转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 66 / 128 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002343 Chr02 NC_080388.1:41164774-41164785promoter 内 3760-3771 bp + 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 41160657-41164544(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr02G004497 Chr02 NC_080388.1:67458196-67458207promoter 内 2711-2722 bp + 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 67459486-67477871(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAGAGCAGAGCA
SmilChr02G002373 Chr02 NC_080388.1:41559117-41559128promoter 内 2241-2252 bp + 1749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 41549344-41557368(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTCCA
SmilChr02G001170 Chr02 NC_080388.1:21513651-21513662promoter 内 1856-1867 bp + 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 21515796-21518855(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCT
SmilChr02G005006 Chr02 NC_080388.1:71849840-71849851promoter 内 332-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 71853509-71854313(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr03G001009 Chr03 NC_080389.1:11568479-11568490promoter 内 128-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 11572352-11573228(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr03G001013 Chr03 NC_080389.1:11636088-11636099promoter 内 3972-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 11636117-11637926(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr02G002942 Chr02 NC_080388.1:49929966-49929977promoter 内 3429-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 49928935-49929405(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCT
SmilChr01G001627 Chr01 NC_080387.1:30334427-30334438promoter 内 3191-3202 bp + 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 30335237-30340440(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr02G001999 Chr02 NC_080388.1:36150274-36150285promoter 内 3165-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 36147494-36149449(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAGACAGAGCA
SmilChr02G002149 Chr02 NC_080388.1:38670669-38670680promoter 内 2968-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 38671702-38672587(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGTG
SmilChr02G003324 Chr02 NC_080388.1:54519421-54519432promoter 内 2746-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 54514246-54518177(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr01G000909 Chr01 NC_080387.1:19160810-19160821promoter 内 2675-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 19162136-19163000(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr01G000910 Chr01 NC_080387.1:19171626-19171637promoter 内 2675-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 19172952-19173816(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr02G002714 Chr02 NC_080388.1:46982314-46982325promoter 内 2511-2522 bp - 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 46983804-46987494(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTCTC
SmilChr02G004367 Chr02 NC_080388.1:65963005-65963016promoter 内 2475-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 65964531-65967999(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTCTTG
SmilChr01G000118 Chr01 NC_080387.1:2035140-2035151promoter 内 2031-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 2032181-2033181(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr02G004091 Chr02 NC_080388.1:63181067-63181078promoter 内 1893-1904 bp + 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 63178134-63178970(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr01G001113 Chr01 NC_080387.1:22743864-22743875promoter 内 1880-1891 bp - 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 22737791-22741754(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGAG
SmilChr02G002943 Chr02 NC_080388.1:49929966-49929977promoter 内 1821-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 49932146-49933072(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr02G001405 Chr02 NC_080388.1:26650555-26650566promoter 内 1369-1380 bp - 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 26644737-26647934(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGTG
SmilChr03G001724 Chr03 NC_080389.1:23132342-23132353promoter 内 1212-1223 bp + 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 23135131-23141677(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGGAACAGAGTG
SmilChr01G001625 Chr01 NC_080387.1:30334427-30334438promoter 内 724-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 30329325-30331161(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr01G003580 Chr01 NC_080387.1:54372768-54372779promoter 内 701-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 54376068-54381774(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr01G004797 Chr01 NC_080387.1:66192605-66192616promoter 内 659-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 66195947-66196019(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCA
SmilChr02G001271 Chr02 NC_080388.1:23266297-23266308promoter 内 560-571 bp + 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 23269738-23271189(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGTG
SmilChr02G004090 Chr02 NC_080388.1:63181067-63181078promoter 内 513-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 63172916-63177590(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr02G001165 Chr02 NC_080388.1:21296661-21296672promoter 内 512-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 21300150-21300222(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr01G005694 Chr01 NC_080387.1:73225834-73225845promoter 内 110-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 73216336-73221954(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr02G001763 Chr02 NC_080388.1:32369002-32369013promoter 内 104-115 bp - 3886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 32372899-32374214(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTCTG
SmilChr02G002342 Chr02 NC_080388.1:41151677-41151688promoter 内 3761-3772 bp + 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 41147564-41151448(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr01G002513 Chr01 NC_080387.1:43053920-43053931promoter 内 3549-3560 bp + 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 43054372-43064125(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr02G000187 Chr02 NC_080388.1:2347285-2347296promoter 内 3524-3535 bp - 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2347762-2349042(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTCTCG
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6121729-6121740promoter 内 3522-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 6118977-6121261(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr02G003035 Chr02 NC_080388.1:51056828-51056839promoter 内 3388-3399 bp - 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51057441-51058186(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTCTCG
SmilChr01G002943 Chr01 NC_080387.1:48216247-48216258promoter 内 3039-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 48217209-48218367(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr01G001338 Chr01 NC_080387.1:26607314-26607325promoter 内 2858-2869 bp + 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26608457-26614485(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr01G005781 Chr01 NC_080387.1:73925464-73925475promoter 内 2858-2869 bp + 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 73921078-73924332(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCCT
SmilChr01G005782 Chr01 NC_080387.1:73929336-73929347promoter 内 2850-2861 bp + 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 73924827-73928196(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCCT
SmilChr02G002523 Chr02 NC_080388.1:43883266-43883277promoter 内 2850-2861 bp + 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 43884417-43886031(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGTG
SmilChr02G001197 Chr02 NC_080388.1:22015726-22015737promoter 内 2784-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22016943-22017401(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTCCC
SmilChr02G000391 Chr02 NC_080388.1:4849286-4849297promoter 内 2575-2586 bp - 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4850712-4851596(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTCCA
SmilChr01G004646 Chr01 NC_080387.1:64520658-64520669promoter 内 2521-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64517654-64519189(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCCT
SmilChr03G000500 Chr03 NC_080389.1:5367748-5367759promoter 内 2280-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5365559-5366038(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr02G000497 Chr02 NC_080388.1:6844805-6844816promoter 内 2258-2269 bp - 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 6846548-6849545(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTCTTG
SmilChr01G003661 Chr01 NC_080387.1:55034449-55034460promoter 内 2195-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55031026-55032654(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTCCC
SmilChr01G004421 Chr01 NC_080387.1:62330685-62330696promoter 内 2011-2022 bp + 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 62326690-62328706(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTCCC
SmilChr01G005854 Chr01 NC_080387.1:74485133-74485144promoter 内 1968-1979 bp + 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 74487166-74489373(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCT
SmilChr01G001503 Chr01 NC_080387.1:28863229-28863240promoter 内 1937-1948 bp - 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 28865293-28865856(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTCA
SmilChr03G000999 Chr03 NC_080389.1:11322240-11322251promoter 内 1860-1871 bp + 2130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 11318754-11320110(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGTTCTGTTTCC