转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 86 / 143 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002690 Chr08 NC_080394.1:26498392-26498403promoter 内 2409-2420 bp + 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 26499984-26502617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATA
SmilChr01G000425 Chr01 NC_080387.1:8523915-8523926promoter 内 2385-2396 bp + 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8514196-8522310(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr04G000063 Chr04 NC_080390.1:577607-577618promoter 内 2380-2391 bp - 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 571834-575997(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGT
SmilChr06G000456 Chr06 NC_080392.1:3679651-3679662promoter 内 2365-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3681287-3682208(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA
SmilChr05G003919 Chr05 NC_080391.1:52947493-52947504promoter 内 2323-2334 bp - 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52949171-52957577(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAG
SmilChr07G002240 Chr07 NC_080393.1:20574821-20574832promoter 内 2273-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20576549-20578780(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr02G004316 Chr02 NC_080388.1:65495690-65495701promoter 内 2250-2261 bp + 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65484708-65493950(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA
SmilChr02G003202 Chr02 NC_080388.1:53174505-53174516promoter 内 2212-2223 bp - 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53172149-53172727(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr08G001650 Chr08 NC_080394.1:13707814-13707825promoter 内 2198-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13709617-13710488(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAA
SmilChr01G004580 Chr01 NC_080387.1:63845645-63845656promoter 内 2160-2171 bp + 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 63847486-63849430(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTATT
SmilChr05G000242 Chr05 NC_080391.1:1847967-1847978promoter 内 2147-2158 bp - 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1849821-1852238(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr04G003624 Chr04 NC_080390.1:52733225-52733236promoter 内 2118-2129 bp + 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52727709-52731353(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr07G003324 Chr07 NC_080393.1:35482444-35482455promoter 内 2101-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35480028-35480555(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr07G000980 Chr07 NC_080393.1:7124973-7124984promoter 内 2099-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7126875-7132382(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA
SmilChr08G001649 Chr08 NC_080394.1:13707814-13707825promoter 内 1971-1982 bp - 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13704497-13705795(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCAAGCTGTA
SmilChr01G006060 Chr01 NC_080387.1:76050390-76050401promoter 内 1945-1956 bp + 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 76046944-76048345(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTT
SmilChr02G000706 Chr02 NC_080388.1:11354644-11354655promoter 内 1939-1950 bp - 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11351622-11352593(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G000394 Chr03 NC_080389.1:4312899-4312910promoter 内 1934-1945 bp + 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4314966-4315644(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr03G000838 Chr03 NC_080389.1:9584855-9584866promoter 内 1850-1861 bp + 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9587006-9587775(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr03G000459 Chr03 NC_080389.1:4907942-4907953promoter 内 1747-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4902541-4905699(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTC
SmilChr08G000227 Chr08 NC_080394.1:1538573-1538584promoter 内 1745-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1533942-1536328(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr04G000814 Chr04 NC_080390.1:10208420-10208431promoter 内 1737-1748 bp - 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10205237-10206167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G001120 Chr03 NC_080389.1:12909628-12909639promoter 内 1642-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12905877-12907280(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G003672 Chr05 NC_080391.1:49715451-49715462promoter 内 1633-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49710826-49713094(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G000662 Chr05 NC_080391.1:5013359-5013370promoter 内 1585-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5009800-5010954(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr04G000249 Chr04 NC_080390.1:2267857-2267868promoter 内 1570-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2242715-2265437(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCAAGCTGTA
SmilChr03G002078 Chr03 NC_080389.1:31895047-31895058promoter 内 1554-1565 bp + 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31897494-31903418(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G004496 Chr01 NC_080387.1:63070145-63070156promoter 内 1549-1560 bp + 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 63072597-63075081(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGGG
SmilChr05G002265 Chr05 NC_080391.1:24364762-24364773promoter 内 1531-1542 bp - 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24357252-24362303(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGAG
SmilChr04G001232 Chr04 NC_080390.1:19345809-19345820promoter 内 1497-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19348313-19348991(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G003610 Chr01 NC_080387.1:54649878-54649889promoter 内 1460-1471 bp + 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54652419-54653295(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G004329 Chr05 NC_080391.1:56949269-56949280promoter 内 1442-1453 bp - 2548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56944503-56946721(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr06G002400 Chr06 NC_080392.1:34776364-34776375promoter 内 1410-1421 bp - 2580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34773005-34773784(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATA
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36096868-36096879promoter 内 1407-1418 bp - 2583 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36091412-36094285(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr04G001769 Chr04 NC_080390.1:29090059-29090070promoter 内 1351-1362 bp - 2639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29082302-29087420(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G002488 Chr02 NC_080388.1:43297148-43297159promoter 内 1330-1341 bp - 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43299819-43300526(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr04G003567 Chr04 NC_080390.1:52046627-52046638promoter 内 1209-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52049419-52053391(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr03G001021 Chr03 NC_080389.1:11817964-11817975promoter 内 1199-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11814058-11815173(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G004503 Chr01 NC_080387.1:63136542-63136553promoter 内 1198-1209 bp - 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 63129544-63133750(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr02G002992 Chr02 NC_080388.1:50590017-50590028promoter 内 1189-1200 bp - 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50592829-50601363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr07G004734 Chr07 NC_080393.1:60194115-60194126promoter 内 1100-1111 bp + 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60197016-60199824(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTA
SmilChr04G001305 Chr04 NC_080390.1:20769177-20769188promoter 内 1089-1100 bp - 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20765037-20766276(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G003635 Chr01 NC_080387.1:54868868-54868879promoter 内 1078-1089 bp + 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54865129-54865956(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76050390-76050401promoter 内 1073-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 76053318-76053403(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATA
SmilChr01G001082 Chr01 NC_080387.1:22234637-22234648promoter 内 1070-1081 bp + 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22237568-22244887(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr03G000004 Chr03 NC_080389.1:52513-52524promoter 内 1059-1070 bp + 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 48274-49582(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr08G002850 Chr08 NC_080394.1:28347124-28347135promoter 内 1046-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28342571-28344180(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr07G004291 Chr07 NC_080393.1:55467314-55467325promoter 内 1011-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55470304-55471509(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G002959 Chr03 NC_080389.1:46359407-46359418promoter 内 1010-1021 bp + 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 46354258-46356427(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTG
SmilChr01G001221 Chr01 NC_080387.1:24486115-24486126promoter 内 1009-1020 bp - 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24480972-24483134(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCAAGCTGTA