转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 77 / 137 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004651 Chr01 NC_080387.1:64634729-64634743promoter 内 961-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64629285-64631703(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCGTACAC
SmilChr04G001257 Chr04 NC_080390.1:19828881-19828895promoter 内 957-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19831925-19836797(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr05G001652 Chr05 NC_080391.1:15573875-15573889promoter 内 951-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 15576925-15581874(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr08G000349 Chr08 NC_080394.1:2417708-2417722promoter 内 882-896 bp - 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2413039-2414603(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCATATTA
SmilChr04G003655 Chr04 NC_080390.1:53030752-53030766promoter 内 874-888 bp - 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53033879-53036528(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACATTTGACGTGGCG
SmilChr02G004622 Chr02 NC_080388.1:68734141-68734155promoter 内 733-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68737409-68737482(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAGGCGTT
SmilChr03G002249 Chr03 NC_080389.1:35418434-35418448promoter 内 657-671 bp - 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 35421778-35425099(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAATATGACGTGTCA
SmilChr02G003137 Chr02 NC_080388.1:52380203-52380217promoter 内 610-624 bp - 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52383594-52384469(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGATTCCACGTGGCA
SmilChr04G004124 Chr04 NC_080390.1:56099801-56099815promoter 内 601-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56091060-56096415(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCTCCGACGTGGCC
SmilChr04G002507 Chr04 NC_080390.1:40056035-40056049promoter 内 572-586 bp + 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 40059464-40064097(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCCACGTCGGCAAA
SmilChr01G003778 Chr01 NC_080387.1:56181623-56181637promoter 内 477-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56177508-56178113(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCATATTA
SmilChr01G001483 Chr01 NC_080387.1:28605699-28605713promoter 内 456-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28601175-28602168(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr06G001487 Chr06 NC_080392.1:15852575-15852589promoter 内 344-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 15837745-15848932(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr02G002817 Chr02 NC_080388.1:48262615-48262629promoter 内 332-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 48266284-48268490(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGTTTCACGTGGCG
SmilChr05G002828 Chr05 NC_080391.1:33542921-33542935promoter 内 273-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33546649-33547371(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGATTCCACGTGGCA
SmilChr01G005366 Chr01 NC_080387.1:70878596-70878610promoter 内 270-284 bp - 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70882327-70885245(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGTATTGACGTGGCA
SmilChr05G002631 Chr05 NC_080391.1:29668484-29668498promoter 内 240-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 29672245-29673624(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr06G001726 Chr06 NC_080392.1:19892901-19892915promoter 内 186-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19896716-19899644(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr05G003084 Chr05 NC_080391.1:39024581-39024595promoter 内 151-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39028431-39029726(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr08G004499 Chr08 NC_080394.1:54611076-54611090promoter 内 84-98 bp - 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54614993-54615295(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCGAACACGTGGCG
SmilChr01G000809 Chr01 NC_080387.1:17478739-17478753promoter 内 81-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17474079-17474833(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr08G004661 Chr08 NC_080394.1:56108192-56108206promoter 内 49-63 bp - 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56101579-56104254(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9532338-9532352promoter 内 17-31 bp + 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9536322-9536798(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr04G000496 Chr04 NC_080390.1:5421921-5421935promoter 内 11-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5408334-5417945(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGTAACACGTGGCA
SmilChr02G005251 Chr02 NC_080388.1:73655108-73655122promoter 内 2092-2106 bp + 1895 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 73651175-73653213(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTGGATGACGTGGAC
SmilChr02G005253 Chr02 NC_080388.1:73655108-73655122promoter 内 1491-1505 bp + 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 73657618-73658492(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCATCCAC
SmilChr05G002756 Chr05 NC_080391.1:31860424-31860438promoter 内 3900-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 31857847-31860337(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTTGCTGACGTGGAT
SmilChr01G005078 Chr01 NC_080387.1:68664923-68664937promoter 内 3802-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 68665122-68666594(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAT
SmilChr04G002211 Chr04 NC_080390.1:35784869-35784883promoter 内 3614-3628 bp + 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 35785256-35792216(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAAAACC
SmilChr03G002625 Chr03 NC_080389.1:41651129-41651143promoter 内 3515-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 41651615-41653296(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGTTTGA
SmilChr03G003177 Chr03 NC_080389.1:49231913-49231927promoter 内 2608-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 49233306-49238855(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGTTTGA
SmilChr01G000426 Chr01 NC_080387.1:8554668-8554682promoter 内 1717-1731 bp - 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 8556952-8560394(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTGTCCTACGTGGCA
SmilChr01G002289 Chr01 NC_080387.1:39730371-39730385promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 39720915-39726660(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATATCCTACGTGGCG
SmilChr05G003242 Chr05 NC_080391.1:41748349-41748363promoter 内 3843-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 41744130-41748205(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGACACGTCACATCC
SmilChr05G003157 Chr05 NC_080391.1:40330194-40330208promoter 内 3816-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 40330379-40334357(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGACACGTCACATCC
SmilChr06G003237 Chr06 NC_080392.1:45078380-45078394promoter 内 3740-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 45078641-45080191(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACAGTACACGTGGCA
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SmilChr01G002589 Chr01 NC_080387.1:44017420-44017434promoter 内 3964-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44016632-44017397(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATATCCTACGTGGCG