Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 95 / 125 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004025 Chr02 NC_080388.1:62533779-62533798promoter 内 2357-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 62535423-62536604(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTCTTTTTGTCTTCACCAT
SmilChr02G005236 Chr02 NC_080388.1:73548747-73548766promoter 内 2321-2340 bp - 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 73550427-73555379(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GCTGCTTTTGTCCCTTCTAC
SmilChr02G003990 Chr02 NC_080388.1:62195047-62195066promoter 内 2319-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 62191665-62193384(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCAAAACAACAAAAAATGG
SmilChr01G002243 Chr01 NC_080387.1:38974864-38974883promoter 内 2290-2309 bp + 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 38966646-38973172(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATGCTTTTTGTCCCTCACCG
SmilChr01G001987 Chr01 NC_080387.1:35301083-35301102promoter 内 2233-2252 bp - 1749 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 35294455-35299334(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAAAAAAAAAAAAG
SmilChr01G001102 Chr01 NC_080387.1:22547687-22547706promoter 内 2231-2250 bp + 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 22549457-22555678(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAAAAAAAACAAAAAAATA
SmilChr02G003629 Chr02 NC_080388.1:57625125-57625144promoter 内 2206-2225 bp + 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 57622191-57623349(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCTCTTCGTCTTTTTTGC
SmilChr03G003133 Chr03 NC_080389.1:48557014-48557033promoter 内 2158-2177 bp + 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 48554101-48555190(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTGTTTTTGTTTTTCTTTT
SmilChr01G005005 Chr01 NC_080387.1:68103371-68103390promoter 内 2126-2145 bp - 1856 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 68105246-68107456(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTGTTACTCTCTTTTTCTT
SmilChr01G005559 Chr01 NC_080387.1:72410866-72410885promoter 内 2115-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 72406073-72408999(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCTCTTTTGTCGTTGTCGT
SmilChr01G004634 Chr01 NC_080387.1:64358360-64358379promoter 内 2064-2083 bp - 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 64360297-64367470(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGTATTTTTGTTTTCATCTG
SmilChr01G002053 Chr01 NC_080387.1:36323287-36323306promoter 内 2063-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 36325225-36326087(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGGGAAGACGA
SmilChr02G005091 Chr02 NC_080388.1:72499157-72499176promoter 内 2055-2074 bp - 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 72501103-72503096(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATCTCGTTTGTCTGCTTTTC
SmilChr01G003917 Chr01 NC_080387.1:57440796-57440815promoter 内 2043-2062 bp - 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 57442754-57447133(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTGTCATTTTGGG
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38737064-38737083promoter 内 2024-2043 bp - 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 38739041-38739967(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCTCCTTTGTCTCTACGGT
SmilChr02G004102 Chr02 NC_080388.1:63342271-63342290promoter 内 2004-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 63337866-63340293(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCTAGCTTTGTCTTTATTTA
SmilChr01G000130 Chr01 NC_080387.1:2192205-2192224promoter 内 1998-2017 bp + 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 2194208-2196236(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAGGAAGACAACAGAGAT
SmilChr01G005530 Chr01 NC_080387.1:72162665-72162684promoter 内 1996-2015 bp + 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 72157631-72160679(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCTCTTTTGTCGTTGTCGT
SmilChr02G003908 Chr02 NC_080388.1:61140749-61140768promoter 内 1942-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61134789-61138709(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTCCCCACCCC
SmilChr03G000758 Chr03 NC_080389.1:8644136-8644155promoter 内 1900-1919 bp - 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 8646237-8647566(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGTATTTTTGTTTTTCCCCC
SmilChr02G003968 Chr02 NC_080388.1:61826510-61826529promoter 内 1890-1909 bp + 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61823186-61824418(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTCTCTCTCTTCTTTTCTT
SmilChr02G003314 Chr02 NC_080388.1:54395358-54395377promoter 内 1882-1901 bp + 2100 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 54397477-54399615(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGAAGAGGGACAAAATTGGA
SmilChr01G003431 Chr01 NC_080387.1:52953629-52953648promoter 内 1865-1884 bp + 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 52949833-52951512(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATCATTTTTCTTTTTTTCTT
SmilChr03G001343 Chr03 NC_080389.1:15691618-15691637promoter 内 1822-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 15693797-15694388(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTGTTTTTGTTTTTCTTTT
SmilChr01G000386 Chr01 NC_080387.1:7971527-7971546promoter 内 1778-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 7966289-7969323(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACTTCTTTGTCTCGTACTT
SmilChr02G003114 Chr02 NC_080388.1:52136817-52136836promoter 内 1762-1781 bp - 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 52132638-52134597(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCAAAAAGAAAAAAGAAAG
SmilChr01G002775 Chr01 NC_080387.1:46200698-46200717promoter 内 1741-1760 bp + 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 46195111-46198457(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TATTTTCTTGTTTTTTTCTC
SmilChr03G003601 Chr03 NC_080389.1:54649160-54649179promoter 内 1725-1744 bp - 2257 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 54645464-54646903(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAACAAGAGAAAGGAA
SmilChr02G002490 Chr02 NC_080388.1:43315242-43315261promoter 内 1548-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 43317695-43323564(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATTAATTTTGTCTTGTTTTC
SmilChr02G003574 Chr02 NC_080388.1:56903015-56903034promoter 内 1533-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 56898632-56900566(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGGGAGTGACAAAAACACC
SmilChr01G003152 Chr01 NC_080387.1:50318272-50318291promoter 内 1532-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 50320741-50323708(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GCGTAAGGGAGAAAAAAAAA
SmilChr02G002454 Chr02 NC_080388.1:42819779-42819798promoter 内 1510-1529 bp + 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 42822270-42822856(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGGACGAGACAAAGAAGAA
SmilChr03G000181 Chr03 NC_080389.1:1946735-1946754promoter 内 1477-1496 bp - 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 1938732-1944230(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAAAAAAAAAAAAG
SmilChr03G001005 Chr03 NC_080389.1:11384221-11384240promoter 内 1456-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 11386766-11389946(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTGTCGCTGCCAC
SmilChr02G000046 Chr02 NC_080388.1:632313-632332promoter 内 1371-1390 bp + 2611 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 634943-638254(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGAAGCACGACAAAAGAACA
SmilChr02G002414 Chr02 NC_080388.1:42120682-42120701promoter 内 1338-1357 bp - 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 42113950-42118038(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAAATGC
SmilChr01G004895 Chr01 NC_080387.1:67036365-67036384promoter 内 1297-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 66999498-67033680(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAGAGACAAATCTGAC
SmilChr01G004821 Chr01 NC_080387.1:66393474-66393493promoter 内 1293-1312 bp + 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 66396182-66396252(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACAAAAAGAAAAAACAAAC
SmilChr02G003414 Chr02 NC_080388.1:55334432-55334451promoter 内 1286-1305 bp + 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 55337147-55338223(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAGAAAGAAAAAAAAG
SmilChr01G001101 Chr01 NC_080387.1:22527717-22527736promoter 内 1276-1295 bp + 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 22530442-22532019(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACAAAAAGAAAAAAATAAA
SmilChr01G004154 Chr01 NC_080387.1:60056748-60056767promoter 内 1264-1283 bp + 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 60059485-60062271(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAGAAAGACAGGCTGGAA
SmilChr02G003121 Chr02 NC_080388.1:52221393-52221412promoter 内 1262-1281 bp - 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 52224132-52225238(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCGCTCTGTT
SmilChr01G002523 Chr01 NC_080387.1:43193697-43193716promoter 内 1184-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 43196514-43200220(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAGAAAGAAAAAAAAG
SmilChr03G001740 Chr03 NC_080389.1:23495483-23495502promoter 内 1184-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 23490541-23492685(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCATTTTTTGTCAGTTCCTC
SmilChr03G000259 Chr03 NC_080389.1:3032970-3032989promoter 内 1083-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 3027048-3030071(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TATTTTTTTCTCCTTTTTTT
SmilChr03G002285 Chr03 NC_080389.1:36033722-36033741promoter 内 1018-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 36027752-36030758(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCCAGCCTGTCTTTCTCTC
SmilChr03G000500 Chr03 NC_080389.1:5369011-5369030promoter 内 1009-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 5365559-5366038(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAACAAAAAGAAT
SmilChr02G003980 Chr02 NC_080388.1:62057092-62057111promoter 内 1008-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 62060085-62064416(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAGAAAAGAAA
SmilChr03G002663 Chr03 NC_080389.1:42291193-42291212promoter 内 883-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 42294311-42297859(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAACAAAAACAAAAAAAGA
SmilChr03G000884 Chr03 NC_080389.1:10032026-10032045promoter 内 845-864 bp + 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 10025259-10028889(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTTTGCTTCTCTTTTTCCC