转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 81 / 153 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006030 Chr01 NC_080387.1:75848288-75848297promoter 内 1429-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 75845074-75845725(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G003807 Chr02 NC_080388.1:59686911-59686920promoter 内 1015-1024 bp + 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 59689897-59692100(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G002285 Chr03 NC_080389.1:36034457-36034466promoter 内 293-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 36027752-36030758(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr01G003057 Chr01 NC_080387.1:49478687-49478696promoter 内 3823-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49477247-49478518(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr03G002718 Chr03 NC_080389.1:43202432-43202441promoter 内 3775-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43200851-43202215(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G001087 Chr02 NC_080388.1:19496549-19496558promoter 内 3722-3731 bp + 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19496828-19501964(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G000442 Chr03 NC_080389.1:4749442-4749451promoter 内 3699-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4748217-4749149(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G004177 Chr02 NC_080388.1:64062392-64062401promoter 内 3516-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64059365-64061916(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G004933 Chr02 NC_080388.1:71313516-71313525promoter 内 3473-3482 bp + 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71314044-71314942(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G003462 Chr02 NC_080388.1:55912229-55912238promoter 内 3472-3481 bp - 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55907528-55911709(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74138674-74138683promoter 内 3457-3466 bp + 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74139218-74141307(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G000165 Chr02 NC_080388.1:2142301-2142310promoter 内 3231-3240 bp - 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2136748-2141540(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G002702 Chr01 NC_080387.1:45293429-45293438promoter 内 3222-3231 bp + 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 45294208-45295405(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G002675 Chr03 NC_080389.1:42464222-42464231promoter 内 3121-3130 bp + 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42462635-42463351(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr03G003364 Chr03 NC_080389.1:51987791-51987800promoter 内 3038-3047 bp - 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51988754-51991630(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G001606 Chr04 NC_080390.1:26758091-26758100promoter 内 3019-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26759073-26762234(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G004570 Chr03 NC_080389.1:63617433-63617442promoter 内 2878-2887 bp + 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 63611297-63616319(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G002298 Chr04 NC_080390.1:37238609-37238618promoter 内 2841-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37230755-37237458(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr01G000054 Chr01 NC_080387.1:850052-850061promoter 内 2782-2791 bp + 1210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 851271-853373(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G003058 Chr01 NC_080387.1:49478687-49478696promoter 内 2673-2682 bp + 1319 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49480015-49481680(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G002064 Chr02 NC_080388.1:37203192-37203201promoter 内 2650-2659 bp - 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37199198-37201850(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G002876 Chr02 NC_080388.1:49007249-49007258promoter 内 2409-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49008841-49014202(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G003994 Chr02 NC_080388.1:62279323-62279332promoter 内 2351-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 62259906-62277682(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74138674-74138683promoter 内 2123-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74130223-74136805(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G002221 Chr02 NC_080388.1:39486638-39486647promoter 内 2115-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 39488524-39489384(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G000180 Chr01 NC_080387.1:3044387-3044396promoter 内 2044-2053 bp - 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3040681-3042439(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19267712-19267721promoter 内 1955-1964 bp + 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19261872-19265675(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr01G006168 Chr01 NC_080387.1:77172792-77172801promoter 内 1924-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 77167156-77170724(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G004369 Chr02 NC_080388.1:66014364-66014373promoter 内 1850-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66010727-66012222(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G002874 Chr02 NC_080388.1:48999183-48999192promoter 内 1755-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 48993750-48996946(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G005950 Chr01 NC_080387.1:75223088-75223097promoter 内 1698-1707 bp - 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75218721-75220794(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr04G002210 Chr04 NC_080390.1:35766545-35766554promoter 内 1589-1598 bp - 2403 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 35768957-35769506(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr02G000171 Chr02 NC_080388.1:2193018-2193027promoter 内 1291-1300 bp - 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2189883-2190317(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr01G005974 Chr01 NC_080387.1:75400936-75400945promoter 内 1230-1239 bp - 2762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75403707-75413345(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G001722 Chr04 NC_080390.1:28486366-28486375promoter 内 1228-1237 bp + 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28482472-28483602(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G001723 Chr04 NC_080390.1:28486366-28486375promoter 内 1085-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28489282-28493169(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr05G002302 Chr05 NC_080391.1:24878961-24878970promoter 内 1025-1034 bp - 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24871215-24875994(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr04G002781 Chr04 NC_080390.1:43612887-43612896promoter 内 1002-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43608121-43609897(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr04G000752 Chr04 NC_080390.1:9228663-9228672promoter 内 903-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9217409-9225574(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G000440 Chr03 NC_080389.1:4743131-4743140promoter 内 804-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4739170-4739943(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr01G005815 Chr01 NC_080387.1:74138674-74138683promoter 内 781-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74141894-74144092(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G002674 Chr03 NC_080389.1:42464222-42464231promoter 内 638-647 bp + 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42453681-42460868(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G001191 Chr04 NC_080390.1:18240806-18240815promoter 内 478-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 18236463-18237292(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G003067 Chr03 NC_080389.1:47640688-47640697promoter 内 406-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 47636658-47637102(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr03G003066 Chr03 NC_080389.1:47631142-47631151promoter 内 364-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 47634779-47636650(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G000457 Chr03 NC_080389.1:4873370-4873379promoter 内 168-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4865793-4869546(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr05G002328 Chr05 NC_080391.1:25130348-25130357promoter 内 133-142 bp + 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 25134216-25139725(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G004931 Chr02 NC_080388.1:71313516-71313525promoter 内 131-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71307922-71309655(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr04G002353 Chr04 NC_080390.1:38005099-38005108promoter 内 32-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 38009068-38024714(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G004950 Chr02 NC_080388.1:71442447-71442456promoter 内 1993-2002 bp - 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 71444455-71450469(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT