转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002937; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004943-RA_Salv SmilChr07G002937 MIKC_MADS XP_057777490.1 MP00096 CCAAAAATGGAA

可能结合的靶基因

9914 个结合位点 8019 个候选靶基因 第 66 / 161 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000750 Chr01 NC_080387.1:16572876-16572887promoter 内 1014-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16575863-16581141(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 GCCCATTTTTGG
SmilChr01G002153 Chr01 NC_080387.1:37533653-37533664promoter 内 891-902 bp - 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37529358-37530554(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGGC
SmilChr04G000589 Chr04 NC_080390.1:6556416-6556427promoter 内 831-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6559586-6578686(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAGAAATGGAA
SmilChr02G004263 Chr02 NC_080388.1:64836732-64836743promoter 内 827-838 bp + 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 64828012-64833569(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCATTTTAGG
SmilChr07G002232 Chr07 NC_080393.1:20515679-20515690promoter 内 689-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 20518991-20521343(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAGAAATGGAA
SmilChr05G000376 Chr05 NC_080391.1:2825392-2825403promoter 内 493-504 bp - 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2828900-2830841(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCATTTTAGG
SmilChr03G001957 Chr03 NC_080389.1:27982858-27982869promoter 内 382-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27977687-27979250(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTCTGG
SmilChr02G004227 Chr02 NC_080388.1:64492323-64492334promoter 内 365-376 bp - 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 64488626-64488698(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGGC
SmilChr05G003976 Chr05 NC_080391.1:53562224-53562235promoter 内 257-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53554992-53558491(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTCTGG
SmilChr08G001264 Chr08 NC_080394.1:10014452-10014463promoter 内 1710-1721 bp - 2280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 10010966-10012172(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr04G003363 Chr04 NC_080390.1:50220970-50220981promoter 内 2348-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 50212442-50219328(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr08G000375 Chr08 NC_080394.1:2612271-2612282promoter 内 2321-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 2613951-2614525(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr08G000379 Chr08 NC_080394.1:2656817-2656828promoter 内 2321-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 2658497-2659086(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr01G004443 Chr01 NC_080387.1:62556119-62556130promoter 内 3932-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 62554906-62556061(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr04G000320 Chr04 NC_080390.1:2920614-2920625promoter 内 3670-3681 bp - 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2920945-2921988(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr01G000152 Chr01 NC_080387.1:2588664-2588675promoter 内 3646-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2589019-2591200(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr03G003234 Chr03 NC_080389.1:50187179-50187190promoter 内 3645-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 50187535-50191632(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr02G001927 Chr02 NC_080388.1:34682740-34682751promoter 内 3574-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 34683167-34686374(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr04G003512 Chr04 NC_080390.1:51481996-51482007promoter 内 3530-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51479564-51481536(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G002275 Chr01 NC_080387.1:39521796-39521807promoter 内 3456-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39522341-39524619(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr01G000139 Chr01 NC_080387.1:2339048-2339059promoter 内 3349-3360 bp + 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2339700-2341885(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr03G000550 Chr03 NC_080389.1:5958576-5958587promoter 内 3305-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5959272-5962864(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr05G004295 Chr05 NC_080391.1:56686033-56686044promoter 内 3187-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56683362-56685230(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G001507 Chr01 NC_080387.1:28900280-28900291promoter 内 3137-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 28901144-28904373(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr07G001172 Chr07 NC_080393.1:8826497-8826508promoter 内 3073-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8821545-8825580(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr03G001088 Chr03 NC_080389.1:12579984-12579995promoter 内 2904-2915 bp - 1086 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 12581081-12582292(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr04G002925 Chr04 NC_080390.1:45521075-45521086promoter 内 2614-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 45518617-45519699(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G002290 Chr01 NC_080387.1:39739065-39739076promoter 内 2358-2369 bp - 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39735727-39737433(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr08G000380 Chr08 NC_080394.1:2668215-2668226promoter 内 2309-2320 bp - 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2669907-2670617(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr06G002619 Chr06 NC_080392.1:37702552-37702563promoter 内 2148-2159 bp - 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37704405-37711020(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr05G004298 Chr05 NC_080391.1:56701997-56702008promoter 内 2106-2117 bp - 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56695115-56700113(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G005118 Chr01 NC_080387.1:68980298-68980309promoter 内 2057-2068 bp - 1933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 68977183-68978365(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G001179 Chr01 NC_080387.1:23845855-23845866promoter 内 1821-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 23836130-23843686(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr02G003683 Chr02 NC_080388.1:58196311-58196322promoter 内 1566-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 58188716-58193887(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr08G000373 Chr08 NC_080394.1:2569547-2569558promoter 内 1316-1327 bp - 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2572232-2572679(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr08G000374 Chr08 NC_080394.1:2591860-2591871promoter 内 1316-1327 bp - 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2594545-2595099(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr07G001994 Chr07 NC_080393.1:17612600-17612611promoter 内 1233-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 17615368-17619499(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr08G001115 Chr08 NC_080394.1:8664889-8664900promoter 内 1061-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8658318-8661960(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr04G002486 Chr04 NC_080390.1:39703152-39703163promoter 内 1006-1017 bp + 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39697429-39700168(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr04G002511 Chr04 NC_080390.1:40098340-40098351promoter 内 992-1003 bp + 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 40092924-40095342(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr02G000709 Chr02 NC_080388.1:11433961-11433972promoter 内 989-1000 bp + 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 11436973-11442426(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr02G001926 Chr02 NC_080388.1:34682740-34682751promoter 内 972-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 34678675-34679722(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G004444 Chr01 NC_080387.1:62556119-62556130promoter 内 950-961 bp + 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 62559170-62565033(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr05G004294 Chr05 NC_080391.1:56686033-56686044promoter 内 840-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56680717-56682883(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr03G002557 Chr03 NC_080389.1:40747727-40747738promoter 内 740-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 40741252-40744477(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr03G001087 Chr03 NC_080389.1:12579984-12579995promoter 内 696-707 bp - 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 12574078-12576690(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr01G001106 Chr01 NC_080387.1:22653432-22653443promoter 内 617-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22647103-22650059(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA
SmilChr06G003017 Chr06 NC_080392.1:43031083-43031094promoter 内 531-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 43025343-43027624(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr01G002510 Chr01 NC_080387.1:42992902-42992913promoter 内 520-531 bp - 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42996383-43000308(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCCCTTTTTTGG
SmilChr08G000451 Chr08 NC_080394.1:3195345-3195356promoter 内 84-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3199262-3210701(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAAAGGGA