转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 97 / 139 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004868 Chr01 NC_080387.1:66802371-66802382promoter 内 1171-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 66794216-66799552(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTACA
SmilChr04G002668 Chr04 NC_080390.1:42062164-42062175promoter 内 1044-1055 bp + 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42065121-42068251(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTTGACGTGAC
SmilChr04G000288 Chr04 NC_080390.1:2688126-2688137promoter 内 975-986 bp - 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2685038-2685111(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGTA
SmilChr03G002567 Chr03 NC_080389.1:40855711-40855722promoter 内 935-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40858777-40859191(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTG
SmilChr03G002753 Chr03 NC_080389.1:43753293-43753304promoter 内 899-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43756395-43758734(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAGTGACGTGTC
SmilChr02G001143 Chr02 NC_080388.1:20727914-20727925promoter 内 772-783 bp - 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20718475-20724696(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTG
SmilChr04G001025 Chr04 NC_080390.1:14369897-14369908promoter 内 766-777 bp - 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14373132-14374220(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCC
SmilChr02G000987 Chr02 NC_080388.1:17360192-17360203promoter 内 724-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17363469-17366231(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGAAGACGTGGA
SmilChr02G000572 Chr02 NC_080388.1:8184378-8184389promoter 内 655-666 bp - 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8088579-8181043(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGTT
SmilChr03G003036 Chr03 NC_080389.1:47257010-47257021promoter 内 637-648 bp + 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47260374-47261035(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGAAGACGTGGA
SmilChr02G001090 Chr02 NC_080388.1:19614633-19614644promoter 内 613-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19610036-19611256(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTACA
SmilChr01G001251 Chr01 NC_080387.1:25129792-25129803promoter 内 550-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25133243-25133875(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATGG
SmilChr05G000268 Chr05 NC_080391.1:2057633-2057644promoter 内 466-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2036513-2054109(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGAAGACGTGGT
SmilChr02G001175 Chr02 NC_080388.1:21585584-21585595promoter 内 403-414 bp - 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21579250-21581997(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr01G003762 Chr01 NC_080387.1:56016823-56016834promoter 内 383-394 bp + 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56009360-56013216(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACAA
SmilChr02G005234 Chr02 NC_080388.1:73544254-73544265promoter 内 358-369 bp + 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73537900-73540622(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACGT
SmilChr04G004059 Chr04 NC_080390.1:55744404-55744415promoter 内 330-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55737166-55740744(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCGCACGTGGC
SmilChr01G000735 Chr01 NC_080387.1:16311320-16311331promoter 内 315-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16307539-16307645(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAACT
SmilChr01G000992 Chr01 NC_080387.1:20952660-20952671promoter 内 285-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20948335-20948955(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAACG
SmilChr01G000284 Chr01 NC_080387.1:5585485-5585496promoter 内 283-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5576383-5581778(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACTC
SmilChr02G002300 Chr02 NC_080388.1:40600348-40600359promoter 内 250-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40589959-40596608(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAACT
SmilChr01G003725 Chr01 NC_080387.1:55563359-55563370promoter 内 140-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55567220-55572343(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTTGACGTGTA
SmilChr01G000984 Chr01 NC_080387.1:20853500-20853511promoter 内 137-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20847482-20849647(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTACA
SmilChr03G000848 Chr03 NC_080389.1:9760276-9760287promoter 内 112-123 bp - 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9663105-9756398(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTT
SmilChr03G002079 Chr03 NC_080389.1:31908034-31908045promoter 内 102-113 bp + 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31911933-31916492(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGTT
SmilChr03G002093 Chr03 NC_080389.1:32285894-32285905promoter 内 74-85 bp - 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32276676-32281978(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr02G001130 Chr02 NC_080388.1:20438558-20438569promoter 内 2570-2581 bp + 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 20436674-20437138(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATCT
SmilChr02G004009 Chr02 NC_080388.1:62412266-62412277promoter 内 3272-3283 bp - 718 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 62412995-62417878(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAACA
SmilChr03G003267 Chr03 NC_080389.1:50600477-50600488promoter 内 3244-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 50592638-50599731(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATCGACGTGGC
SmilChr02G002895 Chr02 NC_080388.1:49222686-49222697promoter 内 2919-2930 bp - 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 49223768-49231532(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGAGA
SmilChr01G000577 Chr01 NC_080387.1:11990743-11990754promoter 内 2797-2808 bp - 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 11991947-11992411(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATCT
SmilChr03G001195 Chr03 NC_080389.1:13775388-13775399promoter 内 2796-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 13773730-13774194(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATCT
SmilChr01G004937 Chr01 NC_080387.1:67468914-67468925promoter 内 2472-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 67470443-67473691(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATCGACGTGGC
SmilChr01G000626 Chr01 NC_080387.1:14046337-14046348promoter 内 640-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 14042541-14042987(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTGA
SmilChr01G000916 Chr01 NC_080387.1:19385429-19385440promoter 内 320-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 19372169-19381759(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAACGACGTGGC
SmilChr04G003602 Chr04 NC_080390.1:52460311-52460322promoter 内 3930-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52453474-52460251(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGAG
SmilChr02G003344 Chr02 NC_080388.1:54666098-54666109promoter 内 3835-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54666264-54672497(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGAT
SmilChr03G000457 Chr03 NC_080389.1:4869855-4869866promoter 内 3681-3692 bp + 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4865793-4869546(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAT
SmilChr01G001132 Chr01 NC_080387.1:23009121-23009132promoter 内 3498-3509 bp - 492 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23009624-23010725(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATCT
SmilChr01G004995 Chr01 NC_080387.1:67995416-67995427promoter 内 3460-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 67990440-67994886(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATT
SmilChr03G000880 Chr03 NC_080389.1:9998178-9998189promoter 内 3361-3372 bp + 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9998818-10003304(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGAC
SmilChr01G004348 Chr01 NC_080387.1:61643552-61643563promoter 内 3251-3262 bp + 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61644302-61653705(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCGGACGTGGG
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SmilChr02G000533 Chr02 NC_080388.1:7364066-7364077promoter 内 2928-2939 bp - 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7365139-7366519(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGTC
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SmilChr02G000862 Chr02 NC_080388.1:14804919-14804930promoter 内 2786-2797 bp - 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 14806134-14806589(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATCT
SmilChr02G002985 Chr02 NC_080388.1:50471894-50471905promoter 内 2757-2768 bp - 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50473138-50474582(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCACCA
SmilChr01G000574 Chr01 NC_080387.1:11914981-11914992promoter 内 2612-2623 bp + 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 11916370-11919874(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCACGACGTGGA
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