转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 51 / 128 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004891 Chr01 NC_080387.1:66982725-66982736promoter 内 60-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 66977992-66978795(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGGA
SmilChr01G004238 Chr01 NC_080387.1:60710525-60710536promoter 内 3981-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 5 60710545-60711123(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAG
SmilChr01G000271 Chr01 NC_080387.1:5365557-5365568promoter 内 2564-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 5363352-5364131(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G004239 Chr01 NC_080387.1:60710525-60710536promoter 内 2507-2518 bp + 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 60712019-60715266(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAG
SmilChr01G000320 Chr01 NC_080387.1:6290795-6290806promoter 内 1770-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 6293026-6293592(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr01G000321 Chr01 NC_080387.1:6295879-6295890promoter 内 1770-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 6298110-6298676(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr01G004235 Chr01 NC_080387.1:60710525-60710536promoter 内 1547-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 60707062-60708082(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G001668 Chr01 NC_080387.1:30779162-30779173promoter 内 3864-3875 bp + 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 30777945-30779036(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTG
SmilChr01G001424 Chr01 NC_080387.1:27872879-27872890promoter 内 2620-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 27874260-27874855(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr01G000613 Chr01 NC_080387.1:13550637-13550648promoter 内 2032-2043 bp - 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 13552606-13552949(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr02G000677 Chr02 NC_080388.1:10563362-10563373promoter 内 1001-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 10566362-10570937(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAA
SmilChr01G000831 Chr01 NC_080387.1:17917201-17917212promoter 内 856-867 bp + 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 17909803-17914067(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G001509 Chr01 NC_080387.1:28922361-28922372promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 28925783-28929363(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr01G000046 Chr01 NC_080387.1:720864-720875promoter 内 565-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 724300-725876(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAG
SmilChr02G000531 Chr02 NC_080388.1:7305984-7305995promoter 内 435-446 bp - 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 7309550-7325735(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr01G000614 Chr01 NC_080387.1:13550637-13550648promoter 内 286-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 13554352-13558027(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr01G000732 Chr01 NC_080387.1:16288335-16288346promoter 内 3703-3714 bp - 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 16287167-16288048(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr01G004582 Chr01 NC_080387.1:63860697-63860708promoter 内 3120-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 63856577-63859827(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr01G004833 Chr01 NC_080387.1:66460850-66460861promoter 内 3020-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 66461831-66464241(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G000529 Chr01 NC_080387.1:10834132-10834143promoter 内 2944-2955 bp + 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 10832980-10833086(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTG
SmilChr01G003204 Chr01 NC_080387.1:50806113-50806124promoter 内 2862-2873 bp - 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 50807252-50810251(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTCA
SmilChr01G000240 Chr01 NC_080387.1:4493724-4493735promoter 内 2737-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4494988-4496928(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTG
SmilChr02G003460 Chr02 NC_080388.1:55895649-55895660promoter 内 2702-2713 bp - 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55896948-55897020(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTG
SmilChr01G003654 Chr01 NC_080387.1:54993831-54993842promoter 内 1957-1968 bp - 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 54995875-54999867(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTCA
SmilChr02G005548 Chr02 NC_080388.1:75461955-75461966promoter 内 1899-1910 bp - 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 75464057-75468855(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr02G004530 Chr02 NC_080388.1:67875485-67875496promoter 内 1791-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 67877695-67880252(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr02G003641 Chr02 NC_080388.1:57771016-57771027promoter 内 1603-1614 bp + 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57764398-57768629(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr02G004801 Chr02 NC_080388.1:70203188-70203199promoter 内 1358-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 70197661-70200556(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr01G005057 Chr01 NC_080387.1:68489185-68489196promoter 内 1345-1356 bp - 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 68491841-68495297(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr02G003643 Chr02 NC_080388.1:57771016-57771027promoter 内 1119-1130 bp + 2871 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57773898-57775283(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr02G004641 Chr02 NC_080388.1:68857339-68857350promoter 内 660-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 68860680-68866969(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGT
SmilChr03G000079 Chr03 NC_080389.1:961322-961333promoter 内 557-568 bp + 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 955177-957889(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G002085 Chr01 NC_080387.1:36823420-36823431promoter 内 463-474 bp - 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 36818949-36819893(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAA
SmilChr02G003199 Chr02 NC_080388.1:53154399-53154410promoter 内 361-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 53146247-53150770(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr02G004640 Chr02 NC_080388.1:68857339-68857350promoter 内 3898-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 68857442-68859086(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGT
SmilChr01G000203 Chr01 NC_080387.1:3482575-3482586promoter 内 3267-3278 bp + 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3483309-3484678(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60710525-60710536promoter 内 3024-3035 bp + 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60709018-60709559(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr01G001144 Chr01 NC_080387.1:23383569-23383580promoter 内 2924-2935 bp + 1066 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 23382398-23382503(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTG
SmilChr03G001694 Chr03 NC_080389.1:22457397-22457408promoter 内 2895-2906 bp - 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 22458503-22458609(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTG
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60710525-60710536promoter 内 2570-2581 bp + 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60708292-60709105(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTC
SmilChr02G001845 Chr02 NC_080388.1:33668394-33668405promoter 内 2400-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33663062-33666804(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTG
SmilChr01G004003 Chr01 NC_080387.1:58428993-58429004promoter 内 2361-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58430633-58431337(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr01G002125 Chr01 NC_080387.1:37253519-37253530promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37245846-37251767(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr03G001679 Chr03 NC_080389.1:22032424-22032435promoter 内 1912-1923 bp - 2078 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 22034513-22036165(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr03G000581 Chr03 NC_080389.1:6457363-6457374promoter 内 1879-1890 bp - 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6459485-6466487(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCC
SmilChr01G003992 Chr01 NC_080387.1:58351082-58351093promoter 内 1627-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58345415-58348719(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAG
SmilChr01G002360 Chr01 NC_080387.1:40772857-40772868promoter 内 1492-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40764308-40770359(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGAA
SmilChr01G002990 Chr01 NC_080387.1:48829341-48829352promoter 内 1293-1304 bp - 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 48823379-48826644(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAG
SmilChr03G001063 Chr03 NC_080389.1:12336879-12336890promoter 内 1056-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12332113-12333945(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGAA
SmilChr03G001357 Chr03 NC_080389.1:15944843-15944854promoter 内 1000-1011 bp + 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 15940801-15941853(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCG