转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 84 / 136 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000754 Chr02 NC_080388.1:12290146-12290156promoter 内 568-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 12283657-12286723(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr05G002283 Chr05 NC_080391.1:24577615-24577625promoter 内 566-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 24581050-24585870(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCAGC
SmilChr02G001547 Chr02 NC_080388.1:28761328-28761338promoter 内 479-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 28764850-28769645(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr03G001630 Chr03 NC_080389.1:21001019-21001029promoter 内 472-482 bp - 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 20995491-20997500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr08G004066 Chr08 NC_080394.1:49309910-49309920promoter 内 459-469 bp + 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49301029-49306378(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr05G004098 Chr05 NC_080391.1:54840714-54840724promoter 内 392-402 bp + 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54836572-54837115(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCT
SmilChr08G001356 Chr08 NC_080394.1:10867578-10867588promoter 内 315-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10871264-10871337(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr01G002912 Chr01 NC_080387.1:47848731-47848741promoter 内 303-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47841294-47845043(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr08G000036 Chr08 NC_080394.1:256644-256654promoter 内 296-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 250768-252949(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr02G005333 Chr02 NC_080388.1:74153757-74153767promoter 内 278-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74157480-74162524(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr08G004098 Chr08 NC_080394.1:49683849-49683859promoter 内 245-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49674927-49680103(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr01G003257 Chr01 NC_080387.1:51266353-51266363promoter 内 184-194 bp - 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51270170-51273124(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr05G003693 Chr05 NC_080391.1:50048514-50048524promoter 内 158-168 bp - 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50052357-50055013(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr02G000269 Chr02 NC_080388.1:3471989-3471999promoter 内 86-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3475904-3479548(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr04G004171 Chr04 NC_080390.1:56346316-56346326promoter 内 50-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56350267-56352957(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCG
SmilChr08G001357 Chr08 NC_080394.1:10867578-10867588promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10871549-10871622(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr06G002034 Chr06 NC_080392.1:26532788-26532798promoter 内 2729-2739 bp + 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 26531420-26531526(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr05G002985 Chr05 NC_080391.1:36399149-36399159promoter 内 2650-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 36400500-36402530(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr08G002600 Chr08 NC_080394.1:25358330-25358340promoter 内 2324-2334 bp - 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 25342824-25356663(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG
SmilChr03G003004 Chr03 NC_080389.1:46888638-46888648promoter 内 1975-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 46886538-46886622(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr05G004338 Chr05 NC_080391.1:57037948-57037958promoter 内 1839-1849 bp - 2152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 57040110-57045175(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr01G003682 Chr01 NC_080387.1:55216271-55216281promoter 内 663-673 bp - 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 55219609-55220499(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr01G002314 Chr01 NC_080387.1:40129327-40129337promoter 内 129-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 40123925-40125465(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G004513 Chr08 NC_080394.1:54760569-54760579promoter 内 3938-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54758847-54760516(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr03G003881 Chr03 NC_080389.1:57902860-57902870promoter 内 3874-3884 bp - 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57900534-57902743(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr07G000843 Chr07 NC_080393.1:6008712-6008722promoter 内 3690-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6009023-6013361(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr08G000680 Chr08 NC_080394.1:5061142-5061152promoter 内 3645-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5056418-5060796(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr06G001796 Chr06 NC_080392.1:21071831-21071841promoter 内 3589-3599 bp + 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21068920-21071429(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr01G000670 Chr01 NC_080387.1:14836148-14836158promoter 内 3581-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14835325-14835738(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr01G003278 Chr01 NC_080387.1:51484281-51484291promoter 内 3576-3586 bp + 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51484706-51486552(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr01G000548 Chr01 NC_080387.1:11346726-11346736promoter 内 3549-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11347178-11347583(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr05G003925 Chr05 NC_080391.1:53001814-53001824promoter 内 3380-3390 bp - 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53002435-53003423(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G004512 Chr08 NC_080394.1:54753281-54753291promoter 内 3379-3389 bp - 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54751428-54752669(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr08G002322 Chr08 NC_080394.1:21882255-21882265promoter 内 3356-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21877303-21881620(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr06G001845 Chr06 NC_080392.1:21713327-21713337promoter 内 3300-3310 bp + 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21714028-21715165(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr07G000838 Chr07 NC_080393.1:5970588-5970598promoter 内 3288-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5967315-5969885(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr01G005763 Chr01 NC_080387.1:73740993-73741003promoter 内 3257-3267 bp - 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73730030-73740259(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr02G004366 Chr02 NC_080388.1:65949204-65949214promoter 内 3203-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 65950002-65951101(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G002720 Chr08 NC_080394.1:26830551-26830561promoter 内 3203-3213 bp + 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26831349-26834139(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCA
SmilChr05G003154 Chr05 NC_080391.1:40294634-40294644promoter 内 3188-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 40292169-40293831(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGT
SmilChr01G000110 Chr01 NC_080387.1:1866463-1866473promoter 内 3131-3141 bp - 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1867333-1868857(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr05G000526 Chr05 NC_080391.1:4035354-4035364promoter 内 3109-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4031826-4034472(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr05G000529 Chr05 NC_080391.1:4061714-4061724promoter 内 3109-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4058226-4060832(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr04G002710 Chr04 NC_080390.1:42719927-42719937promoter 内 3105-3115 bp + 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42716097-42719041(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGT
SmilChr03G000047 Chr03 NC_080389.1:503220-503230promoter 内 2928-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 499352-502157(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCA
SmilChr06G002196 Chr06 NC_080392.1:30511391-30511401promoter 内 2870-2880 bp - 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30512522-30513542(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr05G003454 Chr05 NC_080391.1:45941448-45941458promoter 内 2750-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 45937513-45940207(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCA
SmilChr04G002337 Chr04 NC_080390.1:37703580-37703590promoter 内 2645-2655 bp - 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37704936-37707034(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr08G004953 Chr08 NC_080394.1:58383037-58383047promoter 内 2643-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58377994-58381689(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr04G001872 Chr04 NC_080390.1:30540614-30540624promoter 内 2637-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30541978-30544066(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG