转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 82 / 149 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002370 Chr07 NC_080393.1:22007435-22007445promoter 内 1060-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22010376-22013975(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr01G005443 Chr01 NC_080387.1:71525148-71525158promoter 内 1039-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71528110-71529022(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCC
SmilChr01G002168 Chr01 NC_080387.1:37768067-37768077promoter 内 1027-1037 bp - 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37763587-37765103(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAG
SmilChr07G002913 Chr07 NC_080393.1:29529827-29529837promoter 内 991-1001 bp - 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29522730-29526827(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr05G003950 Chr05 NC_080391.1:53250174-53250184promoter 内 899-909 bp - 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53245626-53247082(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr07G002915 Chr07 NC_080393.1:29549251-29549261promoter 内 891-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29541950-29546151(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr06G000529 Chr06 NC_080392.1:4334969-4334979promoter 内 874-884 bp - 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4338096-4341021(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr07G001318 Chr07 NC_080393.1:10125616-10125626promoter 内 864-874 bp - 3127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10128753-10129457(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr01G000973 Chr01 NC_080387.1:20587481-20587491promoter 内 807-817 bp + 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20590675-20594808(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAG
SmilChr06G000008 Chr06 NC_080392.1:192163-192173promoter 内 737-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 186090-188909(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr01G003930 Chr01 NC_080387.1:57584915-57584925promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57588184-57590043(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr06G000525 Chr06 NC_080392.1:4313298-4313308promoter 内 693-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4316606-4319297(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr05G003773 Chr05 NC_080391.1:51094618-51094628promoter 内 670-680 bp + 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 51097949-51098654(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr02G005430 Chr02 NC_080388.1:74738421-74738431promoter 内 604-614 bp + 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74733230-74735034(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr03G003202 Chr03 NC_080389.1:49578701-49578711promoter 内 601-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49573389-49575311(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr04G004113 Chr04 NC_080390.1:56048382-56048392promoter 内 592-602 bp - 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56043982-56044983(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAGGCTGTCA
SmilChr02G002328 Chr02 NC_080388.1:40963814-40963824promoter 内 554-564 bp - 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40967261-40967923(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr03G002748 Chr03 NC_080389.1:43668545-43668555promoter 内 541-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 43672005-43674888(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAGGCTGTCA
SmilChr05G000676 Chr05 NC_080391.1:5175327-5175337promoter 内 479-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 5168610-5171815(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr07G002746 Chr07 NC_080393.1:26987551-26987561promoter 内 436-446 bp + 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 26981319-26983996(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr06G001223 Chr06 NC_080392.1:12636072-12636082promoter 内 413-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12626675-12632494(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr01G005730 Chr01 NC_080387.1:73436864-73436874promoter 内 380-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 73440485-73444604(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr01G002877 Chr01 NC_080387.1:47353135-47353145promoter 内 349-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 47356787-47358080(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr05G003265 Chr05 NC_080391.1:42256779-42256789promoter 内 331-341 bp + 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42251856-42253119(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71525148-71525158promoter 内 288-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71519011-71521445(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGC
SmilChr05G003833 Chr05 NC_080391.1:51752898-51752908promoter 内 272-282 bp - 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 51756627-51759971(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr06G001635 Chr06 NC_080392.1:18321577-18321587promoter 内 272-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18325306-18330759(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr03G001010 Chr03 NC_080389.1:11597556-11597566promoter 内 168-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 11601389-11604315(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr06G002510 Chr06 NC_080392.1:35998087-35998097promoter 内 125-135 bp - 3866 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35991334-35994221(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr07G001356 Chr07 NC_080393.1:10516184-10516194promoter 内 74-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10520111-10523911(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr06G002451 Chr06 NC_080392.1:35280535-35280545promoter 内 69-79 bp - 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35284467-35287006(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr02G004693 Chr02 NC_080388.1:69273494-69273504promoter 内 65-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 69277430-69280513(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr01G005335 Chr01 NC_080387.1:70566557-70566567promoter 内 41-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 70558421-70562607(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr01G000717 Chr01 NC_080387.1:16069205-16069215promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16060426-16065244(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAGGCTGTCA
SmilChr01G002141 Chr01 NC_080387.1:37405755-37405765promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37398801-37401770(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAGGCTGTCA
SmilChr03G000872 Chr03 NC_080389.1:9908768-9908778promoter 内 3921-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 9908848-9909798(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAG
SmilChr03G002740 Chr03 NC_080389.1:43540658-43540668promoter 内 18-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 43544641-43544747(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr02G005423 Chr02 NC_080388.1:74699834-74699844promoter 内 3732-3742 bp + 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 74698809-74699575(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr02G000924 Chr02 NC_080388.1:16071817-16071827promoter 内 2607-2617 bp + 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 16069378-16070433(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr01G004867 Chr01 NC_080387.1:66795204-66795214promoter 内 2487-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 66790523-66793700(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAG
SmilChr06G001960 Chr06 NC_080392.1:24426292-24426302promoter 内 2416-2426 bp - 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 24427877-24428932(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr02G000925 Chr02 NC_080388.1:16071817-16071827promoter 内 2170-2180 bp + 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 16073648-16081123(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAG
SmilChr04G001003 Chr04 NC_080390.1:13910174-13910184promoter 内 1031-1041 bp + 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 13913144-13913735(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAG
SmilChr02G002413 Chr02 NC_080388.1:42098096-42098106promoter 内 804-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 42101293-42101960(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr02G000923 Chr02 NC_080388.1:16071817-16071827promoter 内 700-710 bp + 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 16067831-16068526(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr05G003321 Chr05 NC_080391.1:43512628-43512638promoter 内 380-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 43508425-43509017(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr01G000959 Chr01 NC_080387.1:20311571-20311581promoter 内 219-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 20307693-20307799(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr07G000685 Chr07 NC_080393.1:4667346-4667356promoter 内 200-210 bp - 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 4671147-4671253(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr02G000742 Chr02 NC_080388.1:11994660-11994670promoter 内 189-199 bp - 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 11998472-11998578(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr02G000440 Chr02 NC_080388.1:5724674-5724684promoter 内 182-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 5720759-5720865(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA