转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 80 / 151 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002123 Chr01 NC_080387.1:37230839-37230851promoter 内 3364-3376 bp - 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37227166-37230214(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr03G000551 Chr03 NC_080389.1:5968141-5968153promoter 内 3344-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5968798-5987336(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAT
SmilChr03G002391 Chr03 NC_080389.1:37858997-37859009promoter 内 3318-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37857943-37858326(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTTTAGGTAAG
SmilChr02G003897 Chr02 NC_080388.1:61055504-61055516promoter 内 3313-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61056192-61058680(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G004694 Chr02 NC_080388.1:69287116-69287128promoter 内 3308-3320 bp - 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69287809-69295931(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G003474 Chr03 NC_080389.1:53268614-53268626promoter 内 3285-3297 bp + 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53269330-53273731(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr04G000136 Chr04 NC_080390.1:1165292-1165304promoter 内 3281-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1166012-1167714(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G001042 Chr01 NC_080387.1:21650115-21650127promoter 内 3239-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21649024-21649365(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTACG
SmilChr05G001674 Chr05 NC_080391.1:15869789-15869801promoter 内 3232-3244 bp - 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15866135-15869032(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr05G000388 Chr05 NC_080391.1:2919941-2919953promoter 内 3195-3207 bp + 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2915053-2919147(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAT
SmilChr01G005513 Chr01 NC_080387.1:71964368-71964380promoter 内 3176-3188 bp + 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 71965193-71969166(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCAAA
SmilChr02G005103 Chr02 NC_080388.1:72574393-72574405promoter 内 3165-3177 bp - 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 72570454-72573569(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCACA
SmilChr04G003114 Chr04 NC_080390.1:47698995-47699007promoter 内 3145-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 47699851-47702672(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G005376 Chr01 NC_080387.1:70986269-70986281promoter 内 3130-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 70980715-70985410(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGTTAGGTAAT
SmilChr02G004546 Chr02 NC_080388.1:68014460-68014472promoter 内 3093-3105 bp - 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 68015368-68019629(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G001177 Chr03 NC_080389.1:13524145-13524157promoter 内 3077-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13525069-13537051(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G002981 Chr03 NC_080389.1:46631588-46631600promoter 内 3073-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46632516-46636803(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G003458 Chr04 NC_080390.1:51063593-51063605promoter 内 3059-3071 bp + 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51059169-51062663(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTTGTAGGTAAA
SmilChr01G001351 Chr01 NC_080387.1:26787859-26787871promoter 内 2970-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26788890-26794211(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGATAGGTAAG
SmilChr03G001278 Chr03 NC_080389.1:14968614-14968626promoter 内 2956-2968 bp + 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14969659-14969730(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTACCTACCTCC
SmilChr03G004525 Chr03 NC_080389.1:63302309-63302321promoter 内 2938-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63300237-63301258(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACCA
SmilChr05G000463 Chr05 NC_080391.1:3506546-3506558promoter 内 2905-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3507642-3508662(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTGTT
SmilChr03G004454 Chr03 NC_080389.1:62656687-62656699promoter 内 2854-2866 bp - 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62654128-62655552(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCAGA
SmilChr02G002645 Chr02 NC_080388.1:45844110-45844122promoter 内 2816-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 45839201-45842937(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCCA
SmilChr05G001406 Chr05 NC_080391.1:12631241-12631253promoter 内 2745-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12632497-12639177(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr03G000677 Chr03 NC_080389.1:7555880-7555892promoter 内 2694-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7557187-7558956(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCCA
SmilChr01G000707 Chr01 NC_080387.1:15845917-15845929promoter 内 2631-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15847287-15848716(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGAGTAGGTATG
SmilChr03G000526 Chr03 NC_080389.1:5639496-5639508promoter 内 2619-2631 bp - 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5640878-5642924(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGAGTAGGTAAT
SmilChr02G005104 Chr02 NC_080388.1:72574393-72574405promoter 内 2600-2612 bp - 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 72575794-72578957(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGTC
SmilChr01G004352 Chr01 NC_080387.1:61721432-61721444promoter 内 2589-2601 bp - 1400 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61717133-61720032(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACAAAT
SmilChr04G003554 Chr04 NC_080390.1:51931984-51931996promoter 内 2585-2597 bp + 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51933400-51936993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAGAC
SmilChr04G000124 Chr04 NC_080390.1:1059404-1059416promoter 内 2577-2589 bp + 1412 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1057497-1057992(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCATTAGGTAAC
SmilChr05G001803 Chr05 NC_080391.1:17813161-17813173promoter 内 2547-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 17814615-17816936(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G004697 Chr03 NC_080389.1:64308509-64308521promoter 内 2527-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64305673-64307047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G000749 Chr03 NC_080389.1:8566324-8566336promoter 内 2520-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8567805-8568735(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTCCC
SmilChr03G000178 Chr03 NC_080389.1:1920212-1920224promoter 内 2495-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1921718-1923415(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGCCTACCTCT
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SmilChr03G000609 Chr03 NC_080389.1:6728063-6728075promoter 内 2480-2492 bp + 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6729584-6730950(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr02G004607 Chr02 NC_080388.1:68568116-68568128promoter 内 2457-2469 bp - 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 68569660-68579495(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G002601 Chr01 NC_080387.1:44196687-44196699promoter 内 2431-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44194342-44195129(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G001350 Chr01 NC_080387.1:26787859-26787871promoter 内 2397-2409 bp - 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26782969-26786267(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATCTTC
SmilChr02G005471 Chr02 NC_080388.1:74981224-74981236promoter 内 2344-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74977964-74979579(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G005054 Chr02 NC_080388.1:72249903-72249915promoter 内 2310-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 72251594-72258458(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGTTGAG
SmilChr05G000858 Chr05 NC_080391.1:6784413-6784425promoter 内 2294-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6776998-6782718(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G004113 Chr01 NC_080387.1:59651431-59651443promoter 内 2266-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 59653166-59658647(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCAAA
SmilChr03G002980 Chr03 NC_080389.1:46631588-46631600promoter 内 2215-2227 bp - 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46626245-46629814(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
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SmilChr04G000557 Chr04 NC_080390.1:6230345-6230357promoter 内 2154-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6225676-6228510(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGTGTAGGTAAA
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SmilChr03G003728 Chr03 NC_080389.1:56305735-56305747promoter 内 2103-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 56300804-56303849(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA