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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 56 / 141 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001145 Chr06 NC_080392.1:11561057-11561071promoter 内 2475-2489 bp - 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11562583-11584016(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGACGATC
SmilChr01G004526 Chr01 NC_080387.1:63450404-63450418promoter 内 2468-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 63451937-63461276(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCGTCGGTGATGA
SmilChr06G002071 Chr06 NC_080392.1:27322423-27322437promoter 内 2438-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27323986-27327025(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTCG
SmilChr02G001216 Chr02 NC_080388.1:22370811-22370825promoter 内 2432-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22368393-22369256(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTACACCGACGCAG
SmilChr07G003501 Chr07 NC_080393.1:39884624-39884638promoter 内 2429-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39886196-39889086(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTCG
SmilChr02G000290 Chr02 NC_080388.1:3681612-3681626promoter 内 2412-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3679397-3680037(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCTCGCCGACAAAA
SmilChr01G000100 Chr01 NC_080387.1:1810640-1810654promoter 内 2349-2363 bp + 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1806014-1809002(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTCG
SmilChr01G000099 Chr01 NC_080387.1:1801890-1801904promoter 内 2348-2362 bp + 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1797263-1800251(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTCG
SmilChr08G000747 Chr08 NC_080394.1:5524327-5524341promoter 内 2296-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5520412-5522636(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACCCCG
SmilChr01G000242 Chr01 NC_080387.1:4506980-4506994promoter 内 2276-2290 bp + 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4501786-4505269(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCGCACCGACGTCG
SmilChr08G001078 Chr08 NC_080394.1:8294501-8294515promoter 内 2273-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8296229-8298457(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCGCCG
SmilChr03G001748 Chr03 NC_080389.1:23724386-23724400promoter 内 2265-2279 bp + 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23719198-23722664(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCGCACCGACGTCG
SmilChr05G004347 Chr05 NC_080391.1:57098062-57098076promoter 内 2188-2202 bp + 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57093444-57096263(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAATCACCGACAGCT
SmilChr08G002070 Chr08 NC_080394.1:18565080-18565094promoter 内 2162-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18560281-18563255(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATTGTCGGTAGACG
SmilChr02G000641 Chr02 NC_080388.1:9701498-9701512promoter 内 2107-2121 bp - 1880 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9703392-9706749(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCGCACCGACGTCG
SmilChr02G003767 Chr02 NC_080388.1:59375265-59375279promoter 内 2092-2106 bp + 1895 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59368358-59373370(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCGCCG
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SmilChr06G000114 Chr06 NC_080392.1:805954-805968promoter 内 2049-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 803936-804016(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr02G001806 Chr02 NC_080388.1:32897943-32897957promoter 内 2037-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32899907-32904815(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAACGTCGGTGGGTG
SmilChr08G002071 Chr08 NC_080394.1:18565080-18565094promoter 内 2031-2045 bp - 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18567050-18569091(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTCTACCGACAATG
SmilChr02G003595 Chr02 NC_080388.1:57155556-57155570promoter 内 2001-2015 bp + 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57149153-57153570(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACTCAT
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SmilChr05G000811 Chr05 NC_080391.1:6336598-6336612promoter 内 1979-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6334518-6334590(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGAGTCGGTGGAGA
SmilChr07G003839 Chr07 NC_080393.1:47550185-47550199promoter 内 1968-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47544999-47548166(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCGCACCGACGTCG
SmilChr07G004156 Chr07 NC_080393.1:53406288-53406302promoter 内 1965-1979 bp + 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53403196-53404266(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGTCACCA
SmilChr04G002973 Chr04 NC_080390.1:46101690-46101704promoter 内 1959-1973 bp + 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46096390-46099662(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAATCACCGACGGAG
SmilChr08G000445 Chr08 NC_080394.1:3172189-3172203promoter 内 1849-1863 bp - 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3174341-3178350(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGACACCGACACCC
SmilChr04G000783 Chr04 NC_080390.1:9600239-9600253promoter 内 1786-1800 bp + 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9595001-9598038(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGTCGCTG
SmilChr01G003133 Chr01 NC_080387.1:50144364-50144378promoter 内 1783-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50146582-50147477(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GATCGTCGGTGGAAA
SmilChr02G001805 Chr02 NC_080388.1:32897943-32897957promoter 内 1762-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32892547-32895718(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACCCACCGACGTTT
SmilChr02G003889 Chr02 NC_080388.1:60982868-60982882promoter 内 1756-1770 bp - 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 60985113-60991057(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGGTCACCGACAAAC
SmilChr08G000785 Chr08 NC_080394.1:5793035-5793049promoter 内 1720-1734 bp + 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5789720-5790768(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAACGCCGACAACG
SmilChr08G002716 Chr08 NC_080394.1:26763576-26763590promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26758796-26761224(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTACCACCGACATAC
SmilChr07G002370 Chr07 NC_080393.1:22007996-22008010promoter 内 1621-1635 bp - 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22010376-22013975(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCCACCGCCACCT
SmilChr02G000397 Chr02 NC_080388.1:4912954-4912968promoter 内 1591-1605 bp - 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4915364-4916889(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATCACCGACTCTG
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SmilChr08G003714 Chr08 NC_080394.1:41749716-41749730promoter 内 1513-1527 bp + 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41744575-41747242(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCGCACCGACGTCG
SmilChr03G002453 Chr03 NC_080389.1:38903607-38903621promoter 内 1464-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 38894974-38901084(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGGCGGTGGAGT
SmilChr05G002142 Chr05 NC_080391.1:22595781-22595795promoter 内 1461-1475 bp + 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22581052-22593255(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCGCCG
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SmilChr04G001714 Chr04 NC_080390.1:28363476-28363490promoter 内 1260-1274 bp - 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 28359711-28360749(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGGGTCGGTGGAGG
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SmilChr05G002497 Chr05 NC_080391.1:27690815-27690829promoter 内 1230-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27693586-27697120(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
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SmilChr08G000835 Chr08 NC_080394.1:6187723-6187737promoter 内 1199-1213 bp + 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6177032-6184935(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCACACCGACACAC
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SmilChr01G003131 Chr01 NC_080387.1:50144364-50144378promoter 内 930-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50137159-50141307(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTCCACCGACGATC
SmilChr04G003464 Chr04 NC_080390.1:51120307-51120321promoter 内 907-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 51123401-51126909(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA