转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 80 / 143 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003009 Chr02 NC_080388.1:50725352-50725363promoter 内 633-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50718824-50721995(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAG
SmilChr04G002079 Chr04 NC_080390.1:33573966-33573977promoter 内 607-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 33561589-33570583(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAG
SmilChr01G000314 Chr01 NC_080387.1:6061619-6061630promoter 内 606-617 bp + 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6065014-6066013(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr01G000035 Chr01 NC_080387.1:568541-568552promoter 内 584-595 bp + 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 571958-572815(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr07G003194 Chr07 NC_080393.1:34072671-34072682promoter 内 570-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 34068249-34069251(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr02G000057 Chr02 NC_080388.1:742014-742025promoter 内 558-569 bp + 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 745457-746379(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr03G001610 Chr03 NC_080389.1:20496547-20496558promoter 内 532-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20492099-20493089(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr03G004565 Chr03 NC_080389.1:63576429-63576440promoter 内 498-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63579932-63587672(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGAA
SmilChr07G002638 Chr07 NC_080393.1:25487088-25487099promoter 内 469-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 25481993-25483567(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAG
SmilChr08G001917 Chr08 NC_080394.1:16696884-16696895promoter 内 368-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16700517-16703097(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGT
SmilChr01G004507 Chr01 NC_080387.1:63164968-63164979promoter 内 362-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63168607-63170690(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGT
SmilChr08G002135 Chr08 NC_080394.1:19232182-19232193promoter 内 319-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19235864-19239439(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCTC
SmilChr02G004006 Chr02 NC_080388.1:62403691-62403702promoter 内 302-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62398858-62400003(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGT
SmilChr06G001681 Chr06 NC_080392.1:19069493-19069504promoter 内 290-301 bp + 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19073204-19074525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTG
SmilChr07G001261 Chr07 NC_080393.1:9699729-9699740promoter 内 217-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9703513-9705460(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGAA
SmilChr01G001909 Chr01 NC_080387.1:34214134-34214145promoter 内 2681-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 34211136-34212825(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr03G001912 Chr03 NC_080389.1:26751292-26751303promoter 内 1814-1825 bp - 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 26746183-26749116(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr06G001960 Chr06 NC_080392.1:24424537-24424548promoter 内 661-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 24427877-24428932(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGTG
SmilChr02G003443 Chr02 NC_080388.1:55707011-55707022promoter 内 3519-3530 bp - 471 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 55704768-55706540(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr02G003620 Chr02 NC_080388.1:57496781-57496792promoter 内 3393-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 57494061-57496184(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTCCAGCTGTT
SmilChr07G004316 Chr07 NC_080393.1:55714806-55714817promoter 内 3388-3399 bp - 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 55715419-55716357(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGACA
SmilChr05G004265 Chr05 NC_080391.1:56444119-56444130promoter 内 3278-3289 bp - 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 56439176-56443407(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGG
SmilChr05G003595 Chr05 NC_080391.1:48044454-48044465promoter 内 3211-3222 bp - 779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 48039962-48043675(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr05G003391 Chr05 NC_080391.1:44950523-44950534promoter 内 3069-3080 bp - 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 44947761-44949602(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTACCAGCTGTA
SmilChr03G003199 Chr03 NC_080389.1:49533603-49533614promoter 内 2721-2732 bp - 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 49534883-49535998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr07G002063 Chr07 NC_080393.1:18763684-18763695promoter 内 2468-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 18765217-18768201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTACCAGCTGTA
SmilChr07G001911 Chr07 NC_080393.1:16521880-16521891promoter 内 2419-2430 bp - 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 16523462-16524907(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGTAA
SmilChr05G000677 Chr05 NC_080391.1:5175327-5175338promoter 内 2327-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 5171907-5173664(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGGG
SmilChr03G003224 Chr03 NC_080389.1:49907439-49907450promoter 内 1720-1731 bp - 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 49909720-49910844(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr06G001913 Chr06 NC_080392.1:23103040-23103051promoter 内 1385-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 23096867-23100435(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCAAGCTGTA
SmilChr05G004266 Chr05 NC_080391.1:56444119-56444130promoter 内 952-963 bp - 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 56447168-56448442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTC
SmilChr05G000676 Chr05 NC_080391.1:5175327-5175338promoter 内 478-489 bp - 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 5168610-5171815(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGGG
SmilChr02G003184 Chr02 NC_080388.1:52982334-52982345promoter 内 88-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 52986247-52990483(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGC
SmilChr01G005168 Chr01 NC_080387.1:69453017-69453028promoter 内 77-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 69445743-69449104(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTCCAGCTGTT
SmilChr04G003693 Chr04 NC_080390.1:53317494-53317505promoter 内 26-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 53321469-53322858(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr08G000546 Chr08 NC_080394.1:3985817-3985828promoter 内 3988-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3980065-3985815(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGGA
SmilChr02G004075 Chr02 NC_080388.1:63048666-63048677promoter 内 3917-3928 bp - 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63048750-63053190(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAA
SmilChr04G003221 Chr04 NC_080390.1:49026316-49026327promoter 内 3911-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49024132-49026237(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr06G000250 Chr06 NC_080392.1:1664148-1664159promoter 内 3904-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1663164-1664062(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr04G002996 Chr04 NC_080390.1:46369743-46369754promoter 内 3890-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46369854-46371935(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr05G004162 Chr05 NC_080391.1:55512717-55512728promoter 内 3886-3897 bp + 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55512832-55512903(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr05G002316 Chr05 NC_080391.1:24985053-24985064promoter 内 3867-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24985187-24986854(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGG
SmilChr05G003206 Chr05 NC_080391.1:41091098-41091109promoter 内 3829-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 41088434-41090937(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAA
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73209349-73209360promoter 内 3808-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 73208114-73209167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr08G000547 Chr08 NC_080394.1:3985817-3985828promoter 内 3794-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3986024-3990023(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr06G002233 Chr06 NC_080392.1:31563127-31563138promoter 内 3654-3665 bp + 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31558196-31562791(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr03G002983 Chr03 NC_080389.1:46648064-46648075promoter 内 3277-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46642713-46647351(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAC
SmilChr07G002030 Chr07 NC_080393.1:18341016-18341027promoter 内 3256-3267 bp - 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18341761-18345562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr04G001140 Chr04 NC_080390.1:16805692-16805703promoter 内 3227-3238 bp + 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16806466-16807584(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr02G001258 Chr02 NC_080388.1:23083503-23083514promoter 内 3125-3136 bp - 865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 23079644-23082638(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA