转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 89 / 137 下载 TSV

上一页 89 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000372 Chr04 NC_080390.1:3758204-3758218promoter 内 1340-1354 bp - 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3754391-3755557(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr04G002277 Chr04 NC_080390.1:36997450-36997464promoter 内 1334-1348 bp - 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37000117-37006529(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCACTCACGTGGCA
SmilChr01G000267 Chr01 NC_080387.1:5140281-5140295promoter 内 1293-1307 bp + 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5142989-5143845(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr07G004343 Chr07 NC_080393.1:55973988-55974002promoter 内 1214-1228 bp - 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55970074-55971215(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G000642 Chr03 NC_080389.1:7074737-7074751promoter 内 1211-1225 bp + 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7077527-7080412(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr04G000344 Chr04 NC_080390.1:3167925-3167939promoter 内 1121-1135 bp - 2866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3164241-3165059(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G002938 Chr03 NC_080389.1:46111741-46111755promoter 内 1102-1116 bp - 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46107894-46108856(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr07G004553 Chr07 NC_080393.1:58258840-58258854promoter 内 1024-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58261817-58266994(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr02G000327 Chr02 NC_080388.1:4134720-4134734promoter 内 979-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4130655-4131712(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr07G002761 Chr07 NC_080393.1:27459621-27459635promoter 内 957-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27455068-27456591(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCTAAGACGTGGCA
SmilChr02G003903 Chr02 NC_080388.1:61111392-61111406promoter 内 951-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61114442-61115851(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCGGCGGG
SmilChr01G002178 Chr01 NC_080387.1:37867479-37867493promoter 内 894-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37862410-37864386(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCACTCACGTGGCA
SmilChr01G000910 Chr01 NC_080387.1:19169773-19169787promoter 内 822-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19172952-19173816(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr01G003997 Chr01 NC_080387.1:58370260-58370274promoter 内 809-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58373452-58375694(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAAAACC
SmilChr02G005053 Chr02 NC_080388.1:72236286-72236300promoter 内 800-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 72239487-72242550(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGGTTCC
SmilChr01G003226 Chr01 NC_080387.1:51036582-51036596promoter 内 795-809 bp - 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51030576-51033390(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAGTGGG
SmilChr02G000739 Chr02 NC_080388.1:11978706-11978720promoter 内 778-792 bp - 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11981929-11982861(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AACTCCCACGTGGCT
SmilChr03G002568 Chr03 NC_080389.1:40875277-40875291promoter 内 699-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 40871282-40871989(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAATATGACGTGGAG
SmilChr06G001110 Chr06 NC_080392.1:11215584-11215598promoter 内 695-709 bp - 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11208802-11212292(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAAACAAA
SmilChr06G001126 Chr06 NC_080392.1:11326974-11326988promoter 内 689-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11319824-11323676(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAAACAAA
SmilChr06G002269 Chr06 NC_080392.1:32411094-32411108promoter 内 635-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32405128-32407742(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAGTGGG
SmilChr08G003321 Chr08 NC_080394.1:34470123-34470137promoter 内 612-626 bp - 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34473512-34474238(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCTCCCACGTGGCT
SmilChr04G001659 Chr04 NC_080390.1:27559863-27559877promoter 内 591-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27563273-27563987(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCTCCCACGTGGCT
SmilChr04G003263 Chr04 NC_080390.1:49363215-49363229promoter 内 579-593 bp - 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49359417-49359807(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCAGGA
SmilChr07G000860 Chr07 NC_080393.1:6123623-6123637promoter 内 554-568 bp - 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6115449-6120190(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAAGTG
SmilChr03G002281 Chr03 NC_080389.1:36001501-36001515promoter 内 499-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35996670-35998013(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAATATGACGTGGAG
SmilChr01G001794 Chr01 NC_080387.1:32809524-32809538promoter 内 489-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32813036-32817226(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr01G003994 Chr01 NC_080387.1:58370260-58370274promoter 内 466-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58363258-58366739(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTTTTGACGTGGAA
SmilChr04G003718 Chr04 NC_080390.1:53486894-53486908promoter 内 408-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53490487-53491750(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CACAATGACGTGGCA
SmilChr06G003082 Chr06 NC_080392.1:43692611-43692625promoter 内 407-421 bp - 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43696205-43697995(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCAGTAGACGTGGCC
SmilChr01G001641 Chr01 NC_080387.1:30452655-30452669promoter 内 389-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30445686-30449057(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAGTGCC
SmilChr03G000531 Chr03 NC_080389.1:5687618-5687632promoter 内 349-363 bp - 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5691270-5693390(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AACTCCCACGTGGCT
SmilChr01G002191 Chr01 NC_080387.1:38057809-38057823promoter 内 344-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38061466-38062409(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCTGACACGTGGCA
SmilChr07G001459 Chr07 NC_080393.1:11438574-11438588promoter 内 303-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11428063-11434890(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr08G001215 Chr08 NC_080394.1:9805942-9805956promoter 内 259-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9809684-9817763(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTCATCC
SmilChr08G002148 Chr08 NC_080394.1:19333860-19333874promoter 内 240-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19337621-19342460(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTTCAGACGTGGAA
SmilChr06G001442 Chr06 NC_080392.1:15263320-15263334promoter 内 231-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15254927-15259564(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr05G004330 Chr05 NC_080391.1:56981776-56981790promoter 内 186-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56985591-56986052(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr06G003041 Chr06 NC_080392.1:43268274-43268288promoter 内 158-172 bp - 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43261512-43264445(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTATCCAGC
SmilChr01G000276 Chr01 NC_080387.1:5463066-5463080promoter 内 127-141 bp + 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5466940-5467395(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGATGACA
SmilChr01G000286 Chr01 NC_080387.1:5644007-5644021promoter 内 119-133 bp - 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5636395-5640139(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAAGTG
SmilChr06G002542 Chr06 NC_080392.1:36463620-36463634promoter 内 94-108 bp - 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36458841-36459727(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G002433 Chr03 NC_080389.1:38626641-38626655promoter 内 82-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38630560-38633258(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr01G002617 Chr01 NC_080387.1:44458767-44458781promoter 内 73-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44448117-44454853(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G000852 Chr03 NC_080389.1:9740068-9740082promoter 内 62-76 bp - 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9733194-9736143(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G002483 Chr03 NC_080389.1:39471371-39471385promoter 内 39-53 bp + 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39466613-39467423(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAATATGACGTGGAG
SmilChr08G000840 Chr08 NC_080394.1:6215251-6215265promoter 内 7-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6219245-6221952(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAAGTG
SmilChr04G001624 Chr04 NC_080390.1:27003974-27003988promoter 内 3071-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 27004904-27011019(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCTGCAAA
SmilChr03G003141 Chr03 NC_080389.1:48629097-48629111promoter 内 2931-2945 bp - 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 48627339-48628041(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCTGCAAA
SmilChr04G003804 Chr04 NC_080390.1:54211850-54211864promoter 内 2474-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 54207914-54210337(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTGCAGACGTGGAC