转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 91 / 143 下载 TSV

上一页 91 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001594 Chr01 NC_080387.1:30006582-30006593promoter 内 1616-1627 bp - 2374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 30008967-30010165(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATA
SmilChr03G002955 Chr03 NC_080389.1:46303565-46303576promoter 内 3273-3284 bp + 717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 46304293-46307288(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTACCAGCTGTT
SmilChr05G001030 Chr05 NC_080391.1:8448010-8448021promoter 内 3114-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8448897-8455607(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTT
SmilChr03G004345 Chr03 NC_080389.1:61734305-61734316promoter 内 2722-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 61735584-61736510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCCA
SmilChr04G001754 Chr04 NC_080390.1:28865957-28865968promoter 内 2633-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 28860724-28864600(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGTT
SmilChr07G001136 Chr07 NC_080393.1:8525432-8525443promoter 内 2530-2541 bp + 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8526903-8530483(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTT
SmilChr05G004310 Chr05 NC_080391.1:56788393-56788404promoter 内 2467-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 56789927-56791321(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTG
SmilChr07G002027 Chr07 NC_080393.1:18270496-18270507promoter 内 2334-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 18272163-18273742(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGA
SmilChr07G002018 Chr07 NC_080393.1:18043358-18043369promoter 内 2254-2265 bp - 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 18045105-18046547(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGA
SmilChr03G003842 Chr03 NC_080389.1:57543993-57544004promoter 内 1807-1818 bp - 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 57546187-57552597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAA
SmilChr03G003837 Chr03 NC_080389.1:57517497-57517508promoter 内 1804-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 57519694-57522590(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAA
SmilChr03G004346 Chr03 NC_080389.1:61734305-61734316promoter 内 1646-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 61736660-61739767(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCCA
SmilChr03G003838 Chr03 NC_080389.1:57521389-57521400promoter 内 1591-1602 bp - 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 57523799-57526567(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAA
SmilChr03G003907 Chr03 NC_080389.1:58174843-58174854promoter 内 1377-1388 bp - 2613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 58166803-58172230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGTA
SmilChr03G003839 Chr03 NC_080389.1:57525393-57525404promoter 内 1340-1351 bp - 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 57528054-57530559(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAA
SmilChr01G004708 Chr01 NC_080387.1:65188055-65188066promoter 内 1318-1329 bp + 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 65183708-65185383(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATT
SmilChr01G000610 Chr01 NC_080387.1:13495811-13495822promoter 内 1242-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 13489710-13493063(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATT
SmilChr01G005615 Chr01 NC_080387.1:72667877-72667888promoter 内 1198-1209 bp + 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 72670680-72671653(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTT
SmilChr03G002527 Chr03 NC_080389.1:40307739-40307750promoter 内 1011-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 40310729-40315118(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr01G002854 Chr01 NC_080387.1:47131542-47131553promoter 内 934-945 bp + 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 47126960-47128486(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAA
SmilChr05G001987 Chr05 NC_080391.1:20567121-20567132promoter 内 807-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 20560208-20563938(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTACCAGCTGTT
SmilChr07G002363 Chr07 NC_080393.1:21945281-21945292promoter 内 514-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 21939340-21941805(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGGT
SmilChr01G002856 Chr01 NC_080387.1:47131542-47131553promoter 内 486-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 47135057-47139130(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTACCAGCTGTT
SmilChr07G003119 Chr07 NC_080393.1:33082492-33082503promoter 内 447-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33086046-33087588(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACC
SmilChr04G003547 Chr04 NC_080390.1:51814999-51815010promoter 内 284-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 51818716-51820269(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTG
SmilChr08G001015 Chr08 NC_080394.1:7679678-7679689promoter 内 150-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 7674227-7675838(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATA
SmilChr08G001053 Chr08 NC_080394.1:8057824-8057835promoter 内 118-129 bp + 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8052480-8053952(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATA
SmilChr02G001647 Chr02 NC_080388.1:30569650-30569661promoter 内 3902-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 30568957-30569562(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCTT
SmilChr01G005173 Chr01 NC_080387.1:69478511-69478522promoter 内 3874-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69476337-69478395(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTG
SmilChr03G002609 Chr03 NC_080389.1:41500383-41500394promoter 内 3801-3812 bp - 189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41500089-41500194(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr01G002452 Chr01 NC_080387.1:42123740-42123751promoter 内 3710-3721 bp + 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 42122634-42123460(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCTT
SmilChr02G005558 Chr02 NC_080388.1:75536672-75536683promoter 内 3641-3652 bp + 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75534486-75536323(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTATT
SmilChr07G001166 Chr07 NC_080393.1:8730652-8730663promoter 内 3377-3388 bp - 613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8724721-8730039(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr08G002576 Chr08 NC_080394.1:25097080-25097091promoter 内 3366-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25090823-25096456(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCA
SmilChr08G002061 Chr08 NC_080394.1:18935658-18935669promoter 内 3307-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18469001-18934975(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCA
SmilChr01G003647 Chr01 NC_080387.1:54948903-54948914promoter 内 3261-3272 bp + 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54949643-54949781(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr05G003674 Chr05 NC_080391.1:49721049-49721060promoter 内 3261-3272 bp + 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49721789-49721927(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr07G001200 Chr07 NC_080393.1:9117756-9117767promoter 内 3184-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9115439-9116950(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAG
SmilChr01G003648 Chr01 NC_080387.1:54953734-54953745promoter 内 2940-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54954795-54957194(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr08G001434 Chr08 NC_080394.1:11485034-11485045promoter 内 2829-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11482896-11483873(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATG
SmilChr07G003853 Chr07 NC_080393.1:47814727-47814738promoter 内 2777-2788 bp + 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47815951-47824199(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGGG
SmilChr07G000640 Chr07 NC_080393.1:4317209-4317220promoter 内 2700-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4312094-4315919(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCGA
SmilChr02G001958 Chr02 NC_080388.1:35342070-35342081promoter 内 2639-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 35343432-35344730(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAA
SmilChr05G003530 Chr05 NC_080391.1:47174951-47174962promoter 内 2609-2620 bp - 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47170546-47173570(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATT
SmilChr07G002843 Chr07 NC_080393.1:28549550-28549561promoter 内 2576-2587 bp - 1414 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 28541682-28548136(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCA
SmilChr03G001576 Chr03 NC_080389.1:19927887-19927898promoter 内 2421-2432 bp + 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19925517-19926318(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGA
SmilChr07G001365 Chr07 NC_080393.1:10577557-10577568promoter 内 2313-2324 bp - 1677 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10574150-10575880(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATT
SmilChr01G004962 Chr01 NC_080387.1:67708364-67708375promoter 内 2304-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67705505-67706678(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAG
SmilChr01G000456 Chr01 NC_080387.1:9329363-9329374promoter 内 2299-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9331065-9334016(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGTG
SmilChr03G001109 Chr03 NC_080389.1:12788224-12788235promoter 内 2189-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12790036-12791228(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGA