转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 93 / 136 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001521 Chr05 NC_080391.1:13935563-13935573promoter 内 1671-1681 bp + 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13931869-13933243(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTT
SmilChr07G003639 Chr07 NC_080393.1:43103096-43103106promoter 内 1658-1668 bp + 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 43105439-43106584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr04G002898 Chr04 NC_080390.1:45270308-45270318promoter 内 1647-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45266190-45267964(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr07G003878 Chr07 NC_080393.1:48361459-48361469promoter 内 1634-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48363826-48364910(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr02G002067 Chr02 NC_080388.1:37223008-37223018promoter 内 1615-1625 bp + 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 37220526-37220632(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr03G003199 Chr03 NC_080389.1:49532493-49532503promoter 内 1611-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 49534883-49535998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G001161 Chr04 NC_080390.1:17249681-17249691promoter 内 1524-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 17246738-17247214(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr05G004236 Chr05 NC_080391.1:56169633-56169643promoter 内 1474-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56172160-56179377(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr04G000260 Chr04 NC_080390.1:2386069-2386079promoter 内 1459-1469 bp + 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2382292-2383537(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTT
SmilChr08G001789 Chr08 NC_080394.1:15070591-15070601promoter 内 1442-1452 bp - 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15073150-15081456(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr05G003423 Chr05 NC_080391.1:45473323-45473333promoter 内 1425-1435 bp - 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45475899-45479829(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr07G003724 Chr07 NC_080393.1:45232097-45232107promoter 内 1333-1343 bp + 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45227140-45229439(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr03G003654 Chr03 NC_080389.1:55372707-55372717promoter 内 1320-1330 bp + 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55368761-55370036(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTT
SmilChr02G001718 Chr02 NC_080388.1:31629663-31629673promoter 内 1302-1312 bp + 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 31632362-31638322(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr08G000809 Chr08 NC_080394.1:5959430-5959440promoter 内 1256-1266 bp - 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5962175-5964349(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr05G003595 Chr05 NC_080391.1:48046505-48046515promoter 内 1161-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48039962-48043675(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGAC
SmilChr06G000786 Chr06 NC_080392.1:7378260-7378270promoter 内 956-966 bp + 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7381305-7391870(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr04G002900 Chr04 NC_080390.1:45270308-45270318promoter 内 931-941 bp - 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45273378-45273800(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr04G000834 Chr04 NC_080390.1:10473831-10473841promoter 内 903-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 10476929-10478260(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAT
SmilChr01G001329 Chr01 NC_080387.1:26460985-26460995promoter 内 900-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26464086-26473494(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr03G002068 Chr03 NC_080389.1:31588443-31588453promoter 内 893-903 bp - 3098 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 31585239-31585345(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr06G001387 Chr06 NC_080392.1:14514547-14514557promoter 内 850-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14517698-14520503(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G003649 Chr04 NC_080390.1:52994658-52994668promoter 内 847-857 bp - 3144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52989568-52991514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr04G002890 Chr04 NC_080390.1:45118532-45118542promoter 内 746-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45111525-45115287(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCT
SmilChr02G001584 Chr02 NC_080388.1:29590873-29590883promoter 内 745-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29587041-29587627(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCGCTGAGCC
SmilChr06G002735 Chr06 NC_080392.1:39607674-39607684promoter 内 694-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 39610981-39613445(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G003518 Chr04 NC_080390.1:51573950-51573960promoter 内 687-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51568977-51570646(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr04G000470 Chr04 NC_080390.1:5017286-5017296promoter 内 679-689 bp + 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5020608-5021363(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr08G002432 Chr08 NC_080394.1:23134425-23134435promoter 内 644-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23126437-23131078(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr03G001146 Chr03 NC_080389.1:13214901-13214911promoter 内 534-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13208625-13211444(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr04G003761 Chr04 NC_080390.1:53874408-53874418promoter 内 519-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53869789-53870936(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr02G002068 Chr02 NC_080388.1:37223008-37223018promoter 内 347-357 bp + 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 37226662-37228325(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr06G001348 Chr06 NC_080392.1:14038664-14038674promoter 内 333-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14042332-14044888(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr06G001388 Chr06 NC_080392.1:14514547-14514557promoter 内 327-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14518221-14518344(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr03G002555 Chr03 NC_080389.1:40723118-40723128promoter 内 268-278 bp - 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40726851-40729666(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr01G003823 Chr01 NC_080387.1:56556622-56556632promoter 内 266-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56560357-56560430(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G000259 Chr04 NC_080390.1:2386069-2386079promoter 内 80-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2377729-2382158(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTT
SmilChr08G002665 Chr08 NC_080394.1:26132338-26132348promoter 内 65-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26136274-26139487(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCT
SmilChr01G005346 Chr01 NC_080387.1:70702009-70702019promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 15 70702058-70714857(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr07G003235 Chr07 NC_080393.1:34318701-34318711promoter 内 3952-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 8 34314041-34318662(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr05G001134 Chr05 NC_080391.1:9472367-9472377promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 7 9472416-9475494(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr08G002190 Chr08 NC_080394.1:19782511-19782521promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 6 19782560-19787121(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr04G003423 Chr04 NC_080390.1:50824143-50824153promoter 内 424-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 6 50817578-50820576(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38735057-38735067promoter 内 17-27 bp - 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 6 38739041-38739967(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr06G001555 Chr06 NC_080392.1:16940335-16940345promoter 内 3640-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 16940696-16941259(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr07G001677 Chr07 NC_080393.1:14220718-14220728promoter 内 79-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 14216306-14216806(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr01G003514 Chr01 NC_080387.1:53751884-53751894promoter 内 3952-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 53751933-53757502(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr04G003689 Chr04 NC_080390.1:53295680-53295690promoter 内 2028-2038 bp - 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 53288763-53293717(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCA
SmilChr05G001038 Chr05 NC_080391.1:8510178-8510188promoter 内 1892-1902 bp + 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 8507386-8508079(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr02G003251 Chr02 NC_080388.1:53812394-53812404promoter 内 719-729 bp - 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 53804462-53809122(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC