靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00027346-RA_Salv |
SmilChr02G004447 |
HD-ZIP | XP_057797242.1 |
MP00200 |
AAAAGTAATGATTAC |
9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 67 / 134 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr02G003614 |
Chr02 | NC_080388.1:57379897-57379911promoter 内 2761-2775 bp |
- | 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 57373768-57378671(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AAATGTAATGATTTT |
SmilChr02G002827 |
Chr02 | NC_080388.1:48375929-48375943promoter 内 2635-2649 bp |
+ | 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 48367998-48374577(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTCATCATTATATGA |
SmilChr03G002462 |
Chr03 | NC_080389.1:38967495-38967509promoter 内 2580-2594 bp |
+ | 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 38968916-38970956(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATAGCTAATGATTGG |
SmilChr02G001005 |
Chr02 | NC_080388.1:17737457-17737471promoter 内 2529-2543 bp |
- | 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 17735893-17735999(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GGCAACGATGATTAC |
SmilChr02G002053 |
Chr02 | NC_080388.1:36935767-36935781promoter 内 2505-2519 bp |
- | 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 36937263-36939768(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTCATCATTAACCAT |
SmilChr02G003633 |
Chr02 | NC_080388.1:57677429-57677443promoter 内 2485-2499 bp |
- | 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 57672451-57675927(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTATCTAATGATGGG |
SmilChr01G003270 |
Chr01 | NC_080387.1:51403090-51403104promoter 内 2468-2482 bp |
+ | 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 51392925-51401571(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTAATCATCATTCAA |
SmilChr01G003525 |
Chr01 | NC_080387.1:53876407-53876421promoter 内 2401-2415 bp |
- | 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 53878007-53885531(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTGGTTCT |
SmilChr02G005561 |
Chr02 | NC_080388.1:75544755-75544769promoter 内 2323-2337 bp |
+ | 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 75546433-75548590(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TCAACTAATGATGGC |
SmilChr02G005560 |
Chr02 | NC_080388.1:75544755-75544769promoter 内 2300-2314 bp |
+ | 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 75540696-75543068(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GCCATCATTAGTTGA |
SmilChr01G003467 |
Chr01 | NC_080387.1:53230928-53230942promoter 内 2193-2207 bp |
- | 1794 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 53232736-53233425(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTGGTTCT |
SmilChr01G001017 |
Chr01 | NC_080387.1:21335883-21335897promoter 内 2165-2179 bp |
+ | 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 21337719-21339873(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTTAACAATGATTGT |
SmilChr01G001084 |
Chr01 | NC_080387.1:22269651-22269665promoter 内 2111-2125 bp |
- | 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 22267275-22267775(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TATGTTAATGATGAT |
SmilChr02G001548 |
Chr02 | NC_080388.1:28773119-28773133promoter 内 2027-2041 bp |
+ | 1960 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 28775093-28778230(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ACTGGCAATGATTGA |
SmilChr02G003530 |
Chr02 | NC_080388.1:56450116-56450130promoter 内 1959-1973 bp |
- | 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 56452158-56455371(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATAATCATTATCGAA |
SmilChr02G003584 |
Chr02 | NC_080388.1:57003219-57003233promoter 内 1939-1953 bp |
- | 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 57005281-57007063(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATAATCATTATCGAA |
SmilChr03G001822 |
Chr03 | NC_080389.1:24935058-24935072promoter 内 1877-1891 bp |
- | 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 24937182-24938090(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTATGCTG |
SmilChr03G000488 |
Chr03 | NC_080389.1:5218054-5218068promoter 内 1814-1828 bp |
- | 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 5220241-5222556(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTCATCATTAAATTT |
SmilChr02G004294 |
Chr02 | NC_080388.1:65298473-65298487promoter 内 1785-1799 bp |
- | 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 65300689-65303577(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
CCAATCATTAGCTAT |
SmilChr01G001034 |
Chr01 | NC_080387.1:21492147-21492161promoter 内 1765-1779 bp |
+ | 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 21494383-21495550(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TATGTTAATGATGAT |
SmilChr01G001045 |
Chr01 | NC_080387.1:21714303-21714317promoter 内 1711-1725 bp |
+ | 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 21698391-21712027(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTAATCATTGACATA |
SmilChr01G001070 |
Chr01 | NC_080387.1:22097126-22097140promoter 内 1673-1687 bp |
- | 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 22099454-22100565(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTAATCATTGACATA |
SmilChr03G001654 |
Chr03 | NC_080389.1:21499491-21499505promoter 内 1548-1562 bp |
- | 2439 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 21501944-21504123(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTCATCATTAAATTT |
SmilChr02G004054 |
Chr02 | NC_080388.1:62860186-62860200promoter 内 1516-1530 bp |
- | 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 62862671-62864748(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTCATCATTAAATTT |
SmilChr01G003468 |
Chr01 | NC_080387.1:53230928-53230942promoter 内 1434-1448 bp |
- | 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 53233495-53234247(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTGGTTCT |
SmilChr02G001066 |
Chr02 | NC_080388.1:18992167-18992181promoter 内 1404-1418 bp |
+ | 2583 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 18988692-18989584(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTAATCATTTCTACA |
SmilChr01G004005 |
Chr01 | NC_080387.1:58438476-58438490promoter 内 1371-1385 bp |
+ | 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 58441106-58442543(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
CATCACAATGATTAG |
SmilChr02G000444 |
Chr02 | NC_080388.1:5819876-5819890promoter 内 1230-1244 bp |
- | 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 5816373-5817119(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATGGTTAATGATGAC |
SmilChr01G003327 |
Chr01 | NC_080387.1:51955933-51955947promoter 内 1136-1150 bp |
+ | 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 51943737-51953082(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTATGGCC |
SmilChr01G004787 |
Chr01 | NC_080387.1:66098604-66098618promoter 内 941-955 bp |
+ | 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 66093412-66095558(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATCATTGTC |
SmilChr01G001090 |
Chr01 | NC_080387.1:22357426-22357440promoter 内 852-866 bp |
- | 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 22352657-22354291(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GTTAACAATGATTGT |
SmilChr02G003323 |
Chr02 | NC_080388.1:54488632-54488646promoter 内 844-858 bp |
+ | 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 54484798-54485489(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATCATAATA |
SmilChr03G000395 |
Chr03 | NC_080389.1:4322932-4322946promoter 内 820-834 bp |
+ | 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 4316937-4319765(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
CCAATCATTATACCT |
SmilChr01G002336 |
Chr01 | NC_080387.1:40532144-40532158promoter 内 761-775 bp |
+ | 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 40535384-40537096(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TGTAGCGATGATTAG |
SmilChr01G003826 |
Chr01 | NC_080387.1:56590722-56590736promoter 内 733-747 bp |
- | 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 56593990-56598392(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
CTAATCATTAATATT |
SmilChr01G003836 |
Chr01 | NC_080387.1:56715736-56715750promoter 内 727-741 bp |
+ | 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 56708052-56712476(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
CTAATCATTAATATT |
SmilChr01G002221 |
Chr01 | NC_080387.1:38610895-38610909promoter 内 532-546 bp |
+ | 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 38614364-38618732(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AAATTTAATGATGAA |
SmilChr01G002200 |
Chr01 | NC_080387.1:38275184-38275198promoter 内 527-541 bp |
+ | 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 38278658-38283020(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AAATTTAATGATGAA |
SmilChr02G005040 |
Chr02 | NC_080388.1:72127695-72127709promoter 内 443-457 bp |
+ | 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 72131253-72136802(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AATTGAAATGATTAG |
SmilChr02G004028 |
Chr02 | NC_080388.1:62554976-62554990promoter 内 231-245 bp |
- | 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 62558746-62562572(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GACATCATTATTATT |
SmilChr02G001427 |
Chr02 | NC_080388.1:26930597-26930611promoter 内 1215-1229 bp |
+ | 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 5 | 26933383-26936742(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TAAAGTAATAATTAT |
SmilChr01G005568 |
Chr01 | NC_080387.1:72468918-72468932promoter 内 3333-3347 bp |
- | 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 72465758-72468264(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AAAAATAATGATTTC |
SmilChr02G004674 |
Chr02 | NC_080388.1:69100697-69100711promoter 内 3103-3117 bp |
+ | 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 69099466-69099813(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATAATTATTACTTTA |
SmilChr02G003684 |
Chr02 | NC_080388.1:58206557-58206571promoter 内 2484-2498 bp |
+ | 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 58208074-58213277(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AGAATCAATGATTAC |
SmilChr01G004188 |
Chr01 | NC_080387.1:60305686-60305700promoter 内 2455-2469 bp |
- | 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 60307232-60320496(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
ATAATCATTGTAAAA |
SmilChr03G000571 |
Chr03 | NC_080389.1:6222067-6222081promoter 内 1950-1964 bp |
- | 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 6217100-6220030(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
AAGATTAATGATGAT |
SmilChr03G003234 |
Chr03 | NC_080389.1:50184259-50184273promoter 内 725-739 bp |
+ | 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 3 | 50187535-50191632(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TAAAGAAATGATTAT |
SmilChr02G003150 |
Chr02 | NC_080388.1:52531739-52531753promoter 内 3973-3987 bp |
- | 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 2 | 52531767-52533896(+) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TTAATCATTATTTGA |
SmilChr01G005623 |
Chr01 | NC_080387.1:72718108-72718122promoter 内 3836-3850 bp |
- | 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 2 | 72716806-72717957(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
TATACTAATGATGGA |
SmilChr01G005541 |
Chr01 | NC_080387.1:72232375-72232389promoter 内 3798-3812 bp |
+ | 189 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.4/ 100 | 2 | 72230622-72232186(-) |
SMil_00027346-RA_Salv |
MP00200 |
GCAATCATTTCTTCT |