转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00015812-RA_Salv SmilChr04G000094 YABBY XP_057807365.1 MP00620 CAATCATAAT

可能结合的靶基因

9844 个结合位点 6504 个候选靶基因 第 78 / 131 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000858 Chr01 NC_080387.1:18482858-18482867promoter 内 2215-2224 bp + 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 18484644-18491875(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G000017 Chr02 NC_080388.1:132197-132206promoter 内 2105-2114 bp - 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 128166-130310(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G003598 Chr02 NC_080388.1:57169468-57169477promoter 内 2022-2031 bp + 1970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 57171447-57173363(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr01G002480 Chr01 NC_080387.1:42537451-42537460promoter 内 1873-1882 bp - 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 42534282-42535332(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CGATCATAAT
SmilChr01G002520 Chr01 NC_080387.1:43153735-43153744promoter 内 1806-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 43155930-43159761(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G001264 Chr02 NC_080388.1:23170809-23170818promoter 内 1326-1335 bp + 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 23173484-23176757(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr03G000673 Chr03 NC_080389.1:7535497-7535506promoter 内 1269-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 7529801-7532774(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr03G000814 Chr03 NC_080389.1:9318973-9318982promoter 内 1257-1266 bp - 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 9309624-9316238(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr03G001044 Chr03 NC_080389.1:12158221-12158230promoter 内 808-817 bp - 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 12161414-12166396(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G004765 Chr02 NC_080388.1:69840419-69840428promoter 内 464-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 69834281-69836891(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G001081 Chr02 NC_080388.1:19345001-19345010promoter 内 400-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 19348602-19354614(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G003217 Chr02 NC_080388.1:53335295-53335304promoter 内 357-366 bp + 3635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 53338939-53349356(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr03G000698 Chr03 NC_080389.1:7805586-7805595promoter 内 321-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 7787199-7801915(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G006108 Chr01 NC_080387.1:76621158-76621167promoter 内 235-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 76624924-76625847(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G000761 Chr02 NC_080388.1:12414711-12414720promoter 内 150-159 bp + 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 12409898-12410869(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G004341 Chr02 NC_080388.1:65672491-65672500promoter 内 3901-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 65669848-65672400(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G003170 Chr01 NC_080387.1:50504180-50504189promoter 内 3706-3715 bp + 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 50497360-50503894(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G004575 Chr02 NC_080388.1:68250700-68250709promoter 内 3664-3673 bp + 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 68251037-68253803(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr03G000701 Chr03 NC_080389.1:7837279-7837288promoter 内 3603-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 7837677-7840036(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G004981 Chr01 NC_080387.1:67858911-67858920promoter 内 3574-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 67855820-67858493(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATCG
SmilChr03G000842 Chr03 NC_080389.1:9612214-9612223promoter 内 3546-3555 bp - 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 9612669-9613799(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G000809 Chr01 NC_080387.1:17475372-17475381promoter 内 3453-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 17474079-17474833(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G003595 Chr01 NC_080387.1:54510560-54510569promoter 内 3447-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 54509322-54510015(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G001725 Chr01 NC_080387.1:31781395-31781404promoter 内 3445-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 31781951-31786771(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G000530 Chr01 NC_080387.1:10838266-10838275promoter 内 3440-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 10834673-10837714(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G003365 Chr01 NC_080387.1:52397946-52397955promoter 内 3187-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 52389794-52397141(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G004777 Chr01 NC_080387.1:65953177-65953186promoter 内 3159-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 65947874-65952344(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr03G000204 Chr03 NC_080389.1:2302365-2302374promoter 内 3120-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 2303246-2315523(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G001554 Chr02 NC_080388.1:28831151-28831160promoter 内 3078-3087 bp + 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 28829675-28830237(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G001943 Chr02 NC_080388.1:35058990-35058999promoter 内 3075-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 35059916-35063956(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr01G001320 Chr01 NC_080387.1:26227297-26227306promoter 内 3004-3013 bp - 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 26228294-26230613(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G001861 Chr02 NC_080388.1:33840412-33840421promoter 内 2985-2994 bp + 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 33829141-33839405(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G001104 Chr01 NC_080387.1:22612499-22612508promoter 内 2716-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 22613784-22615277(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G000357 Chr02 NC_080388.1:4604387-4604396promoter 内 2708-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 4601080-4603103(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CGATCATAAT
SmilChr01G000392 Chr01 NC_080387.1:8062063-8062072promoter 内 2698-2707 bp - 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 8063366-8067583(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G002971 Chr01 NC_080387.1:48648689-48648698promoter 内 2607-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 48642797-48647304(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr01G004930 Chr01 NC_080387.1:67367987-67367996promoter 内 2599-2608 bp - 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 67365644-67366594(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G004615 Chr02 NC_080388.1:68663592-68663601promoter 内 2596-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 68664997-68666698(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G004613 Chr02 NC_080388.1:68652977-68652986promoter 内 2547-2556 bp - 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 68654431-68662893(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATCG
SmilChr01G002972 Chr01 NC_080387.1:48648689-48648698promoter 内 2494-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 48650196-48653457(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G001038 Chr01 NC_080387.1:21605815-21605824promoter 内 2485-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 21607331-21608758(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATCG
SmilChr03G000470 Chr03 NC_080389.1:5025486-5025495promoter 内 2313-2322 bp + 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 5020320-5023807(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G004612 Chr02 NC_080388.1:68652977-68652986promoter 内 2284-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 68633935-68651269(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CGATCATAAT
SmilChr02G000111 Chr02 NC_080388.1:1405546-1405555promoter 内 2263-2272 bp - 1729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 1407284-1409535(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr01G005597 Chr01 NC_080387.1:72590928-72590937promoter 内 2241-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 72585811-72589177(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CGATCATAAT
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22005173-22005182promoter 内 2150-2159 bp + 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 22007024-22012627(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr02G000309 Chr02 NC_080388.1:3892008-3892017promoter 内 2114-2123 bp + 1878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 3893895-3896873(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr03G000432 Chr03 NC_080389.1:4680456-4680465promoter 内 2040-2049 bp - 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 4682417-4684700(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG
SmilChr02G002784 Chr02 NC_080388.1:47918816-47918825promoter 内 2017-2026 bp + 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 47920800-47924013(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CAATCATACT
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46058414-46058423promoter 内 1919-1928 bp + 2073 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 46051009-46056341(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 AGTATGATTG