Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001059; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014491-RA_Salv SmilChr06G001059 Dof XP_057768449.1 MP00402 TTTTTTTTTTTTTTACTTTTT

可能结合的靶基因

9875 个结合位点 6278 个候选靶基因 第 54 / 126 下载 TSV

上一页 54 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002981 Chr01 NC_080387.1:48739827-48739847promoter 内 1338-1358 bp - 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 48742490-48744446(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTCAAGAATGAAGATA
SmilChr01G005609 Chr01 NC_080387.1:72644951-72644971promoter 内 1100-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 72636647-72642070(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTTGCTCTTT
SmilChr01G002329 Chr01 NC_080387.1:40448385-40448405promoter 内 3962-3982 bp + 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 40448424-40449277(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGGTTTCTAATTTTACTTTTC
SmilChr01G004387 Chr01 NC_080387.1:62044039-62044059promoter 内 3925-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 62044115-62047497(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAAAAAAATTATT
SmilChr01G000586 Chr01 NC_080387.1:12667745-12667765promoter 内 3908-3928 bp - 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 12667289-12667672(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCCCCGTTCCGCTTACTTTAT
SmilChr01G005181 Chr01 NC_080387.1:69533119-69533139promoter 内 3649-3669 bp - 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 69533471-69535820(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGGAGAAAAATGCTG
SmilChr01G003153 Chr01 NC_080387.1:50325777-50325797promoter 内 3411-3431 bp - 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 50323980-50325207(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTCCTTTTTTGAAACTTTTT
SmilChr01G004386 Chr01 NC_080387.1:62023228-62023248promoter 内 3378-3398 bp - 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 62023851-62031540(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAAAAAAATTATT
SmilChr01G002116 Chr01 NC_080387.1:37187509-37187529promoter 内 3249-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 37188261-37189920(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGCTTTTTATACTTACTTTTG
SmilChr01G002856 Chr01 NC_080387.1:47134157-47134177promoter 内 3101-3121 bp + 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 47135057-47139130(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TACTTTACACTTTCACTTTTT
SmilChr02G001671 Chr02 NC_080388.1:30979865-30979885promoter 内 3029-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 30980837-30982737(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTGGAAGAGGCAGAA
SmilChr02G005283 Chr02 NC_080388.1:73869182-73869202promoter 内 2892-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 73866389-73868093(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTCTCTTTCT
SmilChr02G000798 Chr02 NC_080388.1:13264395-13264415promoter 内 2832-2852 bp + 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 13265564-13268160(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGTTTACTTGTTTAACTTTTT
SmilChr01G000113 Chr01 NC_080387.1:1940534-1940554promoter 内 2786-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 1941749-1946063(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCGTCTAATTTTTAACTTTTT
SmilChr01G002433 Chr01 NC_080387.1:41893092-41893112promoter 内 2753-2773 bp - 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 41894340-41895302(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAGATGGAGTAAAAG
SmilChr01G005134 Chr01 NC_080387.1:69142572-69142592promoter 内 2715-2735 bp - 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 69141234-69141306(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GCCATTTTCCTACTACTTTTG
SmilChr01G002855 Chr01 NC_080387.1:47134157-47134177promoter 内 2558-2578 bp + 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 47129976-47132734(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAGTGTAAAGTA
SmilChr02G005576 Chr02 NC_080388.1:75618246-75618266promoter 内 2486-2506 bp + 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 75619761-75623495(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTATATTCTTTCACTTTTT
SmilChr02G005270 Chr02 NC_080388.1:73782139-73782159promoter 内 2389-2409 bp - 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 73778442-73780547(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTATTTGTTTCTTTTC
SmilChr01G004756 Chr01 NC_080387.1:65756715-65756735promoter 内 1733-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 65758983-65762736(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTCTCTTTCT
SmilChr01G006089 Chr01 NC_080387.1:76376863-76376883promoter 内 1722-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 76379142-76387200(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAATAAAAAAAATAT
SmilChr01G003990 Chr01 NC_080387.1:58326063-58326083promoter 内 1452-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 58320695-58323534(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTAAGAGAGCAAACC
SmilChr03G000341 Chr03 NC_080389.1:3875906-3875926promoter 内 1403-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 3871001-3873328(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAAATGTAAATGA
SmilChr01G004574 Chr01 NC_080387.1:63794030-63794050promoter 内 1187-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 63789701-63791236(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTCTGCACTTGTCACTTTTT
SmilChr01G003172 Chr01 NC_080387.1:50530948-50530968promoter 内 1013-1033 bp + 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 50522332-50527980(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAGTGAAATGTT
SmilChr01G006119 Chr01 NC_080387.1:76715858-76715878promoter 内 947-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 76718912-76777689(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTACAAAAAAAATTA
SmilChr02G002869 Chr02 NC_080388.1:48880770-48880790promoter 内 727-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 48884044-48887808(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CACTTCCTCGGTTTACTTTTC
SmilChr01G003314 Chr01 NC_080387.1:51867461-51867481promoter 内 373-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 51871089-51871664(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGCTAACATAAAAAAAA
SmilChr01G005182 Chr01 NC_080387.1:69533119-69533139promoter 内 183-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 69536937-69538900(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGGAGAAAAATGCTG
SmilChr02G003872 Chr02 NC_080388.1:60752896-60752916promoter 内 168-188 bp - 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 60756729-60759180(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTCAAAAAGAGGATTG
SmilChr01G004783 Chr01 NC_080387.1:66028808-66028828promoter 内 3958-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66028084-66028785(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTCTCTCTTCCTAAACTTTTT
SmilChr02G004585 Chr02 NC_080388.1:68343606-68343626promoter 内 3845-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 68343762-68346106(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATCTTCTCATTTACTTTAT
SmilChr01G004944 Chr01 NC_080387.1:67548365-67548385promoter 内 3796-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 67546952-67548180(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTAAAAATTGGGGTA
SmilChr01G001556 Chr01 NC_080387.1:29585886-29585906promoter 内 3616-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29586271-29592615(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAGAAAAATGAATAC
SmilChr01G004819 Chr01 NC_080387.1:66378896-66378916promoter 内 3602-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66379295-66382038(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TACCCCATTCATTTACTTTTC
SmilChr01G001797 Chr01 NC_080387.1:32831138-32831158promoter 内 3527-3547 bp - 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32828472-32830684(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GTGTTTTTACTCTTACTTTTC
SmilChr01G004702 Chr01 NC_080387.1:65134025-65134045promoter 内 3494-3514 bp + 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 65130043-65133538(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAATAAAATTAGA
SmilChr01G005790 Chr01 NC_080387.1:73995277-73995297promoter 内 3422-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 73995856-73999624(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAGAAGTAGAAATTT
SmilChr01G005939 Chr01 NC_080387.1:75133042-75133062promoter 内 3416-3436 bp + 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 75131935-75132477(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTAGGATGAAAAGAA
SmilChr02G004326 Chr02 NC_080388.1:65546327-65546347promoter 内 3341-3361 bp + 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 65546987-65548788(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTATTTTTTTTATAACTTTTT
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54659470-54659490promoter 内 3204-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54660267-54661448(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTCTTTGATTTTACTTTAT
SmilChr01G001145 Chr01 NC_080387.1:23413244-23413264promoter 内 3196-3216 bp + 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 23414049-23416919(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ACCCATGTTTTCTTACTTTTT
SmilChr01G003863 Chr01 NC_080387.1:56896226-56896246promoter 内 3161-3181 bp + 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56891702-56895406(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAGTAAAGATAGAAA
SmilChr03G000542 Chr03 NC_080389.1:5887194-5887214promoter 内 3152-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5888043-5890586(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGTAAAGAACAAATGCA
SmilChr01G004490 Chr01 NC_080387.1:63035707-63035727promoter 内 3024-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63036684-63038569(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATATTGTGTTTTCTACTTTTT
SmilChr01G000679 Chr01 NC_080387.1:14998095-14998115promoter 内 2991-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 14999105-15003423(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CGAAAGAAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr01G003865 Chr01 NC_080387.1:56896226-56896246promoter 内 2940-2960 bp + 1041 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56897287-56900336(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTCTATCTTTACTACTTTTC
SmilChr02G002673 Chr02 NC_080388.1:46330844-46330864promoter 内 2847-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 46331998-46335353(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGGACGAGTAAGCCC
SmilChr01G005559 Chr01 NC_080387.1:72410179-72410199promoter 内 2801-2821 bp + 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 72406073-72408999(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAAATGAAAAATGT
SmilChr01G001497 Chr01 NC_080387.1:28819917-28819937promoter 内 2740-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 28821178-28822257(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTTAAAAAAAAAATA