转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003745; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007655-RA_Salv SmilChr04G003745 C2H2 XP_057809144.1 MP00416 TGTAGTAG

可能结合的靶基因

9716 个结合位点 6433 个候选靶基因 第 79 / 129 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003639 Chr02 NC_080388.1:57747726-57747733promoter 内 2802-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 57745816-57746534(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr03G000515 Chr03 NC_080389.1:5554351-5554358promoter 内 2797-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 5555555-5563630(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G002919 Chr01 NC_080387.1:47912649-47912656promoter 内 2795-2802 bp - 1199 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 47909113-47911450(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G005499 Chr01 NC_080387.1:71882144-71882151promoter 内 2786-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 71883359-71887955(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr03G000543 Chr03 NC_080389.1:5891186-5891193promoter 内 2786-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 5892401-5893673(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G000505 Chr01 NC_080387.1:10225782-10225789promoter 内 2776-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 10222400-10224564(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69652977-69652984promoter 内 2773-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 69654205-69656876(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G000129 Chr01 NC_080387.1:2192325-2192332promoter 内 2766-2773 bp - 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 2188602-2191097(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G000236 Chr02 NC_080388.1:3018501-3018508promoter 内 2757-2764 bp + 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 3016743-3017264(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G005220 Chr02 NC_080388.1:73407925-73407932promoter 内 2757-2764 bp - 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 73404859-73406688(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G004374 Chr02 NC_080388.1:66098217-66098224promoter 内 2754-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 66099464-66100314(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G002692 Chr01 NC_080387.1:45164601-45164608promoter 内 2753-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 45162758-45163360(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G003876 Chr02 NC_080388.1:60815630-60815637promoter 内 2753-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 60812787-60814389(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G001044 Chr02 NC_080388.1:18507671-18507678promoter 内 2741-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 18501069-18506418(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G000631 Chr02 NC_080388.1:9503612-9503619promoter 内 2736-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 9504877-9508027(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G000507 Chr02 NC_080388.1:6977717-6977724promoter 内 2732-2739 bp - 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 6975700-6976455(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G004153 Chr01 NC_080387.1:60054544-60054551promoter 内 2724-2731 bp + 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 60051287-60053274(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G000627 Chr02 NC_080388.1:9366658-9366665promoter 内 2714-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 9367945-9370806(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G003818 Chr02 NC_080388.1:59810195-59810202promoter 内 2714-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 59811482-59814508(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G004994 Chr02 NC_080388.1:71789518-71789525promoter 内 2707-2714 bp - 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 71784979-71788231(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G000866 Chr02 NC_080388.1:14903716-14903723promoter 内 2706-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 14905011-14905097(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G004521 Chr01 NC_080387.1:63322300-63322307promoter 内 2703-2710 bp + 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 63319523-63321009(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G005693 Chr01 NC_080387.1:73210596-73210603promoter 内 2702-2709 bp + 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 73205725-73209304(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G004367 Chr02 NC_080388.1:65963232-65963239promoter 内 2702-2709 bp - 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 65964531-65967999(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G003187 Chr01 NC_080387.1:50622021-50622028promoter 内 2699-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 50614422-50620726(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G004995 Chr02 NC_080388.1:71789518-71789525promoter 内 2697-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 71790822-71795274(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G003866 Chr02 NC_080388.1:60627543-60627550promoter 内 2695-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 60628849-60633566(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G000912 Chr02 NC_080388.1:15779655-15779662promoter 内 2692-2699 bp + 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 15778015-15778353(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G001161 Chr02 NC_080388.1:21191600-21191607promoter 内 2692-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 21192909-21193247(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G001256 Chr02 NC_080388.1:23072922-23072929promoter 内 2692-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 23074231-23074569(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G004370 Chr02 NC_080388.1:66024426-66024433promoter 内 2692-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 66025735-66034194(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G002031 Chr02 NC_080388.1:36559252-36559259promoter 内 2691-2698 bp - 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 36560562-36561959(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G000778 Chr02 NC_080388.1:12735410-12735417promoter 内 2690-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 12732393-12734106(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G000712 Chr02 NC_080388.1:11481370-11481377promoter 内 2685-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 11478624-11480061(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G003313 Chr01 NC_080387.1:51845808-51845815promoter 内 2681-2688 bp + 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 51847128-51853630(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G005698 Chr01 NC_080387.1:73243102-73243109promoter 内 2679-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 73244424-73246790(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G005426 Chr01 NC_080387.1:71447443-71447450promoter 内 2666-2673 bp + 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 71443087-71446115(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G001078 Chr01 NC_080387.1:22220978-22220985promoter 内 2665-2672 bp + 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 22215795-22219649(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G002807 Chr01 NC_080387.1:46615191-46615198promoter 内 2661-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 46616531-46620668(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G000408 Chr02 NC_080388.1:5048644-5048651promoter 内 2660-2667 bp - 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 5049985-5053905(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G004927 Chr01 NC_080387.1:67338259-67338266promoter 内 2649-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 67339611-67342046(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G003654 Chr02 NC_080388.1:57938001-57938008promoter 内 2649-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 57933954-57936656(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G004350 Chr01 NC_080387.1:61699218-61699225promoter 内 2648-2655 bp - 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 61700571-61709022(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr01G001647 Chr01 NC_080387.1:30533906-30533913promoter 内 2646-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 30530273-30532558(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G001489 Chr02 NC_080388.1:27860795-27860802promoter 内 2644-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 27862152-27864242(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA
SmilChr02G005403 Chr02 NC_080388.1:74572421-74572428promoter 内 2644-2651 bp + 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 74573778-74575362(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G001655 Chr02 NC_080388.1:30722536-30722543promoter 内 2637-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 30718008-30721179(-) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr02G004040 Chr02 NC_080388.1:62715913-62715920promoter 内 2632-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 62717282-62719057(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr03G000211 Chr03 NC_080389.1:2453158-2453165promoter 内 2627-2634 bp + 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 2454532-2455616(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TGTAGTAA
SmilChr01G002623 Chr01 NC_080387.1:44502848-44502855promoter 内 2616-2623 bp - 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 44504233-44507820(+) SMil_00007655-RA_Salv MP00416 TTACTACA