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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 56 / 148 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001638 Chr02 NC_080388.1:30382579-30382592promoter 内 2805-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30379580-30381396(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTCCA
SmilChr01G003985 Chr01 NC_080387.1:58286132-58286145promoter 内 2552-2565 bp - 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58287581-58288554(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCGCGTGACCCTCC
SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1903530-1903543promoter 内 2224-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGACACACGTGG
SmilChr01G003313 Chr01 NC_080387.1:51845327-51845340promoter 内 2200-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51847128-51853630(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATGAC
SmilChr02G003385 Chr02 NC_080388.1:54964309-54964322promoter 内 2064-2077 bp - 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54958479-54962385(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATCACACGTGG
SmilChr02G005098 Chr02 NC_080388.1:72545698-72545711promoter 内 2038-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72541437-72543748(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCTTTT
SmilChr04G002691 Chr04 NC_080390.1:42323584-42323597promoter 内 1973-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42319543-42321569(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGCTCACGTGT
SmilChr06G002928 Chr06 NC_080392.1:42148822-42148835promoter 内 1831-1844 bp + 2157 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42150992-42153855(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAACTCCACGTGG
SmilChr04G003867 Chr04 NC_080390.1:54580261-54580274promoter 内 1687-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54576674-54577960(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAACTGCACGTGG
SmilChr07G002463 Chr07 NC_080393.1:23171309-23171322promoter 内 1527-1540 bp + 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 23165307-23168848(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGGTACG
SmilChr01G004600 Chr01 NC_080387.1:63992886-63992899promoter 内 1475-1488 bp - 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63989068-63990373(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGTGCACACGTGG
SmilChr01G003769 Chr01 NC_080387.1:56054889-56054902promoter 内 1467-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56050375-56052368(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTGTGCT
SmilChr01G004601 Chr01 NC_080387.1:63992886-63992899promoter 内 1460-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63995427-64002877(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCACCG
SmilChr02G002977 Chr02 NC_080388.1:50325890-50325903promoter 内 1452-1465 bp + 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 50328439-50330654(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAAATCACGTGG
SmilChr02G000738 Chr02 NC_080388.1:11958246-11958259promoter 内 1441-1454 bp + 2547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 11952330-11955699(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGACACG
SmilChr02G002883 Chr02 NC_080388.1:49104380-49104393promoter 内 1427-1440 bp - 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49099623-49101819(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAAATCACGTGG
SmilChr07G003720 Chr07 NC_080393.1:45015313-45015326promoter 内 1367-1380 bp - 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45017947-45020376(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATGAC
SmilChr07G004346 Chr07 NC_080393.1:56001917-56001930promoter 内 1367-1380 bp + 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56004551-56008125(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGGCAACACGTGG
SmilChr01G003983 Chr01 NC_080387.1:58286132-58286145promoter 内 1343-1356 bp - 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58281499-58283487(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGGGTCACGCGC
SmilChr02G005100 Chr02 NC_080388.1:72545698-72545711promoter 内 1227-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72548472-72550760(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAGGTCACGTGA
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SmilChr01G004692 Chr01 NC_080387.1:64982592-64982605promoter 内 1147-1160 bp + 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64979087-64979751(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACATTCG
SmilChr04G000363 Chr04 NC_080390.1:3638477-3638490promoter 内 1079-1092 bp - 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3641399-3644058(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCGTATG
SmilChr07G004228 Chr07 NC_080393.1:54561316-54561329promoter 内 1049-1062 bp - 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54564268-54565857(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATGAC
SmilChr08G001564 Chr08 NC_080394.1:12869020-12869033promoter 内 689-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12864559-12865721(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCGAG
SmilChr05G004140 Chr05 NC_080391.1:55366189-55366202promoter 内 662-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 55369528-55369854(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTTCC
SmilChr02G003110 Chr02 NC_080388.1:52081310-52081323promoter 内 471-484 bp - 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52075593-52077793(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGGAAACACGTGG
SmilChr06G000982 Chr06 NC_080392.1:9592301-9592314promoter 内 314-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9595988-9599731(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTACCGCACGTGG
SmilChr01G003251 Chr01 NC_080387.1:51231172-51231185promoter 内 302-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51223504-51227486(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTGTGCT
SmilChr08G000466 Chr08 NC_080394.1:3328115-3328128promoter 内 297-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3323924-3324424(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCTTAG
SmilChr02G005551 Chr02 NC_080388.1:75486230-75486243promoter 内 279-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 75489952-75493024(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGTTCT
SmilChr01G005106 Chr01 NC_080387.1:68852165-68852178promoter 内 3309-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 68852857-68853840(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAATGCCACGTGG
SmilChr01G003641 Chr01 NC_080387.1:54910979-54910992promoter 内 4-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 54914976-54919283(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTGCCACGTGG
SmilChr03G004666 Chr03 NC_080389.1:64122473-64122486promoter 内 3960-3973 bp + 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 64116213-64122445(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCTAT
SmilChr02G003098 Chr02 NC_080388.1:51847976-51847989promoter 内 2872-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 51843357-51846860(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGATCTC
SmilChr03G002097 Chr03 NC_080389.1:32419516-32419529promoter 内 2485-2498 bp + 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 32421032-32421138(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCCACACGTGG
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SmilChr03G001952 Chr03 NC_080389.1:27894166-27894179promoter 内 2339-2352 bp + 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 27895828-27895934(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCCACACGTGG
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SmilChr03G002661 Chr03 NC_080389.1:42272231-42272244promoter 内 1254-1267 bp - 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 42265706-42269497(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAACGTCACGTGA
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SmilChr05G002616 Chr05 NC_080391.1:29434697-29434710promoter 内 866-879 bp + 3122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 29428360-29431575(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACTCTC
SmilChr02G004116 Chr02 NC_080388.1:63453944-63453957promoter 内 535-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 63457410-63457976(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACACTAT
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SmilChr01G003624 Chr01 NC_080387.1:54794336-54794349promoter 内 190-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 54798147-54802830(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTGCCACGTGG
SmilChr02G003492 Chr02 NC_080388.1:56163070-56163083promoter 内 3985-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56163086-56165043(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTGCAGTCACGTGG
SmilChr05G004350 Chr05 NC_080391.1:57109508-57109521promoter 内 3961-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57109548-57113079(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCATTT
SmilChr04G000467 Chr04 NC_080390.1:5000558-5000571promoter 内 3942-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5000617-5003096(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTTAA