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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 68 / 139 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004044 Chr02 NC_080388.1:62752373-62752384promoter 内 2649-2660 bp - 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62747666-62751032(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr03G001056 Chr03 NC_080389.1:12286569-12286580promoter 内 2468-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12282066-12285047(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGAAGACGTGGC
SmilChr03G003619 Chr03 NC_080389.1:54852346-54852357promoter 内 2314-2325 bp + 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54854033-54855725(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr01G004113 Chr01 NC_080387.1:59651469-59651480promoter 内 2304-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59653166-59658647(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAACG
SmilChr02G002513 Chr02 NC_080388.1:43630595-43630606promoter 内 2115-2126 bp - 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43632481-43634332(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCACCT
SmilChr01G000666 Chr01 NC_080387.1:14819322-14819333promoter 内 2072-2083 bp - 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14814848-14817404(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGAAGACGTGGC
SmilChr01G001614 Chr01 NC_080387.1:30272536-30272547promoter 内 2046-2057 bp + 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 30274491-30275147(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr01G004464 Chr01 NC_080387.1:62747447-62747458promoter 内 1973-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62743094-62745430(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAGCA
SmilChr01G005118 Chr01 NC_080387.1:68980455-68980466promoter 内 1900-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68977183-68978365(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGAC
SmilChr03G004181 Chr03 NC_080389.1:60532250-60532261promoter 内 1791-1802 bp + 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60534460-60538815(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGAGACGTGGT
SmilChr04G001731 Chr04 NC_080390.1:28552932-28552943promoter 内 1773-1784 bp - 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28555160-28558097(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCCA
SmilChr02G002673 Chr02 NC_080388.1:46329738-46329749promoter 内 1741-1752 bp - 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46331998-46335353(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCCA
SmilChr01G000668 Chr01 NC_080387.1:14819322-14819333promoter 内 1583-1594 bp - 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14821740-14822909(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCT
SmilChr03G001059 Chr03 NC_080389.1:12286569-12286580promoter 内 1421-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12289149-12290155(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCT
SmilChr04G003987 Chr04 NC_080390.1:55293417-55293428promoter 内 1381-1392 bp - 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55296037-55297756(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCT
SmilChr03G000876 Chr03 NC_080389.1:9951159-9951170promoter 内 1182-1193 bp - 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9944069-9948351(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr02G005389 Chr02 NC_080388.1:74520081-74520092promoter 内 1031-1042 bp - 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74523051-74525524(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCATCC
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SmilChr03G004254 Chr03 NC_080389.1:61010301-61010312promoter 内 787-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 61013515-61024170(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGAAGACGTGGC
SmilChr02G000628 Chr02 NC_080388.1:9452138-9452149promoter 内 746-757 bp + 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9455393-9456815(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGAAGACGTGGC
SmilChr02G005387 Chr02 NC_080388.1:74520081-74520092promoter 内 728-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74514699-74516819(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGTG
SmilChr03G004298 Chr03 NC_080389.1:61390390-61390401promoter 内 611-622 bp + 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 61378854-61387011(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCT
SmilChr01G003347 Chr01 NC_080387.1:52229304-52229315promoter 内 599-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52232706-52233291(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTAGACGTGGC
SmilChr03G001606 Chr03 NC_080389.1:20413565-20413576promoter 内 578-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20407165-20410153(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr01G002043 Chr01 NC_080387.1:36128406-36128417promoter 内 475-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36131932-36134712(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGAGACGTGGT
SmilChr01G001615 Chr01 NC_080387.1:30272536-30272547promoter 内 427-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 30276110-30278142(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTG
SmilChr03G000710 Chr03 NC_080389.1:7885399-7885410promoter 内 176-187 bp - 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7889224-7889565(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCATCG
SmilChr02G004166 Chr02 NC_080388.1:63977001-63977012promoter 内 125-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 63971723-63973136(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCCA
SmilChr03G002162 Chr03 NC_080389.1:33659420-33659431promoter 内 1955-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 33654944-33657385(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAACGACGTGGC
SmilChr02G000503 Chr02 NC_080388.1:6910545-6910556promoter 内 1533-1544 bp + 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 6906871-6908088(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGTGA
SmilChr04G000639 Chr04 NC_080390.1:7262559-7262570promoter 内 639-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 7265921-7268988(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTC
SmilChr03G003251 Chr03 NC_080389.1:50391793-50391804promoter 内 3933-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 50387876-50391736(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACACGTGGC
SmilChr03G003729 Chr03 NC_080389.1:56327133-56327144promoter 内 3875-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 56327259-56331090(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACACGTGGC
SmilChr02G005538 Chr02 NC_080388.1:75412287-75412298promoter 内 3585-3596 bp + 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 75408257-75411882(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCA
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SmilChr03G004266 Chr03 NC_080389.1:61144587-61144598promoter 内 2319-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 61138318-61142916(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAACA
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SmilChr01G004652 Chr01 NC_080387.1:64634731-64634742promoter 内 1190-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 64637542-64637843(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTACGACGTGGC
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SmilChr02G001730 Chr02 NC_080388.1:31791867-31791878promoter 内 1065-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 31788837-31788942(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACACGACGTGGC
SmilChr02G000788 Chr02 NC_080388.1:12956442-12956453promoter 内 1022-1033 bp - 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 12959421-12959777(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAC
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SmilChr01G002726 Chr01 NC_080387.1:45617888-45617899promoter 内 911-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 45620978-45622168(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCACGG
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SmilChr02G000232 Chr02 NC_080388.1:3001314-3001325promoter 内 659-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2992261-2997983(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATCGACGTGGC