518-44397246(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr03G002502 Chr03 NC_080389.1:39859971-39859981promoter 内 251-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39863721-39864215(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr07G002810 Chr07 NC_080393.1:28135035-28135045promoter 内 218-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28130423-28131262(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr01G003272 Chr01 NC_080387.1:51435956-51435966promoter 内 211-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51428178-51432176(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGA
SmilChr06G000992 Chr06 NC_080392.1:9793196-9793206promoter 内 182-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9797015-9799451(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr07G003533 Chr07 NC_080393.1:40745509-40745519promoter 内 179-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40749331-40750435(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G000860 Chr01 NC_080387.1:18504790-18504800promoter 内 159-169 bp - 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18508632-18509078(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr06G001978 Chr06 NC_080392.1:25118760-25118770promoter 内 158-168 bp - 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25112193-25114927(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCA
SmilChr05G001283 Chr05 NC_080391.1:10977791-10977801promoter 内 155-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10969983-10973955(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr01G000502 Chr01 NC_080387.1:10193675-10193685promoter 内 146-156 bp - 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10187311-10189830(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACC
SmilChr08G002013 Chr08 NC_080394.1:17874867-17874877promoter 内 129-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17878739-17880536(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGA
SmilChr01G000178 Chr01 NC_080387.1:2917690-2917700promoter 内 102-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2911640-2913801(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCG
SmilChr01G002959 Chr01 NC_080387.1:48468125-48468135promoter 内 100-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48457651-48464234(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr06G001910 Chr06 NC_080392.1:23094399-23094409promoter 内 68-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23086690-23090476(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr08G003334 Chr08 NC_080394.1:34634940-34634950promoter 内 55-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 34638886-34640922(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCG
SmilChr01G002120 Chr01 NC_080387.1:37216767-37216777promoter 内 51-61 bp + 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 37220717-37221475(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCC
SmilChr01G002681 Chr01 NC_080387.1:45031650-45031660promoter 内 38-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45025964-45027697(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGG
SmilChr02G001688 Chr02 NC_080388.1:31112615-31112625promoter 内 3517-3527 bp + 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 5 31111086-31112141(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr07G002352 Chr07 NC_080393.1:21835145-21835155promoter 内 3894-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 21835252-21838471(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
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SmilChr08G002381 Chr08 NC_080394.1:22593127-22593137promoter 内 2396-2406 bp - 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 22594732-22597900(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr03G000106 Chr03 NC_080389.1:1184325-1184335promoter 内 981-991 bp - 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 1179413-1181315(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G001985 Chr03 NC_080389.1:29030246-29030256promoter 内 805-815 bp + 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 29033442-29034056(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCG
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SmilChr07G001564 Chr07 NC_080393.1:12805968-12805978promoter 内 3385-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 12806584-12831939(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G000399 Chr03 NC_080389.1:4368088-4368098promoter 内 3271-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 4365807-4367368(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G001709 Chr06 NC_080392.1:19661734-19661744promoter 内 3145-3155 bp - 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 19645195-19660888(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
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SmilChr05G003080 Chr05 NC_080391.1:38941325-38941335promoter 内 3015-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 38940005-38940349(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr05G003273 Chr05 NC_080391.1:42526170-42526180promoter 内 3015-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 42524850-42525194(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G003560 Chr07 NC_080393.1:41512465-41512475promoter 内 2820-2830 bp + 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 41511188-41511294(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT