转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 67 / 149 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002640 Chr03 NC_080389.1:41972111-41972121promoter 内 3800-3810 bp - 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 41969327-41971920(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAGGCTGTCA
SmilChr02G001526 Chr02 NC_080388.1:28398621-28398631promoter 内 3766-3776 bp + 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 28398856-28400880(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G005652 Chr01 NC_080387.1:72893981-72893991promoter 内 2847-2857 bp - 1144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 72892765-72892837(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr04G003579 Chr04 NC_080390.1:52211031-52211041promoter 内 2283-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 52212749-52216297(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr03G000299 Chr03 NC_080389.1:3414072-3414082promoter 内 1932-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 3410844-3412013(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr03G002256 Chr03 NC_080389.1:35505012-35505022promoter 内 1863-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 35498895-35502884(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G000613 Chr02 NC_080388.1:8948222-8948232promoter 内 1526-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 8944679-8945757(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr06G000710 Chr06 NC_080392.1:6394407-6394417promoter 内 1471-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 6396937-6401290(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAGGCTGTCA
SmilChr01G006043 Chr01 NC_080387.1:75953309-75953319promoter 内 1160-1170 bp + 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75956150-75956609(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr04G003751 Chr04 NC_080390.1:53796392-53796402promoter 内 1061-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 53789656-53793462(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr05G003607 Chr05 NC_080391.1:48146966-48146976promoter 内 795-805 bp + 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 48140225-48143770(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr07G002036 Chr07 NC_080393.1:18453659-18453669promoter 内 698-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 18456962-18465975(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTC
SmilChr04G002684 Chr04 NC_080390.1:42291491-42291501promoter 内 662-672 bp - 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 42285729-42288162(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr03G000298 Chr03 NC_080389.1:3414072-3414082promoter 内 653-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 3409304-3410734(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr01G005651 Chr01 NC_080387.1:72893981-72893991promoter 内 325-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 72889589-72890315(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr03G000870 Chr03 NC_080389.1:9876939-9876949promoter 内 308-318 bp + 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 9880632-9885394(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr06G000896 Chr06 NC_080392.1:8476582-8476592promoter 内 194-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 8466820-8472785(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTAA
SmilChr05G001174 Chr05 NC_080391.1:9845281-9845291promoter 内 5-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 9839921-9841295(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTC
SmilChr06G002121 Chr06 NC_080392.1:28434113-28434123promoter 内 3885-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28434229-28435066(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr07G000311 Chr07 NC_080393.1:2065360-2065370promoter 内 3864-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2058135-2065233(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr06G002344 Chr06 NC_080392.1:34137562-34137572promoter 内 3824-3834 bp - 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 34101523-34137395(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr03G001564 Chr03 NC_080389.1:19757676-19757686promoter 内 3817-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 19757860-19758912(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr03G003292 Chr03 NC_080389.1:51036822-51036832promoter 内 3774-3784 bp - 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 51037049-51038148(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr02G002169 Chr02 NC_080388.1:38913098-38913108promoter 内 3743-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 38911880-38912850(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr06G003155 Chr06 NC_080392.1:44540899-44540909promoter 内 3719-3729 bp + 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44541181-44541970(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr01G002195 Chr01 NC_080387.1:38108709-38108719promoter 内 3703-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 38109007-38109480(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr03G000800 Chr03 NC_080389.1:9151588-9151598promoter 内 3702-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9151887-9154565(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G000898 Chr01 NC_080387.1:19057924-19057934promoter 内 3636-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 19058289-19060128(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr05G002799 Chr05 NC_080391.1:32757750-32757760promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 32756185-32757355(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr05G002800 Chr05 NC_080391.1:32767749-32767759promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 32766332-32767354(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr05G002801 Chr05 NC_080391.1:32777747-32777757promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 32776330-32777352(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr02G004605 Chr02 NC_080388.1:68558262-68558272promoter 内 3463-3473 bp + 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68558800-68560419(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr01G005006 Chr01 NC_080387.1:68113266-68113276promoter 内 3460-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68107762-68112735(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr02G000262 Chr02 NC_080388.1:3412260-3412270promoter 内 3407-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3409681-3411676(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43761762-43761772promoter 内 3373-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr03G004545 Chr03 NC_080389.1:63444253-63444263promoter 内 3301-3311 bp + 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 63444953-63447788(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr02G004526 Chr02 NC_080388.1:67858446-67858456promoter 内 3191-3201 bp - 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 67842087-67857646(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G002374 Chr01 NC_080387.1:40965030-40965040promoter 内 3170-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 40960406-40964209(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr06G001545 Chr06 NC_080392.1:16760626-16760636promoter 内 3156-3166 bp + 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16755418-16759791(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr02G005581 Chr02 NC_080388.1:75643719-75643729promoter 内 3146-3156 bp - 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 75637200-75642874(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr02G005294 Chr02 NC_080388.1:73925019-73925029promoter 内 3141-3151 bp - 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 73922742-73924169(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr05G003583 Chr05 NC_080391.1:47865381-47865391promoter 内 3134-3144 bp - 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47866248-47869132(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr04G002706 Chr04 NC_080390.1:42665040-42665050promoter 内 3117-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42665924-42668713(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr05G000903 Chr05 NC_080391.1:7154006-7154016promoter 内 3077-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7154930-7157290(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr01G001622 Chr01 NC_080387.1:30311292-30311302promoter 内 3004-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30308143-30310305(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr07G002463 Chr07 NC_080393.1:23169860-23169870promoter 内 2979-2989 bp + 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23165307-23168848(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGC
SmilChr04G002063 Chr04 NC_080390.1:33369559-33369569promoter 内 2920-2930 bp + 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 33367761-33368488(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr05G000345 Chr05 NC_080391.1:2579419-2579429promoter 内 2887-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2558691-2578315(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAT
SmilChr04G002685 Chr04 NC_080390.1:42291491-42291501promoter 内 2883-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42288245-42290383(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr06G001146 Chr06 NC_080392.1:11576584-11576594promoter 内 2851-2861 bp - 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 11573864-11575444(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG