转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000070; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001046-RA_Salv SmilChr04G000070 bHLH XP_057807324.1 MP00034 CCACGTGC

可能结合的靶基因

9929 个结合位点 6653 个候选靶基因 第 77 / 134 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003917 Chr02 NC_080388.1:61258336-61258343promoter 内 624-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 61252577-61254966(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr01G006107 Chr01 NC_080387.1:76605034-76605041promoter 内 616-623 bp + 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 76608419-76609050(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr02G003253 Chr02 NC_080388.1:53822775-53822782promoter 内 616-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 53826160-53831016(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr04G002556 Chr04 NC_080390.1:40875929-40875936promoter 内 615-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 40871294-40872550(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr03G001457 Chr03 NC_080389.1:17405402-17405409promoter 内 613-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 17398274-17402021(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr04G002180 Chr04 NC_080390.1:35225837-35225844promoter 内 612-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 35215561-35222455(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr02G000390 Chr02 NC_080388.1:4820226-4820233promoter 内 610-617 bp + 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 4823617-4830268(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr04G000523 Chr04 NC_080390.1:5750290-5750297promoter 内 609-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5753682-5764897(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr02G000799 Chr02 NC_080388.1:13385178-13385185promoter 内 607-614 bp + 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 13379253-13381791(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G003076 Chr02 NC_080388.1:51680344-51680351promoter 内 604-611 bp - 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51683741-51687524(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr01G003662 Chr01 NC_080387.1:55055574-55055581promoter 内 603-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55046452-55052183(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G003475 Chr02 NC_080388.1:56049783-56049790promoter 内 603-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56053181-56053732(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr01G001415 Chr01 NC_080387.1:27748500-27748507promoter 内 597-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27744491-27745103(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr05G002540 Chr05 NC_080391.1:28347303-28347310promoter 内 597-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 28350707-28351219(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr01G003618 Chr01 NC_080387.1:54711343-54711350promoter 内 596-603 bp - 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 54714748-54718095(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G002891 Chr02 NC_080388.1:49208570-49208577promoter 内 596-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 49204177-49205172(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr04G001561 Chr04 NC_080390.1:25906895-25906902promoter 内 596-603 bp - 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25910300-25911847(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr04G003223 Chr04 NC_080390.1:49049196-49049203promoter 内 593-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 49040326-49045795(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr05G001619 Chr05 NC_080391.1:14969958-14969965promoter 内 593-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 14961256-14966557(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr05G003800 Chr05 NC_080391.1:51322594-51322601promoter 内 593-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51316457-51319193(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr05G002511 Chr05 NC_080391.1:27872941-27872948promoter 内 592-599 bp + 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27869027-27869539(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G001585 Chr02 NC_080388.1:29600283-29600290promoter 内 588-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 29603696-29605036(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr05G003808 Chr05 NC_080391.1:51388118-51388125promoter 内 583-590 bp - 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51381944-51384707(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr01G003632 Chr01 NC_080387.1:54838563-54838570promoter 内 582-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 54841982-54845695(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G002079 Chr02 NC_080388.1:37377730-37377737promoter 内 582-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 37372666-37374318(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr04G000537 Chr04 NC_080390.1:5962267-5962274promoter 内 574-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5965694-5971619(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr03G001762 Chr03 NC_080389.1:24027012-24027019promoter 内 573-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24030440-24032840(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G003939 Chr02 NC_080388.1:61533071-61533078promoter 内 571-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 61529031-61529648(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr05G004170 Chr05 NC_080391.1:55639486-55639493promoter 内 566-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55642921-55643908(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr02G002988 Chr02 NC_080388.1:50550420-50550427promoter 内 556-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 50544261-50546982(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr01G005225 Chr01 NC_080387.1:69794242-69794249promoter 内 555-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 69786888-69790803(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G004940 Chr02 NC_080388.1:71369349-71369356promoter 内 552-559 bp + 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 71362767-71365907(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr01G005226 Chr01 NC_080387.1:69805286-69805293promoter 内 549-556 bp + 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 69797931-69801841(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G000035 Chr02 NC_080388.1:421095-421102promoter 内 547-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 424549-426529(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr02G002130 Chr02 NC_080388.1:38151188-38151195promoter 内 542-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 38146714-38147736(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr01G000587 Chr01 NC_080387.1:12740390-12740397promoter 内 540-547 bp + 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 12736830-12736936(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G004245 Chr02 NC_080388.1:64642479-64642486promoter 内 539-546 bp + 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 64645941-64648038(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr04G002941 Chr04 NC_080390.1:45699601-45699608promoter 内 539-546 bp + 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 45694240-45696146(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr01G002057 Chr01 NC_080387.1:36371192-36371199promoter 内 536-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 36374657-36378001(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr05G004092 Chr05 NC_080391.1:54767364-54767371promoter 内 534-541 bp + 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 54770831-54773647(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr02G001044 Chr02 NC_080388.1:18509880-18509887promoter 内 532-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 18501069-18506418(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr04G002654 Chr04 NC_080390.1:41943413-41943420promoter 内 532-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 41946882-41950074(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr03G004688 Chr03 NC_080389.1:64276275-64276282promoter 内 525-532 bp + 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 64270109-64272806(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr02G003131 Chr02 NC_080388.1:52343628-52343635promoter 内 524-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 52337056-52340158(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr01G004069 Chr01 NC_080387.1:59113587-59113594promoter 内 520-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 59110042-59110113(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr03G000277 Chr03 NC_080389.1:3161161-3161168promoter 内 520-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3155663-3157687(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGA
SmilChr03G004141 Chr03 NC_080389.1:60248981-60248988promoter 内 512-519 bp - 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 60243987-60245499(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC
SmilChr01G006195 Chr01 NC_080387.1:77567644-77567651promoter 内 509-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 77555537-77564159(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 GCACGTGT
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27633741-27633748promoter 内 509-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27621750-27630256(-) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 TCACGTGC
SmilChr04G003390 Chr04 NC_080390.1:50453464-50453471promoter 内 509-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 50456956-50458161(+) SMil_00001046-RA_Salv MP00034 ACACGTGC