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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004708; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00017834-RA_Salv SmilChr01G004708 WRKY XP_057787833.1 MP00251 AACGTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9713 个结合位点 6140 个候选靶基因 第 53 / 123 下载 TSV

上一页 53 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50580389-50580403promoter 内 1152-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCCGTTGACTCGTTA
SmilChr01G003694 Chr01 NC_080387.1:55305723-55305737promoter 内 1145-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55300022-55302881(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AGAGAAGTCAATGTC
SmilChr01G005321 Chr01 NC_080387.1:70426952-70426966promoter 内 1100-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70429853-70432586(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACCAAAGTCAAAATT
SmilChr02G001845 Chr02 NC_080388.1:33669696-33669710promoter 内 1095-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33663062-33666804(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGCTTTGACTTAATC
SmilChr01G001235 Chr01 NC_080387.1:24768098-24768112promoter 内 1074-1088 bp + 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24771025-24771847(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GATGTTGACTTATGA
SmilChr01G002346 Chr01 NC_080387.1:40602015-40602029promoter 内 1049-1063 bp + 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40593257-40599077(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TTCATGGTCAACGAT
SmilChr02G003662 Chr02 NC_080388.1:58007064-58007078promoter 内 1019-1033 bp - 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58010046-58016971(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTTAAAGTCAAGCCC
SmilChr01G002412 Chr01 NC_080387.1:41481003-41481017promoter 内 990-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41484014-41484626(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCTTTTGACTTCTCT
SmilChr02G002253 Chr02 NC_080388.1:39972032-39972046promoter 内 900-914 bp - 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39965687-39968945(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTTTTTGACTTGTGT
SmilChr02G004584 Chr02 NC_080388.1:68333691-68333705promoter 内 787-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 68336905-68341258(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TTGCTTGACTTTTGT
SmilChr01G005174 Chr01 NC_080387.1:69489240-69489254promoter 内 774-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69482550-69486027(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CAAGAAGTCAAGACC
SmilChr02G004799 Chr02 NC_080388.1:70199082-70199096promoter 内 694-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70188690-70195789(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TTGCTTGACTTTCGC
SmilChr01G000631 Chr01 NC_080387.1:14187411-14187425promoter 内 661-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14190751-14204563(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCGAAAGTCAAAATA
SmilChr02G002728 Chr02 NC_080388.1:47195305-47195319promoter 内 492-506 bp + 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47198814-47200452(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GAATTTGACTTGTTC
SmilChr01G005677 Chr01 NC_080387.1:73046922-73046936promoter 内 466-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 73050457-73051714(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACAAAAGTCAAGCAA
SmilChr01G002066 Chr01 NC_080387.1:36524437-36524451promoter 内 452-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36516729-36520902(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AGAGTTGACTTTCAT
SmilChr02G000179 Chr02 NC_080388.1:2283225-2283239promoter 内 331-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2286895-2288286(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCTGTTGACTTGAAT
SmilChr01G004808 Chr01 NC_080387.1:66303764-66303778promoter 内 247-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66295259-66300024(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AAAAAAGTCAAATGT
SmilChr01G004682 Chr01 NC_080387.1:64896151-64896165promoter 内 174-188 bp + 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64890235-64892338(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ATGCCAGTCAACGGT
SmilChr01G003889 Chr01 NC_080387.1:57201116-57201130promoter 内 168-182 bp + 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57204949-57209344(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTTGTTGACTGGTTT
SmilChr02G004347 Chr02 NC_080388.1:65748014-65748028promoter 内 128-142 bp + 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65742018-65744155(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCGAAAGTCAAAATA
SmilChr02G004016 Chr02 NC_080388.1:62460622-62460636promoter 内 60-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62454021-62456695(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACCTTTGACTTGATT
SmilChr02G004087 Chr02 NC_080388.1:63145346-63145360promoter 内 14-28 bp + 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 63149333-63150023(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCACTTGACTTTGAG
SmilChr02G001959 Chr02 NC_080388.1:35375870-35375884promoter 内 2394-2408 bp + 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 6 35377477-35377821(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCCGTTGACCAAGCA
SmilChr02G001791 Chr02 NC_080388.1:32667459-32667473promoter 内 1637-1651 bp - 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 5 32662522-32665109(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCGGTTGACTTGCAA
SmilChr02G001233 Chr02 NC_080388.1:22634334-22634348promoter 内 3577-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 22633016-22633924(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTATTTGACTTTGCT
SmilChr01G004661 Chr01 NC_080387.1:64718345-64718359promoter 内 3405-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 64718941-64721423(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CCAAAAGTCAAGCTG
SmilChr01G003660 Chr01 NC_080387.1:55026346-55026360promoter 内 3070-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 55020547-55025429(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GATTAAGTCAACCCC
SmilChr02G000681 Chr02 NC_080388.1:10744706-10744720promoter 内 1580-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 10718197-10742299(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGCAAAGTCAAATAT
SmilChr01G000656 Chr01 NC_080387.1:14621858-14621872promoter 内 1540-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 14614324-14619411(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ATGCTTGACTTTTAT
SmilChr01G006090 Chr01 NC_080387.1:76391025-76391039promoter 内 3597-3611 bp + 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 76391429-76392488(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ATTGTTGACTTCTCA
SmilChr02G004801 Chr02 NC_080388.1:70200958-70200972promoter 内 3585-3599 bp + 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 70197661-70200556(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CCCTAGGTCAACGTA
SmilChr02G001308 Chr02 NC_080388.1:24322374-24322388promoter 内 3570-3584 bp + 417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 24321407-24321957(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CGACAAGTCAAGCAT
SmilChr02G003305 Chr02 NC_080388.1:54313131-54313145promoter 内 3530-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 54311953-54312674(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCACTTGACTTTTTT
SmilChr01G003506 Chr01 NC_080387.1:53638364-53638378promoter 内 3175-3189 bp - 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 53639190-53642825(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCACTAGTCAACCGG
SmilChr01G001350 Chr01 NC_080387.1:26787175-26787189promoter 内 3079-3093 bp + 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 26782969-26786267(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GCACTAGTCAACCGG
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SmilChr02G002067 Chr02 NC_080388.1:37222056-37222070promoter 内 2563-2577 bp - 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 37220526-37220632(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CCGGTTGACTAGTGC
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SmilChr02G000661 Chr02 NC_080388.1:10132168-10132182promoter 内 206-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 10115954-10128387(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGCAAAGTCAAATAT
SmilChr01G003227 Chr01 NC_080387.1:51041272-51041286promoter 内 3971-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 51039238-51041256(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCAAAAGTCAAAATT