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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 62 / 138 下载 TSV

上一页 62 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004590 Chr03 NC_080389.1:63735864-63735878promoter 内 1382-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63738483-63741036(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTCGCCG
SmilChr04G002277 Chr04 NC_080390.1:36997450-36997464promoter 内 1334-1348 bp + 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37000117-37006529(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CCCACTCACGTGGCA
SmilChr03G001925 Chr03 NC_080389.1:27016239-27016253promoter 内 1316-1330 bp + 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27006361-27013568(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr05G004131 Chr05 NC_080391.1:55289095-55289109promoter 内 1216-1230 bp + 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 55291880-55293424(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATCGTGACGTGGCC
SmilChr01G001299 Chr01 NC_080387.1:25856585-25856599promoter 内 1074-1088 bp - 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 25859512-25865599(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCAACTTT
SmilChr05G003163 Chr05 NC_080391.1:40408792-40408806promoter 内 1065-1079 bp - 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40411728-40417980(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTCTTAA
SmilChr04G001585 Chr04 NC_080390.1:26339490-26339504promoter 内 984-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 26342507-26355706(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CTAGCTGACGTGGCT
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51143347-51143361promoter 内 975-989 bp + 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51146373-51148060(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTGGCTCACGTGGAA
SmilChr07G002761 Chr07 NC_080393.1:27459621-27459635promoter 内 957-971 bp - 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27455068-27456591(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCTAAGACGTGGCA
SmilChr07G001807 Chr07 NC_080393.1:15464600-15464614promoter 内 948-962 bp - 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15467653-15471702(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTAAATT
SmilChr02G004495 Chr02 NC_080388.1:67446325-67446339promoter 内 907-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 67449419-67455324(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTGCATG
SmilChr02G001343 Chr02 NC_080388.1:24998337-24998351promoter 内 904-918 bp - 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 25001434-25004211(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGTTCTA
SmilChr01G002178 Chr01 NC_080387.1:37867479-37867493promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37862410-37864386(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CCCACTCACGTGGCA
SmilChr02G002498 Chr02 NC_080388.1:43420383-43420397promoter 内 885-899 bp + 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43416478-43417281(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr05G000432 Chr05 NC_080391.1:3256827-3256841promoter 内 873-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3252292-3253713(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATTTACACGTGGCG
SmilChr01G003226 Chr01 NC_080387.1:51036582-51036596promoter 内 795-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51030576-51033390(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAGTGGG
SmilChr01G006164 Chr01 NC_080387.1:77070307-77070321promoter 内 733-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 77064432-77067053(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTAGCTCACGTGGAG
SmilChr06G002269 Chr06 NC_080392.1:32411094-32411108promoter 内 635-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 32405128-32407742(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAGTGGG
SmilChr01G005734 Chr01 NC_080387.1:73474719-73474733promoter 内 570-584 bp - 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73478150-73479250(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr01G006127 Chr01 NC_080387.1:76810942-76810956promoter 内 569-583 bp + 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 76806425-76807524(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr08G004472 Chr08 NC_080394.1:54357021-54357035promoter 内 568-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54360454-54363641(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAAGCTAT
SmilChr01G003418 Chr01 NC_080387.1:52813724-52813738promoter 内 313-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52817412-52823614(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTTATTCACGTGGCA
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SmilChr01G005366 Chr01 NC_080387.1:70878596-70878610promoter 内 270-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 70882327-70885245(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGTATTGACGTGGCA
SmilChr04G001764 Chr04 NC_080390.1:28989584-28989598promoter 内 223-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 28993362-28995853(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr08G003675 Chr08 NC_080394.1:40879104-40879118promoter 内 184-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40882921-40886399(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr05G001311 Chr05 NC_080391.1:11298137-11298151promoter 内 183-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 11301955-11304810(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr07G004736 Chr07 NC_080393.1:60235389-60235403promoter 内 179-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60223975-60231581(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTACAACACGTGGCA
SmilChr08G003671 Chr08 NC_080394.1:40661614-40661628promoter 内 172-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40665443-40668681(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr01G001847 Chr01 NC_080387.1:33412539-33412553promoter 内 89-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33416451-33417809(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCTCTCAT
SmilChr02G005124 Chr02 NC_080388.1:72714296-72714310promoter 内 3-17 bp - 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72706994-72710312(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGTGACCACGTGGAA
SmilChr04G001530 Chr04 NC_080390.1:25222981-25222995promoter 内 3845-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 25223137-25225362(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGTTGCCACGTGGAG
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SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8642959-8642973promoter 内 2294-2308 bp - 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 8644666-8646235(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGGATTC
SmilChr08G001422 Chr08 NC_080394.1:11369422-11369436promoter 内 1871-1885 bp + 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 11371552-11375094(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGCTCCACGTGGCA
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SmilChr02G004706 Chr02 NC_080388.1:69356150-69356164promoter 内 979-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 69351219-69353142(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGTTCTG
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SmilChr01G003930 Chr01 NC_080387.1:57587859-57587873promoter 内 3676-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57588184-57590043(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGTTCTG
SmilChr01G002238 Chr01 NC_080387.1:38933516-38933530promoter 内 3644-3658 bp + 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 38926252-38933173(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGTTCTG
SmilChr05G001926 Chr05 NC_080391.1:19528338-19528352promoter 内 3458-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 19528881-19537029(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTTGACA
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SmilChr08G002832 Chr08 NC_080394.1:28193906-28193920promoter 内 3425-3439 bp - 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 28194482-28206040(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGACACGTGAGAGAC
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SmilChr01G003912 Chr01 NC_080387.1:57387282-57387296promoter 内 3024-3038 bp + 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57388259-57389337(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAGAACCACGTGGCA
SmilChr07G004281 Chr07 NC_080393.1:55350279-55350293promoter 内 2810-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55345649-55349102(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCTTCCACGTGGCG
SmilChr04G000620 Chr04 NC_080390.1:7030812-7030826promoter 内 2204-2218 bp - 1783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 7028229-7029029(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGAATCCACGTGGCA