转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 64 / 136 下载 TSV

上一页 64 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002640 Chr04 NC_080390.1:41804279-41804289promoter 内 288-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 41799818-41800576(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCC
SmilChr01G003259 Chr01 NC_080387.1:51289842-51289852promoter 内 277-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51293566-51296314(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCG
SmilChr04G002751 Chr04 NC_080390.1:43208538-43208548promoter 内 258-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43212281-43213665(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr04G003355 Chr04 NC_080390.1:50163489-50163499promoter 内 246-256 bp - 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50156991-50159744(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCC
SmilChr01G002506 Chr01 NC_080387.1:42943330-42943340promoter 内 232-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 42935463-42939571(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr05G000593 Chr05 NC_080391.1:4477375-4477385promoter 内 223-233 bp - 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4469970-4473607(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGTC
SmilChr03G004744 Chr03 NC_080389.1:64547891-64547901promoter 内 221-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 64551671-64552520(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr04G003964 Chr04 NC_080390.1:55143626-55143636promoter 内 210-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55131980-55139845(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr06G002748 Chr06 NC_080392.1:39938552-39938562promoter 内 186-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39932646-39934747(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr01G003675 Chr01 NC_080387.1:55183721-55183731promoter 内 141-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55177429-55179871(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr04G004109 Chr04 NC_080390.1:56037685-56037695promoter 内 57-67 bp + 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56031789-56033751(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr07G001159 Chr07 NC_080393.1:8670011-8670021promoter 内 17-27 bp - 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8673995-8674930(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr05G003567 Chr05 NC_080391.1:47611282-47611292promoter 内 3045-3055 bp - 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 47609291-47610336(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr06G000150 Chr06 NC_080392.1:1053668-1053678promoter 内 2651-2661 bp + 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 1049420-1052328(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAT
SmilChr03G004059 Chr03 NC_080389.1:59549382-59549392promoter 内 2587-2597 bp - 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59539744-59547978(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCACAGCGCG
SmilChr02G005576 Chr02 NC_080388.1:75617764-75617774promoter 内 2004-2014 bp - 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 75619761-75623495(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr06G002265 Chr06 NC_080392.1:32250013-32250023promoter 内 1562-1572 bp + 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 32244588-32247584(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr02G002064 Chr02 NC_080388.1:37205495-37205505promoter 内 346-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 37199198-37201850(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr04G001387 Chr04 NC_080390.1:22541406-22541416promoter 内 85-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 22536700-22537500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTT
SmilChr02G003653 Chr02 NC_080388.1:57917908-57917918promoter 内 3951-3961 bp + 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57913076-57917868(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr07G003926 Chr07 NC_080393.1:49565194-49565204promoter 内 3762-3772 bp - 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49558884-49564965(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTT
SmilChr02G002294 Chr02 NC_080388.1:40464307-40464317promoter 内 3675-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40464633-40465469(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr06G003054 Chr06 NC_080392.1:43425909-43425919promoter 内 3570-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43426340-43428376(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACCCTGAGCC
SmilChr05G003529 Chr05 NC_080391.1:47164589-47164599promoter 内 3407-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47157888-47164005(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr07G000814 Chr07 NC_080393.1:5743774-5743784promoter 内 3300-3310 bp - 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5741070-5743083(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAG
SmilChr02G002293 Chr02 NC_080388.1:40464307-40464317promoter 内 3229-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40461289-40463545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTT
SmilChr07G000334 Chr07 NC_080393.1:2262443-2262453promoter 内 3203-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2260728-2261655(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTT
SmilChr05G002749 Chr05 NC_080391.1:31713686-31713696promoter 内 2923-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31709214-31712618(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr04G000537 Chr04 NC_080390.1:5964460-5964470promoter 内 2767-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5965694-5971619(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr04G000522 Chr04 NC_080390.1:5746545-5746555promoter 内 2702-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5747844-5748431(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACCCTGAGCC
SmilChr01G005672 Chr01 NC_080387.1:72992670-72992680promoter 内 2633-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72994038-72995363(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr04G000521 Chr04 NC_080390.1:5746545-5746555promoter 内 2584-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5738820-5745138(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr07G001404 Chr07 NC_080393.1:10922599-10922609promoter 内 2293-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10924307-10926416(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr05G000600 Chr05 NC_080391.1:4514830-4514840promoter 内 2181-2191 bp + 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4508429-4513020(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr02G004271 Chr02 NC_080388.1:64906040-64906050promoter 内 2099-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64907942-64908500(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr03G003455 Chr03 NC_080389.1:52926970-52926980promoter 内 1957-1967 bp + 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52920295-52924936(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr01G001649 Chr01 NC_080387.1:30553341-30553351promoter 内 1949-1959 bp + 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30549545-30551299(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr06G001516 Chr06 NC_080392.1:16286667-16286677promoter 内 1897-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16288771-16288877(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr01G003795 Chr01 NC_080387.1:56341306-56341316promoter 内 1675-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56336337-56338990(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr04G002591 Chr04 NC_080390.1:41329972-41329982promoter 内 1670-1680 bp + 2321 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41325877-41327651(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr05G000702 Chr05 NC_080391.1:5287257-5287267promoter 内 1662-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5289596-5291558(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCACAGCGCG
SmilChr08G004827 Chr08 NC_080394.1:57522653-57522663promoter 内 1648-1658 bp - 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57525006-57528459(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr05G003900 Chr05 NC_080391.1:52755032-52755042promoter 内 1584-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52750239-52752625(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr06G002356 Chr06 NC_080392.1:34310354-34310364promoter 内 1518-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34306879-34307881(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr01G001195 Chr01 NC_080387.1:24102337-24102347promoter 内 1491-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24097390-24099837(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr07G000700 Chr07 NC_080393.1:4831768-4831778promoter 内 1472-1482 bp - 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4821335-4829249(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr08G001538 Chr08 NC_080394.1:12520116-12520126promoter 内 1282-1292 bp - 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12522835-12522905(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACCCTGAGCC
SmilChr01G003832 Chr01 NC_080387.1:56639069-56639079promoter 内 1161-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56641909-56652785(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAG
SmilChr06G003053 Chr06 NC_080392.1:43425909-43425919promoter 内 1082-1092 bp - 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43415031-43423000(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr05G003868 Chr05 NC_080391.1:52277652-52277662promoter 内 1056-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52272332-52274717(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT