转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 66 / 148 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001728 Chr01 NC_080387.1:31832474-31832487promoter 内 3240-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31833235-31835884(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGTTTAT
SmilChr07G001285 Chr07 NC_080393.1:9900414-9900427promoter 内 3194-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9897965-9899620(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAAATCACGTGG
SmilChr01G002775 Chr01 NC_080387.1:46199362-46199375promoter 内 3083-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46195111-46198457(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGAGCTCACGTGC
SmilChr03G004663 Chr03 NC_080389.1:64109362-64109375promoter 内 3069-3082 bp + 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64105728-64108443(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTTGCT
SmilChr06G001491 Chr06 NC_080392.1:15937136-15937149promoter 内 3055-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15938082-15938747(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGGGTACACGTGG
SmilChr02G002041 Chr02 NC_080388.1:36741212-36741225promoter 内 3020-3033 bp - 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36739942-36740244(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGTACACGTGG
SmilChr07G001140 Chr07 NC_080393.1:8560658-8560671promoter 内 2999-3012 bp + 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8556802-8559669(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTCAA
SmilChr04G003504 Chr04 NC_080390.1:51440246-51440259promoter 内 2959-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51439144-51439217(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCATTTCACGTGC
SmilChr05G001775 Chr05 NC_080391.1:17467006-17467019promoter 内 2887-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 17468120-17471720(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACATTAT
SmilChr03G001979 Chr03 NC_080389.1:28722142-28722155promoter 内 2759-2772 bp - 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 28723384-28731521(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTTCA
SmilChr04G000026 Chr04 NC_080390.1:268887-268900promoter 内 2720-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 270168-273153(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCTCT
SmilChr01G004559 Chr01 NC_080387.1:63678105-63678118promoter 内 2688-2701 bp - 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63672047-63676805(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATTGCACGTGG
SmilChr01G000441 Chr01 NC_080387.1:8924403-8924416promoter 内 2640-2653 bp + 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8925764-8930684(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTTGGGCACGTGG
SmilChr02G003454 Chr02 NC_080388.1:55823385-55823398promoter 内 2590-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55824796-55826600(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTAGCTCACGTGG
SmilChr03G001778 Chr03 NC_080389.1:24288968-24288981promoter 内 2547-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24285567-24287527(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAAATCACGTGG
SmilChr07G001921 Chr07 NC_080393.1:16619886-16619899promoter 内 2440-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16617308-16618338(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATCACT
SmilChr04G001934 Chr04 NC_080390.1:31438775-31438788promoter 内 2356-2369 bp - 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31440420-31444948(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTGCA
SmilChr07G001649 Chr07 NC_080393.1:13948829-13948842promoter 内 2349-2362 bp - 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13950481-13950985(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGTTCAT
SmilChr02G003448 Chr02 NC_080388.1:55727147-55727160promoter 内 2309-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55722680-55725468(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGAATGCACGTGG
SmilChr04G001617 Chr04 NC_080390.1:26955199-26955212promoter 内 2191-2204 bp + 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26953201-26953402(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGCTTCA
SmilChr04G001619 Chr04 NC_080390.1:26955199-26955212promoter 内 2175-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26957025-26960456(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGCTCACGTGT
SmilChr07G000861 Chr07 NC_080393.1:6130706-6130719promoter 内 2151-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6132556-6142055(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTCA
SmilChr04G003254 Chr04 NC_080390.1:49279341-49279354promoter 内 2011-2024 bp + 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49281331-49283072(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGTACACGTGG
SmilChr01G003150 Chr01 NC_080387.1:50301260-50301273promoter 内 1979-1992 bp + 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50303282-50306067(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGAAACACGTGG
SmilChr02G004782 Chr02 NC_080388.1:70002635-70002648promoter 内 1951-1964 bp + 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 70004685-70006856(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCATCACACGTGG
SmilChr04G003438 Chr04 NC_080390.1:50919867-50919880promoter 内 1934-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50921934-50925611(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCTTCG
SmilChr06G002921 Chr06 NC_080392.1:42080358-42080371promoter 内 1885-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42076664-42078255(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGATCTT
SmilChr04G003503 Chr04 NC_080390.1:51440246-51440259promoter 内 1828-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51434607-51438086(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCATTTCACGTGC
SmilChr08G001293 Chr08 NC_080394.1:10309674-10309687promoter 内 1793-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10302051-10307479(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAACTT
SmilChr05G000648 Chr05 NC_080391.1:4900845-4900858promoter 内 1744-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 4903102-4904866(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGACATCACGTGT
SmilChr05G001893 Chr05 NC_080391.1:19245622-19245635promoter 内 1594-1607 bp - 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19248029-19249619(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAGACCC
SmilChr05G002077 Chr05 NC_080391.1:21705007-21705020promoter 内 1346-1359 bp - 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21707662-21709732(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTGGAA
SmilChr05G001178 Chr05 NC_080391.1:9884927-9884940promoter 内 1334-1347 bp - 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9878310-9882273(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACGTGTCACGTGT
SmilChr01G004375 Chr01 NC_080387.1:61950381-61950394promoter 内 1310-1323 bp - 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61953072-61954889(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTTTA
SmilChr01G002776 Chr01 NC_080387.1:46199362-46199375promoter 内 1176-1189 bp - 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46202187-46210470(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCTCTA
SmilChr04G003437 Chr04 NC_080390.1:50919867-50919880promoter 内 1151-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50915997-50917030(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAAGAACACGTGG
SmilChr02G003449 Chr02 NC_080388.1:55727147-55727160promoter 内 1126-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55730022-55732077(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCATTCCA
SmilChr06G001913 Chr06 NC_080392.1:23103317-23103330promoter 内 1106-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 23096867-23100435(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAACACCA
SmilChr08G001294 Chr08 NC_080394.1:10309674-10309687promoter 内 1097-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10312578-10315558(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGTTGACACGTGG
SmilChr04G000068 Chr04 NC_080390.1:625006-625019promoter 内 1083-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 620400-622101(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCTCA
SmilChr04G003707 Chr04 NC_080390.1:53392138-53392151promoter 内 1041-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53395098-53397421(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTATGTCACGTGC
SmilChr07G001287 Chr07 NC_080393.1:9900414-9900427promoter 内 1037-1050 bp - 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9903378-9906398(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTGCA
SmilChr03G003381 Chr03 NC_080389.1:52172880-52172893promoter 内 970-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52168285-52169862(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCTATT
SmilChr02G001725 Chr02 NC_080388.1:31759472-31759485promoter 内 954-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31762519-31763588(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAGCACG
SmilChr06G000218 Chr06 NC_080392.1:1464574-1464587promoter 内 946-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1458526-1461532(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGATTCACGTGC
SmilChr08G000264 Chr08 NC_080394.1:1810442-1810455promoter 内 877-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1813566-1815410(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAACAGCA
SmilChr01G004560 Chr01 NC_080387.1:63678105-63678118promoter 内 847-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63681259-63684041(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAATGCA
SmilChr01G004308 Chr01 NC_080387.1:61271261-61271274promoter 内 823-836 bp - 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61261478-61268096(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGACAACACGTGG
SmilChr01G000037 Chr01 NC_080387.1:601074-601087promoter 内 774-787 bp - 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 604301-606337(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGCCGAA
SmilChr02G000099 Chr02 NC_080388.1:1276504-1276517promoter 内 687-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1279818-1284135(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAACAACACGTGG