转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 9 / 128 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000563 Chr01 NC_080387.1:11675306-11675317promoter 内 3322-3333 bp + 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 11675985-11676980(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr01G003944 Chr01 NC_080387.1:57770533-57770544promoter 内 3230-3241 bp + 760 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 57771304-57775906(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr01G003715 Chr01 NC_080387.1:55491367-55491378promoter 内 3174-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 55486465-55490551(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr03G001465 Chr03 NC_080389.1:17523283-17523294promoter 内 3081-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 17524203-17528286(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTC
SmilChr01G002923 Chr01 NC_080387.1:48016589-48016600promoter 内 2739-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 48005444-48015338(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCG
SmilChr02G002950 Chr02 NC_080388.1:50040454-50040465promoter 内 2474-2485 bp - 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 50038232-50038938(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGCA
SmilChr01G002506 Chr01 NC_080387.1:42941343-42941354promoter 内 2218-2229 bp - 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 42935463-42939571(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGCA
SmilChr03G000333 Chr03 NC_080389.1:3775568-3775579promoter 内 2068-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 3777501-3780755(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCC
SmilChr02G004818 Chr02 NC_080388.1:70315684-70315695promoter 内 2008-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 70312072-70313702(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGCA
SmilChr01G006042 Chr01 NC_080387.1:75949039-75949050promoter 内 1998-2009 bp - 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 75951042-75951501(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCC
SmilChr02G001548 Chr02 NC_080388.1:28772954-28772965promoter 内 1862-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 28775093-28778230(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTC
SmilChr01G005581 Chr01 NC_080387.1:72524262-72524273promoter 内 1779-1790 bp - 2211 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 72520570-72522051(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8242547-8242558promoter 内 1563-1574 bp - 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 8237862-8240120(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr01G004921 Chr01 NC_080387.1:67291835-67291846promoter 内 1540-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 67294296-67303027(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCG
SmilChr01G000653 Chr01 NC_080387.1:14520612-14520623promoter 内 1397-1408 bp + 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 14516943-14518019(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTCT
SmilChr02G003168 Chr02 NC_080388.1:52709030-52709041promoter 内 1356-1367 bp - 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 52703178-52706396(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGCA
SmilChr01G001775 Chr01 NC_080387.1:32655984-32655995promoter 内 1228-1239 bp - 2762 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 32658757-32659365(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTC
SmilChr01G003442 Chr01 NC_080387.1:52996215-52996226promoter 内 1015-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 52999201-53000232(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr01G000406 Chr01 NC_080387.1:8242547-8242558promoter 内 996-1007 bp - 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 8245552-8246573(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTCT
SmilChr01G001774 Chr01 NC_080387.1:32655984-32655995promoter 内 985-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 32650047-32652979(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGGA
SmilChr01G005588 Chr01 NC_080387.1:72559458-72559469promoter 内 959-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 72554953-72556427(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr01G000810 Chr01 NC_080387.1:17481560-17481571promoter 内 932-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 17484629-17485196(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr03G000811 Chr03 NC_080389.1:9291534-9291545promoter 内 904-915 bp - 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 9294631-9297653(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCC
SmilChr02G002399 Chr02 NC_080388.1:41875982-41875993promoter 内 811-822 bp - 3179 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 41879172-41880548(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTCT
SmilChr02G001184 Chr02 NC_080388.1:21760570-21760581promoter 内 758-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 21756307-21757338(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr02G001185 Chr02 NC_080388.1:21765992-21766003promoter 内 752-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 21761723-21762754(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr01G003716 Chr01 NC_080387.1:55491367-55491378promoter 内 642-653 bp - 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 55494726-55498773(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTCT
SmilChr01G000570 Chr01 NC_080387.1:11834474-11834485promoter 内 421-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 11838054-11840706(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
SmilChr02G001673 Chr02 NC_080388.1:30984338-30984349promoter 内 359-370 bp + 3631 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 30987980-30989248(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCG
SmilChr02G003268 Chr02 NC_080388.1:53937097-53937108promoter 内 275-286 bp - 3715 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 53940823-53941464(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCC
SmilChr02G005502 Chr02 NC_080388.1:75152253-75152264promoter 内 94-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 75156160-75159521(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr02G004128 Chr02 NC_080388.1:63522024-63522035promoter 内 3430-3441 bp - 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 63522595-63526785(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCC
SmilChr01G000998 Chr01 NC_080387.1:21015802-21015813promoter 内 3375-3386 bp - 615 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 21016428-21018133(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTC
SmilChr02G004127 Chr02 NC_080388.1:63522024-63522035promoter 内 3304-3315 bp - 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 63520369-63521338(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr02G002664 Chr02 NC_080388.1:46137982-46137993promoter 内 3230-3241 bp - 760 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 46134287-46137222(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGGA
SmilChr01G003797 Chr01 NC_080387.1:56355965-56355976promoter 内 3213-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 56350245-56355188(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTCT
SmilChr02G000442 Chr02 NC_080388.1:5753537-5753548promoter 内 3079-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 5754459-5756152(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAGCAGAGCA
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SmilChr02G004820 Chr02 NC_080388.1:70315684-70315695promoter 内 1004-1015 bp - 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 70318681-70323365(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCCT
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